RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491572.1

UBE2Q1-206, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

TSL 2

Gene UBE2Q1, Length 235 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-206ENST00000491572 TMEM88BA6NKF7 163 aa9.15□□□□□ -0.94
UBE2Q1-206ENST00000491572 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
UBE2Q1-206ENST00000491572 CTAGE5O15320 804 aa9.15□□□□□ -0.94
UBE2Q1-206ENST00000491572 HMOX1P09601 288 aa9.15□□□□□ -0.94
UBE2Q1-206ENST00000491572 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP9.15□□□□□ -0.94
UBE2Q1-206ENST00000491572 SOX10P56693 466 aa9.15□□□□□ -0.94
UBE2Q1-206ENST00000491572 PLA2G4DQ86XP0 818 aa9.15□□□□□ -0.94
UBE2Q1-206ENST00000491572 NBPF15Q8N660 670 aa9.15□□□□□ -0.94
UBE2Q1-206ENST00000491572 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
UBE2Q1-206ENST00000491572 ERO1AQ96HE7 468 aa9.15□□□□□ -0.94
UBE2Q1-206ENST00000491572 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
UBE2Q1-206ENST00000491572 NUP62CLQ9H1M0 184 aa9.15□□□□□ -0.94
UBE2Q1-206ENST00000491572 PALD1Q9ULE6 856 aa9.15□□□□□ -0.94
UBE2Q1-206ENST00000491572 HDAC5Q9UQL6 1122 aa9.15□□□□□ -0.94
UBE2Q1-206ENST00000491572 SZT2Q5T011 3432 aa9.14□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa9.14□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 ERBB3P21860 1342 aa9.14□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 TTC41PQ6P2S7 1318 aa9.14□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa9.14□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 HIP1O00291 1037 aa9.14□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 SLFN14P0C7P3 912 aa9.14□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 TNNT1P13805 278 aa9.14□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 IL2RBP14784 551 aa9.14□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 DPEP1P16444 411 aa9.14□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP9.14□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 KCNJ6P48051 423 aa9.14□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 ANKRD1Q15327 319 aa9.14□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 TERF2Q15554 542 aa9.14□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 CNTROBQ8N137 903 aa9.14□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 KIF18AQ8NI77 898 aa9.14□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 SSH3Q8TE77 659 aa9.14□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa9.14□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 STK31Q9BXU1 1019 aa9.14□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 PYCARDQ9ULZ3 195 aa9.14□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 MTMR6Q9Y217 621 aa9.14□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 SNX14Q9Y5W7 946 aa9.14□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa9.14□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 POTECB2RU33 542 aa9.13□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 ATP8B1O43520 1251 aa9.13□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 SLC4A2P04920 1241 aa9.13□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 PSMA5P28066 241 aa9.13□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 ZNF75DP51815 510 aa9.13□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 TYRO3Q06418 890 aa9.13□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 DGKZQ13574 1117 aa9.13□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 TIGD1Q96MW7 591 aa9.13□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 LTBP1Q14766 1721 aa9.13□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 TTC21AQ8NDW8 1320 aa9.12□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 PLEKHG3A1L390 1219 aa9.12□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 CCP110O43303 1012 aa9.12□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 AK2P54819 239 aa9.12□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 GSDMDP57764 484 aa9.12□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 DEFB115Q30KQ5 88 aa9.12□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 CCDC30Q5VVM6 783 aa9.12□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 ATL3Q6DD88 541 aa9.12□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa9.12□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 GIMAP6Q6P9H5 292 aa9.12□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 ARHGEF25Q86VW2 580 aa9.12□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 SLC17A8Q8NDX2 589 aa9.12□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 RILPL2Q969X0 211 aa9.12□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 CHMP4CQ96CF2 233 aa9.12□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 KIF1BPQ96EK5 621 aa9.12□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 CLSTN2Q9H4D0 955 aa9.12□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa9.12□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa9.12□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 MRVI1Q9Y6F6 885 aa9.12□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa9.11□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 FIBPO43427 364 aa9.11□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 CA12O43570 354 aa9.11□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 NRDCO43847 1150 aa9.11□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 MMP10P09238 476 aa9.11□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 TPM1P09493 284 aa9.11□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 LMNB1P20700 586 aa9.11□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 KCNA3P22001 575 aa9.11□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 PTGS1P23219 599 aa9.11□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 POLA2Q14181 598 aa9.11□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 CEP135Q66GS9 1140 aa9.11□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 RUFY3Q7L099 469 aa9.11□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 CCDC186Q7Z3E2 898 aa9.11□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 TRIM5Q9C035 493 aa9.11□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 TNMDQ9H2S6 317 aa9.11□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 GDPD2Q9HCC8 539 aa9.11□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 SNRKQ9NRH2 765 aa9.11□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 HYPKQ9NX55 129 aa9.11□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 PIM2Q9P1W9 311 aa9.11□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 IMPACTQ9P2X3 320 aa9.11□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa9.11□□□□□ -0.95
UBE2Q1-206ENST00000491572 DOT1LQ8TEK3 1739 aa9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms