RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, human

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HOXB3-210	ENST00000489475	CHML	P26374	656 aa		32.64	■■■□□ 2.82
HOXB3-210	ENST00000489475	ATP2B3	Q16720	1220 aa		32.64	■■■□□ 2.82
HOXB3-210	ENST00000489475	EVI5L	Q96CN4	794 aa		32.64	■■■□□ 2.82
HOXB3-210	ENST00000489475	PDE8B	O95263	885 aa		32.63	■■■□□ 2.81
HOXB3-210	ENST00000489475	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		32.63	■■■□□ 2.81
HOXB3-210	ENST00000489475	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		32.63	■■■□□ 2.81
HOXB3-210	ENST00000489475	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		32.63	■■■□□ 2.81
HOXB3-210	ENST00000489475	AK9	Q5TCS8	1911 aa		32.63	■■■□□ 2.81
HOXB3-210	ENST00000489475	SERPINB2	P05120	415 aa		32.63	■■■□□ 2.81
HOXB3-210	ENST00000489475	BAG6	P46379	1132 aa		32.63	■■■□□ 2.81
HOXB3-210	ENST00000489475	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		32.63	■■■□□ 2.81
HOXB3-210	ENST00000489475	GORAB	Q5T7V8	394 aa		32.62	■■■□□ 2.81
HOXB3-210	ENST00000489475	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		32.61	■■■□□ 2.81
HOXB3-210	ENST00000489475	ST5	P78524	1137 aa		32.61	■■■□□ 2.81
HOXB3-210	ENST00000489475	XAGE2	Q96GT9	111 aa		32.61	■■■□□ 2.81
HOXB3-210	ENST00000489475	CASZ1	Q86V15	1759 aa		32.6	■■■□□ 2.81
HOXB3-210	ENST00000489475	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		32.6	■■■□□ 2.81
HOXB3-210	ENST00000489475	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		32.59	■■■□□ 2.81
HOXB3-210	ENST00000489475	REC8	O95072	547 aa		32.58	■■■□□ 2.81
HOXB3-210	ENST00000489475	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	32.58	■■■□□ 2.81
HOXB3-210	ENST00000489475	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	32.58	■■■□□ 2.81
HOXB3-210	ENST00000489475	DDR1	Q08345	913 aa		32.58	■■■□□ 2.81
HOXB3-210	ENST00000489475	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	32.58	■■■□□ 2.81
HOXB3-210	ENST00000489475	HAUS7	Q99871	368 aa		32.58	■■■□□ 2.81
HOXB3-210	ENST00000489475	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		32.58	■■■□□ 2.81
HOXB3-210	ENST00000489475	STK32B	Q9NY57	414 aa		32.58	■■■□□ 2.81
HOXB3-210	ENST00000489475	ADORA1	P30542	326 aa		32.57	■■■□□ 2.8
HOXB3-210	ENST00000489475	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	32.57	■■■□□ 2.8
HOXB3-210	ENST00000489475	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	32.57	■■■□□ 2.8
HOXB3-210	ENST00000489475	SPEF2	Q9C093	1822 aa		32.57	■■■□□ 2.8
HOXB3-210	ENST00000489475	SLC15A2	Q16348	729 aa		32.56	■■■□□ 2.8
HOXB3-210	ENST00000489475	LPIN2	Q92539	896 aa		32.56	■■■□□ 2.8
HOXB3-210	ENST00000489475	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	32.56	■■■□□ 2.8
HOXB3-210	ENST00000489475	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		32.55	■■■□□ 2.8
HOXB3-210	ENST00000489475	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	32.55	■■■□□ 2.8
HOXB3-210	ENST00000489475	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	32.54	■■■□□ 2.8
HOXB3-210	ENST00000489475	CHRND	Q07001	517 aa		32.54	■■■□□ 2.8
HOXB3-210	ENST00000489475	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	32.54	■■■□□ 2.8
HOXB3-210	ENST00000489475	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		32.54	■■■□□ 2.8
HOXB3-210	ENST00000489475	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	32.54	■■■□□ 2.8
HOXB3-210	ENST00000489475	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	32.54	■■■□□ 2.8
HOXB3-210	ENST00000489475	HIP1	O00291	1037 aa		32.53	■■■□□ 2.8
HOXB3-210	ENST00000489475	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	32.53	■■■□□ 2.8
HOXB3-210	ENST00000489475	FGFR2	P21802	821 aa		32.53	■■■□□ 2.8
HOXB3-210	ENST00000489475	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	32.53	■■■□□ 2.8
HOXB3-210	ENST00000489475	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	32.53	■■■□□ 2.8
HOXB3-210	ENST00000489475	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		32.53	■■■□□ 2.8
HOXB3-210	ENST00000489475	FSD1	Q9BTV5	496 aa		32.53	■■■□□ 2.8
HOXB3-210	ENST00000489475	COL4A1	P02462	1669 aa		32.52	■■■□□ 2.8
HOXB3-210	ENST00000489475	TAF5L	O75529	589 aa		32.52	■■■□□ 2.8
