RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533362.1

PUF60-222, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, human

TSL 5

Gene PUF60, Length 616 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUF60-222	ENST00000533362	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		28.05	■■■□□ 2.08
PUF60-222	ENST00000533362	EYA3	Q99504	573 aa		28.04	■■■□□ 2.08
PUF60-222	ENST00000533362	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	28.04	■■■□□ 2.08
PUF60-222	ENST00000533362	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	28.03	■■■□□ 2.08
PUF60-222	ENST00000533362	GPSM2	P81274	684 aa		28.03	■■■□□ 2.08
PUF60-222	ENST00000533362	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		28.03	■■■□□ 2.08
PUF60-222	ENST00000533362	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		28.03	■■■□□ 2.08
PUF60-222	ENST00000533362	GGA1	Q9UJY5	639 aa		28.03	■■■□□ 2.08
PUF60-222	ENST00000533362	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		28.03	■■■□□ 2.08
PUF60-222	ENST00000533362	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	28.02	■■■□□ 2.08
PUF60-222	ENST00000533362	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	28.02	■■■□□ 2.08
PUF60-222	ENST00000533362	ATP2B4	P23634	1241 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PUF60-222	ENST00000533362	MTX1	Q13505	466 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PUF60-222	ENST00000533362	JDP2	Q8WYK2	163 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PUF60-222	ENST00000533362	COG6	Q9Y2V7	657 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PUF60-222	ENST00000533362	LTBP1	Q14766	1721 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PUF60-222	ENST00000533362	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		28	■■■□□ 2.07
PUF60-222	ENST00000533362	C6orf229	H3BNL8	230 aa		28	■■■□□ 2.07
PUF60-222	ENST00000533362	PPIP5K2	O43314	1243 aa		28	■■■□□ 2.07
PUF60-222	ENST00000533362	SLC51A	Q86UW1	340 aa		28	■■■□□ 2.07
PUF60-222	ENST00000533362	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		28	■■■□□ 2.07
PUF60-222	ENST00000533362	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		28	■■■□□ 2.07
PUF60-222	ENST00000533362	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PUF60-222	ENST00000533362	UFL1	O94874	794 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PUF60-222	ENST00000533362	PRELP	P51888	382 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PUF60-222	ENST00000533362	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PUF60-222	ENST00000533362	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	27.99	■■■□□ 2.07
PUF60-222	ENST00000533362	FBXO3	Q9UK99	471 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PUF60-222	ENST00000533362	CHRND	Q07001	517 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PUF60-222	ENST00000533362	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PUF60-222	ENST00000533362	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PUF60-222	ENST00000533362	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PUF60-222	ENST00000533362	SRGAP3	O43295	1099 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PUF60-222	ENST00000533362	WASHC4	Q2M389	1173 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PUF60-222	ENST00000533362	NIM1K	Q8IY84	436 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PUF60-222	ENST00000533362	KCNJ4	P48050	445 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PUF60-222	ENST00000533362	AOC3	Q16853	763 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PUF60-222	ENST00000533362	POLL	Q9UGP5	575 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PUF60-222	ENST00000533362	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	27.95	■■■□□ 2.06
PUF60-222	ENST00000533362	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	27.95	■■■□□ 2.06
PUF60-222	ENST00000533362	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	27.94	■■■□□ 2.06
PUF60-222	ENST00000533362	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		27.94	■■■□□ 2.06
PUF60-222	ENST00000533362	CIAO1	O76071	339 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PUF60-222	ENST00000533362	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PUF60-222	ENST00000533362	COPRS	Q9NQ92	184 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PUF60-222	ENST00000533362	MED23	Q9ULK4	1368 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PUF60-222	ENST00000533362	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PUF60-222	ENST00000533362	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PUF60-222	ENST00000533362	EYA2	O00167	538 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PUF60-222	ENST00000533362	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PUF60-222	ENST00000533362		G3V3G9	751 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PUF60-222	ENST00000533362	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	27.91	■■■□□ 2.06
PUF60-222	ENST00000533362	METTL24	Q5JXM2	366 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PUF60-222	ENST00000533362	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PUF60-222	ENST00000533362	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	27.91	■■■□□ 2.06
PUF60-222	ENST00000533362	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PUF60-222	ENST00000533362	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PUF60-222	ENST00000533362	FZD9	O00144	591 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PUF60-222	ENST00000533362	ATP8B2	P98198	1209 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PUF60-222	ENST00000533362	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PUF60-222	ENST00000533362	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PUF60-222	ENST00000533362		A0A1B0GUL6	1792 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PUF60-222	ENST00000533362	RIMBP2	O15034	1052 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PUF60-222	ENST00000533362	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.06
PUF60-222	ENST00000533362	GLTPD2	A6NH11	291 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PUF60-222	ENST00000533362	LRRC24	Q50LG9	513 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PUF60-222	ENST00000533362	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
PUF60-222	ENST00000533362	TAF5L	O75529	589 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PUF60-222	ENST00000533362	UBE4A	Q14139	1066 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PUF60-222	ENST00000533362	CEP85	Q6P2H3	762 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PUF60-222	ENST00000533362	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
PUF60-222	ENST00000533362	SSH3	Q8TE77	659 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PUF60-222	ENST00000533362	SIL1	Q9H173	461 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PUF60-222	ENST00000533362	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PUF60-222	ENST00000533362	POLA2	Q14181	598 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PUF60-222	ENST00000533362	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
PUF60-222	ENST00000533362	COL4A5	P29400	1685 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PUF60-222	ENST00000533362	HMMR	O75330	724 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PUF60-222	ENST00000533362	PDE8B	O95263	885 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PUF60-222	ENST00000533362	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
PUF60-222	ENST00000533362	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
PUF60-222	ENST00000533362	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
PUF60-222	ENST00000533362	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PUF60-222	ENST00000533362	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
PUF60-222	ENST00000533362	ECE2	O60344	883 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PUF60-222	ENST00000533362	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
PUF60-222	ENST00000533362	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PUF60-222	ENST00000533362	GPC2	Q8N158	579 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PUF60-222	ENST00000533362	COA1	Q9GZY4	146 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PUF60-222	ENST00000533362	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	27.83	■■■□□ 2.05	8e-6	■■□□□ 11.5
PUF60-222	ENST00000533362	TNIP1	Q15025	636 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PUF60-222	ENST00000533362	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PUF60-222	ENST00000533362	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PUF60-222	ENST00000533362	PODN	Q7Z5L7	613 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PUF60-222	ENST00000533362	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PUF60-222	ENST00000533362	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
PUF60-222	ENST00000533362	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PUF60-222	ENST00000533362	AAMP	Q13685	434 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PUF60-222	ENST00000533362	DOK7	Q18PE1	504 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PUF60-222	ENST00000533362	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		27.81	■■■□□ 2.04

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms