RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542921.5

JMJD1C-210, Transcript of jumonji domain containing 1C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene JMJD1C, Length 8,149 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1C-210ENST00000542921 CCDC90BQ9GZT6 254 aa3.56□□□□□ -1.84
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JMJD1C-210ENST00000542921 KRT6CP48668 564 aa3.56□□□□□ -1.84
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JMJD1C-210ENST00000542921 STX19Q8N4C7 294 aa3.55□□□□□ -1.84
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JMJD1C-210ENST00000542921 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
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JMJD1C-210ENST00000542921 PASD1Q8IV76 773 aa3.55□□□□□ -1.84
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JMJD1C-210ENST00000542921 TRIM11Q96F44 468 aa3.55□□□□□ -1.84
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JMJD1C-210ENST00000542921 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
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JMJD1C-210ENST00000542921 SMCO3A2RU48 225 aa3.55□□□□□ -1.84
JMJD1C-210ENST00000542921 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP3.55□□□□□ -1.84
JMJD1C-210ENST00000542921 GAS8O95995 478 aa3.55□□□□□ -1.84
JMJD1C-210ENST00000542921 SLFN14P0C7P3 912 aa3.55□□□□□ -1.84
JMJD1C-210ENST00000542921 TNNT1P13805 278 aa3.55□□□□□ -1.84
JMJD1C-210ENST00000542921 MAPK1P28482 360 aa3.55□□□□□ -1.84
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