HOXB3-210	ENST00000489475	SLC5A1	P13866	664 aa		32.52	■■■□□ 2.8
HOXB3-210	ENST00000489475	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		32.52	■■■□□ 2.8
HOXB3-210	ENST00000489475	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	32.52	■■■□□ 2.8
HOXB3-210	ENST00000489475	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		32.51	■■■□□ 2.79
HOXB3-210	ENST00000489475	TAF1	P21675	1872 aa		32.5	■■■□□ 2.79
HOXB3-210	ENST00000489475	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	32.5	■■■□□ 2.79
HOXB3-210	ENST00000489475	USP26	Q9BXU7	913 aa		32.5	■■■□□ 2.79
HOXB3-210	ENST00000489475	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		32.49	■■■□□ 2.79
HOXB3-210	ENST00000489475	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	32.49	■■■□□ 2.79
HOXB3-210	ENST00000489475	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	32.49	■■■□□ 2.79
HOXB3-210	ENST00000489475	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		32.49	■■■□□ 2.79
HOXB3-210	ENST00000489475	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		32.49	■■■□□ 2.79
HOXB3-210	ENST00000489475	MMP10	P09238	476 aa		32.47	■■■□□ 2.79
HOXB3-210	ENST00000489475	CRY2	Q49AN0	593 aa		32.47	■■■□□ 2.79
HOXB3-210	ENST00000489475	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		32.47	■■■□□ 2.79
HOXB3-210	ENST00000489475	SGSM2	O43147	1006 aa		32.47	■■■□□ 2.79
HOXB3-210	ENST00000489475	CCDC125	Q86Z20	511 aa		32.47	■■■□□ 2.79
HOXB3-210	ENST00000489475	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	32.47	■■■□□ 2.79
HOXB3-210	ENST00000489475	GOLIM4	O00461	696 aa		32.46	■■■□□ 2.79
HOXB3-210	ENST00000489475	GRAP	Q13588	217 aa		32.46	■■■□□ 2.79
HOXB3-210	ENST00000489475	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	32.46	■■■□□ 2.79
HOXB3-210	ENST00000489475	MSL1	Q68DK7	614 aa		32.45	■■■□□ 2.79
HOXB3-210	ENST00000489475	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		32.45	■■■□□ 2.79
HOXB3-210	ENST00000489475	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		32.45	■■■□□ 2.79
HOXB3-210	ENST00000489475	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		32.45	■■■□□ 2.79
HOXB3-210	ENST00000489475	SNAP23	O00161	211 aa		32.44	■■■□□ 2.78
HOXB3-210	ENST00000489475	CCDC102B	Q68D86	513 aa		32.44	■■■□□ 2.78
HOXB3-210	ENST00000489475	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		32.44	■■■□□ 2.78
HOXB3-210	ENST00000489475	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		32.44	■■■□□ 2.78
HOXB3-210	ENST00000489475	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	32.44	■■■□□ 2.78
HOXB3-210	ENST00000489475	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		32.44	■■■□□ 2.78
HOXB3-210	ENST00000489475	UBE4A	Q14139	1066 aa		32.43	■■■□□ 2.78
HOXB3-210	ENST00000489475	TICAM2	Q86XR7	235 aa		32.43	■■■□□ 2.78
HOXB3-210	ENST00000489475	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
HOXB3-210	ENST00000489475	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		32.43	■■■□□ 2.78
HOXB3-210	ENST00000489475	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		32.42	■■■□□ 2.78
HOXB3-210	ENST00000489475	IL25	Q9H293	177 aa		32.42	■■■□□ 2.78
HOXB3-210	ENST00000489475	PHKA1	P46020	1223 aa		32.42	■■■□□ 2.78
HOXB3-210	ENST00000489475	SNRK	Q9NRH2	765 aa		32.42	■■■□□ 2.78
HOXB3-210	ENST00000489475	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		32.41	■■■□□ 2.78
HOXB3-210	ENST00000489475	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	32.41	■■■□□ 2.78
HOXB3-210	ENST00000489475	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
HOXB3-210	ENST00000489475	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	32.41	■■■□□ 2.78
HOXB3-210	ENST00000489475	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	32.41	■■■□□ 2.78
HOXB3-210	ENST00000489475	SCARF1	Q14162	830 aa		32.41	■■■□□ 2.78
HOXB3-210	ENST00000489475	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		32.41	■■■□□ 2.78
HOXB3-210	ENST00000489475	FAM227B	Q96M60	508 aa		32.4	■■■□□ 2.78
HOXB3-210	ENST00000489475	RAD50	Q92878	1312 aa		32.39	■■■□□ 2.78
HOXB3-210	ENST00000489475	MCAM	P43121	646 aa		32.39	■■■□□ 2.78
HOXB3-210	ENST00000489475		A0A1B0GUL6	1792 aa		32.39	■■■□□ 2.78

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