RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476842.1

SMIM4-202, Transcript of small integral membrane protein 4, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene SMIM4, Length 522 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM4-202ENST00000476842 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
SMIM4-202ENST00000476842 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.29■■□□□ 1.16
SMIM4-202ENST00000476842 LARGE2Q8N3Y3 721 aa22.29■■□□□ 1.16
SMIM4-202ENST00000476842 ANKRD2Q9GZV1 360 aa22.29■■□□□ 1.16
SMIM4-202ENST00000476842 GGA1Q9UJY5 639 aa22.29■■□□□ 1.16
SMIM4-202ENST00000476842 XDHP47989 1333 aa22.29■■□□□ 1.16
SMIM4-202ENST00000476842 MYH3P11055 1940 aa22.28■■□□□ 1.16
SMIM4-202ENST00000476842 PPIP5K2O43314 1243 aa22.28■■□□□ 1.16
SMIM4-202ENST00000476842 GNAI2P04899 355 aa22.28■■□□□ 1.16
SMIM4-202ENST00000476842 ATP2B4P23634 1241 aa22.28■■□□□ 1.16
SMIM4-202ENST00000476842 KIAA2012Q0VF49 1180 aa22.28■■□□□ 1.16
SMIM4-202ENST00000476842 AOC3Q16853 763 aa22.28■■□□□ 1.16
SMIM4-202ENST00000476842 JDP2Q8WYK2 163 aa22.28■■□□□ 1.16
SMIM4-202ENST00000476842 SBF1O95248 1867 aa22.27■■□□□ 1.16
SMIM4-202ENST00000476842 PDE3AQ14432 1141 aa22.27■■□□□ 1.16
SMIM4-202ENST00000476842 WASHC4Q2M389 1173 aa22.27■■□□□ 1.16
SMIM4-202ENST00000476842 EYA3Q99504 573 aa22.27■■□□□ 1.16
SMIM4-202ENST00000476842 FZD9O00144 591 aa22.26■■□□□ 1.15
SMIM4-202ENST00000476842 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SMIM4-202ENST00000476842 CHRNDQ07001 517 aa22.26■■□□□ 1.15
SMIM4-202ENST00000476842 DPY19L2Q6NUT2 758 aa22.26■■□□□ 1.15
SMIM4-202ENST00000476842 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.26■■□□□ 1.15
SMIM4-202ENST00000476842 LEMD3Q9Y2U8 911 aa22.26■■□□□ 1.15
SMIM4-202ENST00000476842 LRRC37AA6NMS7 1700 aa22.26■■□□□ 1.15
SMIM4-202ENST00000476842 GLTPD2A6NH11 291 aa22.25■■□□□ 1.15
SMIM4-202ENST00000476842 UFL1O94874 794 aa22.25■■□□□ 1.15
SMIM4-202ENST00000476842 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SMIM4-202ENST00000476842 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SMIM4-202ENST00000476842 MTX1Q13505 466 aa22.24■■□□□ 1.15
SMIM4-202ENST00000476842 NIM1KQ8IY84 436 aa22.24■■□□□ 1.15
SMIM4-202ENST00000476842 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SMIM4-202ENST00000476842 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.24■■□□□ 1.15
SMIM4-202ENST00000476842 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SMIM4-202ENST00000476842 RIMBP2O15034 1052 aa22.23■■□□□ 1.15
SMIM4-202ENST00000476842 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SMIM4-202ENST00000476842 ZNRF3Q9ULT6 936 aa22.23■■□□□ 1.15
SMIM4-202ENST00000476842 DUOX1Q9NRD9 1551 aa22.23■■□□□ 1.15
SMIM4-202ENST00000476842 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.23■■□□□ 1.15
SMIM4-202ENST00000476842 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SMIM4-202ENST00000476842 KLHDC4Q8TBB5 520 aa22.22■■□□□ 1.15
SMIM4-202ENST00000476842 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SMIM4-202ENST00000476842 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SMIM4-202ENST00000476842 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SMIM4-202ENST00000476842 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.22■■□□□ 1.15
SMIM4-202ENST00000476842 COG6Q9Y2V7 657 aa22.22■■□□□ 1.15
SMIM4-202ENST00000476842 TAF5LO75529 589 aa22.21■■□□□ 1.15
SMIM4-202ENST00000476842 EIF6P56537 245 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SMIM4-202ENST00000476842 LRRC24Q50LG9 513 aa22.21■■□□□ 1.15
SMIM4-202ENST00000476842 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.21■■□□□ 1.15
SMIM4-202ENST00000476842 FBXO3Q9UK99 471 aa22.21■■□□□ 1.15
SMIM4-202ENST00000476842 ZNF804BA4D1E1 1349 aa22.21■■□□□ 1.15
SMIM4-202ENST00000476842 SRGAP3O43295 1099 aa22.2■■□□□ 1.14
SMIM4-202ENST00000476842 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SMIM4-202ENST00000476842 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.2■■□□□ 1.14
SMIM4-202ENST00000476842 COL4A5P29400 1685 aa22.2■■□□□ 1.14
SMIM4-202ENST00000476842 EYA2O00167 538 aa22.19■■□□□ 1.14
SMIM4-202ENST00000476842 DDNO94850 711 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SMIM4-202ENST00000476842 ATP8B2P98198 1209 aa22.19■■□□□ 1.14
SMIM4-202ENST00000476842 COPRSQ9NQ92 184 aa22.19■■□□□ 1.14
SMIM4-202ENST00000476842 LTBP1Q14766 1721 aa22.18■■□□□ 1.14
SMIM4-202ENST00000476842 MED23Q9ULK4 1368 aa22.18■■□□□ 1.14
SMIM4-202ENST00000476842 ZNF541Q9H0D2 1346 aa22.18■■□□□ 1.14
SMIM4-202ENST00000476842 KCNJ4P48050 445 aa22.18■■□□□ 1.14
SMIM4-202ENST00000476842 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SMIM4-202ENST00000476842 DOK7Q18PE1 504 aa22.18■■□□□ 1.14
SMIM4-202ENST00000476842 SNAP23O00161 211 aa22.17■■□□□ 1.14
SMIM4-202ENST00000476842 CIAO1O76071 339 aa22.17■■□□□ 1.14
SMIM4-202ENST00000476842 CXCL9Q07325 125 aa22.17■■□□□ 1.14
SMIM4-202ENST00000476842 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SMIM4-202ENST00000476842 ATG9AQ7Z3C6 839 aa22.17■■□□□ 1.14
SMIM4-202ENST00000476842 GPC2Q8N158 579 aa22.17■■□□□ 1.14
SMIM4-202ENST00000476842 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.17■■□□□ 1.14
SMIM4-202ENST00000476842 DBNDD1Q9H9R9 158 aa22.17■■□□□ 1.14
SMIM4-202ENST00000476842 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa22.17■■□□□ 1.14
SMIM4-202ENST00000476842 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SMIM4-202ENST00000476842 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa22.17■■□□□ 1.14
SMIM4-202ENST00000476842 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.16■■□□□ 1.14
SMIM4-202ENST00000476842 YDJCA8MPS7 323 aa22.16■■□□□ 1.14
SMIM4-202ENST00000476842 G3V3G9 751 aa22.16■■□□□ 1.14
SMIM4-202ENST00000476842 ECE2O60344 883 aa22.16■■□□□ 1.14
SMIM4-202ENST00000476842 UBE4AQ14139 1066 aa22.16■■□□□ 1.14
SMIM4-202ENST00000476842 METTL24Q5JXM2 366 aa22.16■■□□□ 1.14
SMIM4-202ENST00000476842 DCAF8Q5TAQ9 597 aa22.16■■□□□ 1.14
SMIM4-202ENST00000476842 TXNRD3Q86VQ6 643 aa22.16■■□□□ 1.14
SMIM4-202ENST00000476842 RRAGCQ9HB90 399 aa22.16■■□□□ 1.14
SMIM4-202ENST00000476842 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SMIM4-202ENST00000476842 PDE8BO95263 885 aa22.15■■□□□ 1.14
SMIM4-202ENST00000476842 TNIP1Q15025 636 aa22.15■■□□□ 1.14
SMIM4-202ENST00000476842 PODNQ7Z5L7 613 aa22.15■■□□□ 1.14
SMIM4-202ENST00000476842 VGLL2Q8N8G2 317 aa22.15■■□□□ 1.14
SMIM4-202ENST00000476842 SSH3Q8TE77 659 aa22.15■■□□□ 1.14
SMIM4-202ENST00000476842 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SMIM4-202ENST00000476842 SIL1Q9H173 461 aa22.15■■□□□ 1.14
SMIM4-202ENST00000476842 NMRK2Q9NPI5 230 aa22.15■■□□□ 1.14
SMIM4-202ENST00000476842 IRS2Q9Y4H2 1338 aa22.14■■□□□ 1.14
SMIM4-202ENST00000476842 IL15P40933 162 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SMIM4-202ENST00000476842 POLA2Q14181 598 aa22.14■■□□□ 1.13
SMIM4-202ENST00000476842 CIAPIN1Q6FI81 312 aa22.14■■□□□ 1.13
SMIM4-202ENST00000476842 COA1Q9GZY4 146 aa22.14■■□□□ 1.13
SMIM4-202ENST00000476842 GJA3Q9Y6H8 435 aa22.14■■□□□ 1.13
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