RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498280.1

RBM39-242, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 3

Gene RBM39, Length 444 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-242ENST00000498280 ARSDP51689 593 aa5.5□□□□□ -1.53
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RBM39-242ENST00000498280 VRTNQ9H8Y1 702 aa5.5□□□□□ -1.53
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RBM39-242ENST00000498280 MED26O95402 600 aa5.49□□□□□ -1.53
RBM39-242ENST00000498280 CFAP70Q5T0N1 1121 aa5.49□□□□□ -1.53
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RBM39-242ENST00000498280 CAPN12Q6ZSI9 719 aa5.49□□□□□ -1.53
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RBM39-242ENST00000498280 SAP130Q9H0E3 1048 aa5.49□□□□□ -1.53
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RBM39-242ENST00000498280 C11orf91Q3C1V1 193 aa5.48□□□□□ -1.53
RBM39-242ENST00000498280 COX20Q5RI15 118 aa5.48□□□□□ -1.53
RBM39-242ENST00000498280 RGL4Q8IZJ4 473 aa5.48□□□□□ -1.53
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RBM39-242ENST00000498280 MYO19Q96H55 970 aa5.47□□□□□ -1.53
RBM39-242ENST00000498280 CEP41Q9BYV8 373 aa5.47□□□□□ -1.53
RBM39-242ENST00000498280 STOML1Q9UBI4 398 aa5.47□□□□□ -1.53
RBM39-242ENST00000498280 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
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RBM39-242ENST00000498280 XYLBO75191 536 aa5.46□□□□□ -1.54
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RBM39-242ENST00000498280 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
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RBM39-242ENST00000498280 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa5.46□□□□□ -1.54
RBM39-242ENST00000498280 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa5.46□□□□□ -1.54
RBM39-242ENST00000498280 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP5.46□□□□□ -1.54
RBM39-242ENST00000498280 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
RBM39-242ENST00000498280 MUC3BQ9H195 1237 aa5.46□□□□□ -1.54
RBM39-242ENST00000498280 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
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RBM39-242ENST00000498280 NFIAQ12857 509 aa5.45□□□□□ -1.54
RBM39-242ENST00000498280 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
RBM39-242ENST00000498280 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa5.45□□□□□ -1.54
RBM39-242ENST00000498280 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa5.45□□□□□ -1.54
RBM39-242ENST00000498280 FAM200AQ8TCP9 573 aa5.45□□□□□ -1.54
RBM39-242ENST00000498280 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa5.44□□□□□ -1.54
RBM39-242ENST00000498280 ADAMTS4O75173 837 aa5.44□□□□□ -1.54
RBM39-242ENST00000498280 EGFRP00533 1210 aa5.44□□□□□ -1.54
RBM39-242ENST00000498280 SOX18P35713 384 aa5.44□□□□□ -1.54
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RBM39-242ENST00000498280 SETDB1Q15047 1291 aa5.44□□□□□ -1.54
RBM39-242ENST00000498280 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
RBM39-242ENST00000498280 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
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RBM39-242ENST00000498280 TRIM33Q9UPN9 1127 aa5.44□□□□□ -1.54
RBM39-242ENST00000498280 JAG1P78504 1218 aa5.43□□□□□ -1.54
RBM39-242ENST00000498280 OCLNQ16625 522 aa5.43□□□□□ -1.54
RBM39-242ENST00000498280 ACAD11Q709F0 780 aa5.43□□□□□ -1.54
RBM39-242ENST00000498280 DTX1Q86Y01 620 aa5.43□□□□□ -1.54
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RBM39-242ENST00000498280 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
RBM39-242ENST00000498280 TMEM132AQ24JP5 1023 aa5.42□□□□□ -1.54
RBM39-242ENST00000498280 RNF43Q68DV7 783 aa5.42□□□□□ -1.54
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RBM39-242ENST00000498280 TRIM42Q8IWZ5 723 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-242ENST00000498280 LINC01387J3KSC0 135 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-242ENST00000498280 TM4SF5O14894 197 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-242ENST00000498280 CDC25BP30305 580 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-242ENST00000498280 LACRTQ9GZZ8 138 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-242ENST00000498280 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP5.39□□□□□ -1.55
RBM39-242ENST00000498280 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
RBM39-242ENST00000498280 FAM177BA6PVY3 158 aa5.38□□□□□ -1.55
RBM39-242ENST00000498280 UBAP1LF5GYI3 381 aa5.38□□□□□ -1.55
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