RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558773.1

MFGE8-208, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 3

Gene MFGE8, Length 534 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-208ENST00000558773 H7C1D1 291 aa25.76■■□□□ 1.71
MFGE8-208ENST00000558773 ANP32CO43423 234 aa25.76■■□□□ 1.71
MFGE8-208ENST00000558773 ECE2O60344 883 aa25.76■■□□□ 1.71
MFGE8-208ENST00000558773 SLC4A2P04920 1241 aa25.76■■□□□ 1.71
MFGE8-208ENST00000558773 DOK7Q18PE1 504 aa25.76■■□□□ 1.71
MFGE8-208ENST00000558773 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
MFGE8-208ENST00000558773 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
MFGE8-208ENST00000558773 RTL9Q8NET4 1388 aa25.75■■□□□ 1.71
MFGE8-208ENST00000558773 MICALL2Q8IY33 904 aa25.75■■□□□ 1.71
MFGE8-208ENST00000558773 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
MFGE8-208ENST00000558773 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
MFGE8-208ENST00000558773 TLL2Q9Y6L7 1015 aa25.75■■□□□ 1.71
MFGE8-208ENST00000558773 RPS12P25398 132 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
MFGE8-208ENST00000558773 NEXNQ0ZGT2 675 aa25.74■■□□□ 1.71
MFGE8-208ENST00000558773 WDR63Q8IWG1 891 aa25.74■■□□□ 1.71
MFGE8-208ENST00000558773 TTLL11Q8NHH1 800 aa25.74■■□□□ 1.71
MFGE8-208ENST00000558773 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa25.74■■□□□ 1.71
MFGE8-208ENST00000558773 NEURL1BA8MQ27 555 aa25.73■■□□□ 1.71
MFGE8-208ENST00000558773 UFL1O94874 794 aa25.73■■□□□ 1.71
MFGE8-208ENST00000558773 CTSWP56202 376 aa25.73■■□□□ 1.71
MFGE8-208ENST00000558773 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
MFGE8-208ENST00000558773 CDC37L1Q7L3B6 337 aa25.73■■□□□ 1.71
MFGE8-208ENST00000558773 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa25.73■■□□□ 1.71
MFGE8-208ENST00000558773 PRDM10Q9NQV6 1147 aa25.73■■□□□ 1.71
MFGE8-208ENST00000558773 GGA1Q9UJY5 639 aa25.73■■□□□ 1.71
MFGE8-208ENST00000558773 FANCIQ9NVI1 1328 aa25.72■■□□□ 1.71
MFGE8-208ENST00000558773 H7C1W4 665 aa25.72■■□□□ 1.71
MFGE8-208ENST00000558773 AIDAQ96BJ3 306 aa25.72■■□□□ 1.71
MFGE8-208ENST00000558773 VIL1P09327 827 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
MFGE8-208ENST00000558773 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
MFGE8-208ENST00000558773 SAMD7Q7Z3H4 446 aa25.71■■□□□ 1.71
MFGE8-208ENST00000558773 CAPNS2Q96L46 248 aa25.71■■□□□ 1.71
MFGE8-208ENST00000558773 SCN9AQ15858 1988 aa25.71■■□□□ 1.71
MFGE8-208ENST00000558773 XDHP47989 1333 aa25.7■■□□□ 1.71
MFGE8-208ENST00000558773 VAMP4O75379 141 aa25.7■■□□□ 1.7
MFGE8-208ENST00000558773 CELF2O95319 508 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
MFGE8-208ENST00000558773 ECE1P42892 770 aa25.7■■□□□ 1.7
MFGE8-208ENST00000558773 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
MFGE8-208ENST00000558773 SAPCD2Q86UD0 394 aa25.7■■□□□ 1.7
MFGE8-208ENST00000558773 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
MFGE8-208ENST00000558773 THSD7BQ9C0I4 1608 aa25.7■■□□□ 1.7
MFGE8-208ENST00000558773 EGFRP00533 1210 aa25.69■■□□□ 1.7
MFGE8-208ENST00000558773 FLIIQ13045 1269 aa25.69■■□□□ 1.7
MFGE8-208ENST00000558773 CYP4F22Q6NT55 531 aa25.69■■□□□ 1.7
MFGE8-208ENST00000558773 ATP2B4P23634 1241 aa25.68■■□□□ 1.7
MFGE8-208ENST00000558773 GCKRQ14397 625 aa25.68■■□□□ 1.7
MFGE8-208ENST00000558773 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
MFGE8-208ENST00000558773 HHIPL1Q96JK4 782 aa25.68■■□□□ 1.7
MFGE8-208ENST00000558773 GREM2Q9H772 168 aa25.68■■□□□ 1.7
MFGE8-208ENST00000558773 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
MFGE8-208ENST00000558773 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
MFGE8-208ENST00000558773 MYH3P11055 1940 aa25.68■■□□□ 1.7
MFGE8-208ENST00000558773 PLA2G12BQ9BX93 195 aa25.67■■□□□ 1.7
MFGE8-208ENST00000558773 CACNA1FO60840 1977 aa25.67■■□□□ 1.7
MFGE8-208ENST00000558773 ZNF609O15014 1411 aa25.66■■□□□ 1.7
MFGE8-208ENST00000558773 G3V3G9 751 aa25.66■■□□□ 1.7
MFGE8-208ENST00000558773 CASP7P55210 303 aa25.66■■□□□ 1.7
MFGE8-208ENST00000558773 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
MFGE8-208ENST00000558773 DCAF8Q5TAQ9 597 aa25.66■■□□□ 1.7
MFGE8-208ENST00000558773 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa25.66■■□□□ 1.7
MFGE8-208ENST00000558773 USP48Q86UV5 1035 aa25.66■■□□□ 1.7
MFGE8-208ENST00000558773 MINPP1Q9UNW1 487 aa25.66■■□□□ 1.7
MFGE8-208ENST00000558773 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
MFGE8-208ENST00000558773 DNAAF4Q8WXU2 420 aa25.65■■□□□ 1.7
MFGE8-208ENST00000558773 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
MFGE8-208ENST00000558773 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
MFGE8-208ENST00000558773 MAP2K2P36507 400 aa25.64■■□□□ 1.7
MFGE8-208ENST00000558773 LBX1P52954 281 aa25.64■■□□□ 1.7
MFGE8-208ENST00000558773 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
MFGE8-208ENST00000558773 LINS1Q8NG48 757 aa25.64■■□□□ 1.7
MFGE8-208ENST00000558773 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
MFGE8-208ENST00000558773 PSME4Q14997 1843 aa25.63■■□□□ 1.69
MFGE8-208ENST00000558773 CSF1RP07333 972 aa25.63■■□□□ 1.69
MFGE8-208ENST00000558773 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
MFGE8-208ENST00000558773 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
MFGE8-208ENST00000558773 DLK2Q6UY11 383 aa25.63■■□□□ 1.69
MFGE8-208ENST00000558773 PODNQ7Z5L7 613 aa25.63■■□□□ 1.69
MFGE8-208ENST00000558773 AGBL3Q8NEM8 1001 aa25.63■■□□□ 1.69
MFGE8-208ENST00000558773 GMLQ99445 158 aa25.63■■□□□ 1.69
MFGE8-208ENST00000558773 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
MFGE8-208ENST00000558773 MYH16Q9H6N6 1097 aa25.62■■□□□ 1.69
MFGE8-208ENST00000558773 ZNF408Q9H9D4 720 aa25.62■■□□□ 1.69
MFGE8-208ENST00000558773 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
MFGE8-208ENST00000558773 MED23Q9ULK4 1368 aa25.61■■□□□ 1.69
MFGE8-208ENST00000558773 AOC2O75106 756 aa25.61■■□□□ 1.69
MFGE8-208ENST00000558773 CAPN15O75808 1086 aa25.61■■□□□ 1.69
MFGE8-208ENST00000558773 CCT4P50991 539 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
MFGE8-208ENST00000558773 GRM1Q13255 1194 aa25.61■■□□□ 1.69
MFGE8-208ENST00000558773 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa25.61■■□□□ 1.69
MFGE8-208ENST00000558773 KRT26Q7Z3Y9 468 aa25.61■■□□□ 1.69
MFGE8-208ENST00000558773 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
MFGE8-208ENST00000558773 SPEF2Q9C093 1822 aa25.6■■□□□ 1.69
MFGE8-208ENST00000558773 USP17L3A6NCW0 530 aa25.59■■□□□ 1.69
MFGE8-208ENST00000558773 USP17L4A6NCW7 530 aa25.59■■□□□ 1.69
MFGE8-208ENST00000558773 USP17L1Q7RTZ2 530 aa25.59■■□□□ 1.69
MFGE8-208ENST00000558773 ITGA6P23229 1130 aa25.58■■□□□ 1.69
MFGE8-208ENST00000558773 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
MFGE8-208ENST00000558773 LEMD3Q9Y2U8 911 aa25.58■■□□□ 1.69
MFGE8-208ENST00000558773 ADM5C9JUS6 153 aa25.57■■□□□ 1.68
MFGE8-208ENST00000558773 FAM161AQ3B820 660 aa25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 191.9 ms