RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 HOXB7P09629 217 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-209ENST00000473257 ZNF853P0CG23 659 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-209ENST00000473257 RPS8P62241 208 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
ACTB-209ENST00000473257 KRT26Q7Z3Y9 468 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-209ENST00000473257 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
ACTB-209ENST00000473257 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
ACTB-209ENST00000473257 CDHR2Q9BYE9 1310 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-209ENST00000473257 UFL1O94874 794 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-209ENST00000473257 MAP2K2P36507 400 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-209ENST00000473257 HUNKP57058 714 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-209ENST00000473257 GOLGA2Q08379 1002 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-209ENST00000473257 FAM161AQ3B820 660 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-209ENST00000473257 TMC4Q7Z404 712 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-209ENST00000473257 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
ACTB-209ENST00000473257 TSPYL6Q8N831 410 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-209ENST00000473257 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
ACTB-209ENST00000473257 DPF2Q92785 391 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-209ENST00000473257 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
ACTB-209ENST00000473257 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-209ENST00000473257 CCDC184Q52MB2 194 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-209ENST00000473257 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
ACTB-209ENST00000473257 GGA3Q9NZ52 723 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-209ENST00000473257 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-209ENST00000473257 EYA3Q99504 573 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-209ENST00000473257 MXD3Q9BW11 206 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-209ENST00000473257 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
ACTB-209ENST00000473257 MCOLN1Q9GZU1 580 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-209ENST00000473257 IFT57Q9NWB7 429 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-209ENST00000473257 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
ACTB-209ENST00000473257 G3V3G9 751 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-209ENST00000473257 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
ACTB-209ENST00000473257 VIL1P09327 827 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
ACTB-209ENST00000473257 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
ACTB-209ENST00000473257 DCAF8Q5TAQ9 597 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-209ENST00000473257 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
ACTB-209ENST00000473257 HHIPL1Q96JK4 782 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-209ENST00000473257 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
ACTB-209ENST00000473257 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
ACTB-209ENST00000473257 GGA1Q9UJY5 639 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-209ENST00000473257 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-209ENST00000473257 IGKV5-2P06315 115 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-209ENST00000473257 GNAI1P63096 354 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-209ENST00000473257 MOB2Q70IA6 237 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-209ENST00000473257 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
ACTB-209ENST00000473257 PODXL2Q9NZ53 605 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-209ENST00000473257 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
ACTB-209ENST00000473257 PDE8AO60658 829 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-209ENST00000473257 RPS12P25398 132 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
ACTB-209ENST00000473257 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
ACTB-209ENST00000473257 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
ACTB-209ENST00000473257 NOGQ13253 232 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-209ENST00000473257 DGKZQ13574 1117 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-209ENST00000473257 SCARF1Q14162 830 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-209ENST00000473257 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
ACTB-209ENST00000473257 CCDC152Q4G0S7 254 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-209ENST00000473257 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
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ACTB-209ENST00000473257 CDCA5Q96FF9 252 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-209ENST00000473257 PI4KAP2A4QPH2 592 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTB-209ENST00000473257 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
ACTB-209ENST00000473257 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTB-209ENST00000473257 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTB-209ENST00000473257 C2orf69Q8N8R5 385 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTB-209ENST00000473257 GREM2Q9H772 168 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTB-209ENST00000473257 SPEF2Q9C093 1822 aa14.47□□□□□ -0.09
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ACTB-209ENST00000473257 SULF1Q8IWU6 871 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-209ENST00000473257 FBXW7Q969H0 707 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-209ENST00000473257 GMLQ99445 158 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-209ENST00000473257 XDHP47989 1333 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-209ENST00000473257 CA12O43570 354 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-209ENST00000473257 TRPA1O75762 1119 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-209ENST00000473257 KLRK1P26718 216 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-209ENST00000473257 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
ACTB-209ENST00000473257 CCDC30Q5VVM6 783 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-209ENST00000473257 TXNRD3Q86VQ6 643 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-209ENST00000473257 NBPF9Q3BBW0 867 aa14.44□□□□□ -0.1
ACTB-209ENST00000473257 KSR2Q6VAB6 950 aa14.44□□□□□ -0.1
ACTB-209ENST00000473257 TTLL11Q8NHH1 800 aa14.44□□□□□ -0.1
ACTB-209ENST00000473257 MYOZ2Q9NPC6 264 aa14.44□□□□□ -0.1
ACTB-209ENST00000473257 RNF186Q9NXI6 227 aa14.44□□□□□ -0.1
ACTB-209ENST00000473257 MINPP1Q9UNW1 487 aa14.44□□□□□ -0.1
ACTB-209ENST00000473257 USP17L3A6NCW0 530 aa14.43□□□□□ -0.1
ACTB-209ENST00000473257 USP17L4A6NCW7 530 aa14.43□□□□□ -0.1
ACTB-209ENST00000473257 UBE2Q2LH0YL09 131 aa14.43□□□□□ -0.1
ACTB-209ENST00000473257 DDX58O95786 925 aaKnown RBP14.43□□□□□ -0.1
ACTB-209ENST00000473257 SLC10A3P09131 477 aa14.43□□□□□ -0.1
ACTB-209ENST00000473257 USP17L8P0C7I0 530 aa14.43□□□□□ -0.1
ACTB-209ENST00000473257 ATP2B4P23634 1241 aa14.43□□□□□ -0.1
ACTB-209ENST00000473257 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP14.43□□□□□ -0.1
ACTB-209ENST00000473257 USP17L1Q7RTZ2 530 aa14.43□□□□□ -0.1
ACTB-209ENST00000473257 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa14.43□□□□□ -0.1
ACTB-209ENST00000473257 CSRNP1Q96S65 589 aa14.43□□□□□ -0.1
ACTB-209ENST00000473257 NEURL1BA8MQ27 555 aa14.42□□□□□ -0.1
ACTB-209ENST00000473257 SNAP23O00161 211 aa14.42□□□□□ -0.1
ACTB-209ENST00000473257 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP14.42□□□□□ -0.1
ACTB-209ENST00000473257 RASAL3Q86YV0 1011 aa14.42□□□□□ -0.1
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