RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521865.5

PABPC1-218, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, humanhuman

TSL 2

Gene PABPC1, Length 628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1-218ENST00000521865 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa26.88■■□□□ 1.89
PABPC1-218ENST00000521865 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
PABPC1-218ENST00000521865 DPF2Q92785 391 aa26.87■■□□□ 1.89
PABPC1-218ENST00000521865 LRRC37AA6NMS7 1700 aa26.86■■□□□ 1.89
PABPC1-218ENST00000521865 SAMD7Q7Z3H4 446 aa26.86■■□□□ 1.89
PABPC1-218ENST00000521865 SAPCD2Q86UD0 394 aa26.86■■□□□ 1.89
PABPC1-218ENST00000521865 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
PABPC1-218ENST00000521865 PDE8AO60658 829 aa26.85■■□□□ 1.89
PABPC1-218ENST00000521865 UFL1O94874 794 aa26.85■■□□□ 1.89
PABPC1-218ENST00000521865 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
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PABPC1-218ENST00000521865 USP48Q86UV5 1035 aa26.85■■□□□ 1.89
PABPC1-218ENST00000521865 AOC2O75106 756 aa26.84■■□□□ 1.89
PABPC1-218ENST00000521865 RPS12P25398 132 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
PABPC1-218ENST00000521865 KCNQ5Q9NR82 932 aa26.84■■□□□ 1.89
PABPC1-218ENST00000521865 GGA1Q9UJY5 639 aa26.84■■□□□ 1.89
PABPC1-218ENST00000521865 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa26.84■■□□□ 1.89
PABPC1-218ENST00000521865 COL4A1P02462 1669 aa26.83■■□□□ 1.89
PABPC1-218ENST00000521865 TSPYL6Q8N831 410 aa26.83■■□□□ 1.89
PABPC1-218ENST00000521865 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
PABPC1-218ENST00000521865 STK31Q9BXU1 1019 aa26.83■■□□□ 1.89
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PABPC1-218ENST00000521865 MAP2K2P36507 400 aa26.82■■□□□ 1.88
PABPC1-218ENST00000521865 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa26.81■■□□□ 1.88
PABPC1-218ENST00000521865 RTL9Q8NET4 1388 aa26.81■■□□□ 1.88
PABPC1-218ENST00000521865 PI4KAP2A4QPH2 592 aa26.8■■□□□ 1.88
PABPC1-218ENST00000521865 KSR2Q6VAB6 950 aa26.8■■□□□ 1.88
PABPC1-218ENST00000521865 KRT26Q7Z3Y9 468 aa26.8■■□□□ 1.88
PABPC1-218ENST00000521865 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa26.8■■□□□ 1.88
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PABPC1-218ENST00000521865 EGFRP00533 1210 aa26.79■■□□□ 1.88
PABPC1-218ENST00000521865 NEXNQ0ZGT2 675 aa26.79■■□□□ 1.88
PABPC1-218ENST00000521865 TRPM7Q96QT4 1865 aa26.79■■□□□ 1.88
PABPC1-218ENST00000521865 CCDC184Q52MB2 194 aa26.78■■□□□ 1.88
PABPC1-218ENST00000521865 DLK2Q6UY11 383 aa26.78■■□□□ 1.88
PABPC1-218ENST00000521865 TSKSQ9UJT2 592 aa26.78■■□□□ 1.88
PABPC1-218ENST00000521865 XDHP47989 1333 aa26.77■■□□□ 1.88
PABPC1-218ENST00000521865 HUNKP57058 714 aa26.77■■□□□ 1.88
PABPC1-218ENST00000521865 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa26.77■■□□□ 1.88
PABPC1-218ENST00000521865 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
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PABPC1-218ENST00000521865 CTSWP56202 376 aa26.76■■□□□ 1.87
PABPC1-218ENST00000521865 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
PABPC1-218ENST00000521865 THSD7BQ9C0I4 1608 aa26.76■■□□□ 1.87
PABPC1-218ENST00000521865 IGKV5-2P06315 115 aa26.75■■□□□ 1.87
PABPC1-218ENST00000521865 ADM5C9JUS6 153 aa26.74■■□□□ 1.87
