RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545464.5

MACROD1-208, Transcript of MACRO domain containing 1, human

TSL 3

Gene MACROD1, Length 899 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MACROD1-208	ENST00000545464	RUNDC1	Q96C34	613 aa		31.89	■■■□□ 2.7
MACROD1-208	ENST00000545464	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	31.88	■■■□□ 2.69
MACROD1-208	ENST00000545464	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	31.88	■■■□□ 2.69
MACROD1-208	ENST00000545464	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		31.88	■■■□□ 2.69
MACROD1-208	ENST00000545464	HYPK	Q9NX55	129 aa		31.88	■■■□□ 2.69
MACROD1-208	ENST00000545464	RTL9	Q8NET4	1388 aa		31.87	■■■□□ 2.69
MACROD1-208	ENST00000545464	HOXB7	P09629	217 aa		31.87	■■■□□ 2.69
MACROD1-208	ENST00000545464	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	31.87	■■■□□ 2.69
MACROD1-208	ENST00000545464	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	31.86	■■■□□ 2.69
MACROD1-208	ENST00000545464	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		31.86	■■■□□ 2.69
MACROD1-208	ENST00000545464	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		31.85	■■■□□ 2.69
MACROD1-208	ENST00000545464	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		31.85	■■■□□ 2.69
MACROD1-208	ENST00000545464	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		31.85	■■■□□ 2.69
MACROD1-208	ENST00000545464	COL4A1	P02462	1669 aa		31.85	■■■□□ 2.69
MACROD1-208	ENST00000545464	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	31.84	■■■□□ 2.69
MACROD1-208	ENST00000545464	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	31.84	■■■□□ 2.69
MACROD1-208	ENST00000545464	CCDC102A	Q96A19	550 aa		31.84	■■■□□ 2.69
MACROD1-208	ENST00000545464	UFL1	O94874	794 aa		31.83	■■■□□ 2.69
MACROD1-208	ENST00000545464	SLC34A2	O95436	690 aa		31.83	■■■□□ 2.69
MACROD1-208	ENST00000545464	SULF1	Q8IWU6	871 aa		31.83	■■■□□ 2.69
MACROD1-208	ENST00000545464	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		31.83	■■■□□ 2.69
MACROD1-208	ENST00000545464	GGA3	Q9NZ52	723 aa		31.83	■■■□□ 2.69
MACROD1-208	ENST00000545464	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	31.82	■■■□□ 2.68
MACROD1-208	ENST00000545464	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	31.81	■■■□□ 2.68
MACROD1-208	ENST00000545464	GOLGA2	Q08379	1002 aa		31.81	■■■□□ 2.68
MACROD1-208	ENST00000545464	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	31.81	■■■□□ 2.68
MACROD1-208	ENST00000545464	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	31.8	■■■□□ 2.68
MACROD1-208	ENST00000545464	TRPA1	O75762	1119 aa		31.8	■■■□□ 2.68
MACROD1-208	ENST00000545464	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	31.8	■■■□□ 2.68
MACROD1-208	ENST00000545464	GGA1	Q9UJY5	639 aa		31.8	■■■□□ 2.68
MACROD1-208	ENST00000545464	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	31.79	■■■□□ 2.68
MACROD1-208	ENST00000545464	MYD88	Q99836	296 aa		31.79	■■■□□ 2.68
MACROD1-208	ENST00000545464	MBIP	Q9NS73	344 aa		31.79	■■■□□ 2.68
MACROD1-208	ENST00000545464	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		31.79	■■■□□ 2.68
MACROD1-208	ENST00000545464	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	31.79	■■■□□ 2.68
MACROD1-208	ENST00000545464	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	31.78	■■■□□ 2.68
MACROD1-208	ENST00000545464	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	31.78	■■■□□ 2.68
MACROD1-208	ENST00000545464	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	31.78	■■■□□ 2.68
MACROD1-208	ENST00000545464	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	31.77	■■■□□ 2.68
MACROD1-208	ENST00000545464	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	31.77	■■■□□ 2.68
MACROD1-208	ENST00000545464	CDCA5	Q96FF9	252 aa		31.77	■■■□□ 2.68
MACROD1-208	ENST00000545464	RNF186	Q9NXI6	227 aa		31.77	■■■□□ 2.68
MACROD1-208	ENST00000545464	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		31.77	■■■□□ 2.68
MACROD1-208	ENST00000545464	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		31.77	■■■□□ 2.68
MACROD1-208	ENST00000545464	SCARF1	Q14162	830 aa		31.75	■■■□□ 2.67
MACROD1-208	ENST00000545464	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		31.75	■■■□□ 2.67
MACROD1-208	ENST00000545464	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	31.75	■■■□□ 2.67
MACROD1-208	ENST00000545464	SLC10A3	P09131	477 aa		31.73	■■■□□ 2.67
MACROD1-208	ENST00000545464	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	31.73	■■■□□ 2.67
MACROD1-208	ENST00000545464	CSRNP1	Q96S65	589 aa		31.72	■■■□□ 2.67
MACROD1-208	ENST00000545464	SCN9A	Q15858	1988 aa		31.72	■■■□□ 2.67
MACROD1-208	ENST00000545464	PDE8A	O60658	829 aa		31.71	■■■□□ 2.67
MACROD1-208	ENST00000545464	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		31.71	■■■□□ 2.67
MACROD1-208	ENST00000545464	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	31.7	■■■□□ 2.67
MACROD1-208	ENST00000545464	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	31.7	■■■□□ 2.67
MACROD1-208	ENST00000545464	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		31.7	■■■□□ 2.67
MACROD1-208	ENST00000545464	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		31.7	■■■□□ 2.67
MACROD1-208	ENST00000545464	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	31.7	■■■□□ 2.67
MACROD1-208	ENST00000545464	USP17L8	P0C7I0	530 aa		31.69	■■■□□ 2.66
MACROD1-208	ENST00000545464	SOX10	P56693	466 aa		31.69	■■■□□ 2.66
MACROD1-208	ENST00000545464	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	31.69	■■■□□ 2.66
MACROD1-208	ENST00000545464	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		31.68	■■■□□ 2.66
MACROD1-208	ENST00000545464	XDH	P47989	1333 aa		31.67	■■■□□ 2.66
MACROD1-208	ENST00000545464	ZNF853	P0CG23	659 aa		31.66	■■■□□ 2.66
MACROD1-208	ENST00000545464	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		31.66	■■■□□ 2.66
MACROD1-208	ENST00000545464	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	31.66	■■■□□ 2.66
MACROD1-208	ENST00000545464	USP17L3	A6NCW0	530 aa		31.65	■■■□□ 2.66
MACROD1-208	ENST00000545464	USP17L4	A6NCW7	530 aa		31.65	■■■□□ 2.66
MACROD1-208	ENST00000545464	ATP2B4	P23634	1241 aa		31.65	■■■□□ 2.66
MACROD1-208	ENST00000545464	GNAI1	P63096	354 aa		31.65	■■■□□ 2.66
MACROD1-208	ENST00000545464	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		31.65	■■■□□ 2.66
MACROD1-208	ENST00000545464	IFT57	Q9NWB7	429 aa		31.65	■■■□□ 2.66
MACROD1-208	ENST00000545464	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	31.64	■■■□□ 2.66
MACROD1-208	ENST00000545464	MOB2	Q70IA6	237 aa		31.64	■■■□□ 2.66
MACROD1-208	ENST00000545464	GML	Q99445	158 aa		31.64	■■■□□ 2.66
MACROD1-208	ENST00000545464	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	31.64	■■■□□ 2.66
MACROD1-208	ENST00000545464	APAF1	O14727	1248 aa		31.63	■■■□□ 2.65
MACROD1-208	ENST00000545464	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		31.63	■■■□□ 2.65
MACROD1-208	ENST00000545464	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		31.63	■■■□□ 2.65
MACROD1-208	ENST00000545464	FBXW7	Q969H0	707 aa		31.63	■■■□□ 2.65
MACROD1-208	ENST00000545464	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	31.62	■■■□□ 2.65
MACROD1-208	ENST00000545464	FKBP1B	P68106	108 aa		31.62	■■■□□ 2.65
MACROD1-208	ENST00000545464	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	31.62	■■■□□ 2.65
MACROD1-208	ENST00000545464	PODN	Q7Z5L7	613 aa		31.62	■■■□□ 2.65
MACROD1-208	ENST00000545464	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	31.62	■■■□□ 2.65
MACROD1-208	ENST00000545464	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	31.62	■■■□□ 2.65
MACROD1-208	ENST00000545464	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		31.62	■■■□□ 2.65
MACROD1-208	ENST00000545464	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		31.61	■■■□□ 2.65
MACROD1-208	ENST00000545464	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	31.61	■■■□□ 2.65
MACROD1-208	ENST00000545464	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	31.61	■■■□□ 2.65
MACROD1-208	ENST00000545464	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		31.61	■■■□□ 2.65
MACROD1-208	ENST00000545464	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		31.6	■■■□□ 2.65
MACROD1-208	ENST00000545464	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		31.59	■■■□□ 2.65
MACROD1-208	ENST00000545464	CTSW	P56202	376 aa		31.59	■■■□□ 2.65
MACROD1-208	ENST00000545464	MXD3	Q9BW11	206 aa		31.59	■■■□□ 2.65
MACROD1-208	ENST00000545464	ZNF609	O15014	1411 aa		31.58	■■■□□ 2.65
MACROD1-208	ENST00000545464	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		31.58	■■■□□ 2.65
MACROD1-208	ENST00000545464	OGFOD1	Q8N543	542 aa		31.56	■■■□□ 2.64
MACROD1-208	ENST00000545464	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		31.56	■■■□□ 2.64
MACROD1-208	ENST00000545464	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		31.56	■■■□□ 2.64

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