PABPC1-218ENST00000521865 ATP2B4P23634 1241 aa26.74■■□□□ 1.87
PABPC1-218ENST00000521865 CCDC27Q2M243 656 aa26.74■■□□□ 1.87
PABPC1-218ENST00000521865 WWC1Q8IX03 1113 aa26.74■■□□□ 1.87
PABPC1-218ENST00000521865 SLC4A2P04920 1241 aa26.73■■□□□ 1.87
PABPC1-218ENST00000521865 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
PABPC1-218ENST00000521865 SULF1Q8IWU6 871 aa26.73■■□□□ 1.87
PABPC1-218ENST00000521865 C2orf69Q8N8R5 385 aa26.73■■□□□ 1.87
PABPC1-218ENST00000521865 ABHD8Q96I13 439 aa26.73■■□□□ 1.87
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PABPC1-218ENST00000521865 CA12O43570 354 aa26.72■■□□□ 1.87
PABPC1-218ENST00000521865 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
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PABPC1-218ENST00000521865 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
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PABPC1-218ENST00000521865 GREM2Q9H772 168 aa26.71■■□□□ 1.87
PABPC1-218ENST00000521865 NEURL1BA8MQ27 555 aa26.7■■□□□ 1.86
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PABPC1-218ENST00000521865 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa26.69■■□□□ 1.86
PABPC1-218ENST00000521865 PODNQ7Z5L7 613 aa26.69■■□□□ 1.86
PABPC1-218ENST00000521865 MRS2Q9HD23 443 aa26.69■■□□□ 1.86
PABPC1-218ENST00000521865 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
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PABPC1-218ENST00000521865 USP17L4A6NCW7 530 aa26.68■■□□□ 1.86
PABPC1-218ENST00000521865 USP17L1Q7RTZ2 530 aa26.68■■□□□ 1.86
PABPC1-218ENST00000521865 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
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PABPC1-218ENST00000521865 IL16Q14005 1332 aa26.67■■□□□ 1.86
PABPC1-218ENST00000521865 USP17L8P0C7I0 530 aa26.67■■□□□ 1.86
PABPC1-218ENST00000521865 SCARF1Q14162 830 aa26.67■■□□□ 1.86
PABPC1-218ENST00000521865 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
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PABPC1-218ENST00000521865 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
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PABPC1-218ENST00000521865 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
PABPC1-218ENST00000521865 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
PABPC1-218ENST00000521865 FLIIQ13045 1269 aa26.66■■□□□ 1.86
PABPC1-218ENST00000521865 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
PABPC1-218ENST00000521865 ZIC5Q96T25 663 aa26.66■■□□□ 1.86
PABPC1-218ENST00000521865 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
PABPC1-218ENST00000521865 H7C1W4 665 aa26.65■■□□□ 1.86
PABPC1-218ENST00000521865 CCT4P50991 539 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
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PABPC1-218ENST00000521865 MYOZ2Q9NPC6 264 aa26.65■■□□□ 1.86
PABPC1-218ENST00000521865 MED23Q9ULK4 1368 aa26.64■■□□□ 1.86
PABPC1-218ENST00000521865 CCDC102AQ96A19 550 aa26.64■■□□□ 1.86
PABPC1-218ENST00000521865 MYH16Q9H6N6 1097 aa26.64■■□□□ 1.86
PABPC1-218ENST00000521865 FANCIQ9NVI1 1328 aa26.64■■□□□ 1.85
PABPC1-218ENST00000521865 GCKRQ14397 625 aa26.63■■□□□ 1.85
PABPC1-218ENST00000521865 SCN9AQ15858 1988 aa26.62■■□□□ 1.85
PABPC1-218ENST00000521865 CCDC85CA6NKD9 419 aa26.62■■□□□ 1.85
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