RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466037.6

HOXB-AS3-204, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 522 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 COL4A1P02462 1669 aa24.95■■□□□ 1.58
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 TAF7LQ5H9L4 462 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXB-AS3-204ENST00000466037 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 LMBR1LQ6UX01 489 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 CIAPIN1Q6FI81 312 aa24.92■■□□□ 1.58
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZBED9Q6R2W3 1325 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RAD17O75943 681 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXB-AS3-204ENST00000466037 EPHX2P34913 555 aa24.91■■□□□ 1.58
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 CXCL9Q07325 125 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXB-AS3-204ENST00000466037 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 ANKRD2Q9GZV1 360 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DBNDD1Q9H9R9 158 aa24.91■■□□□ 1.58
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 EPHA10Q5JZY3 1008 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CHADLQ6NUI6 762 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LDHDQ86WU2 507 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXB-AS3-204ENST00000466037 YDJCA8MPS7 323 aa24.86■■□□□ 1.57
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 HDAC5Q9UQL6 1122 aa24.84■■□□□ 1.57
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF804BA4D1E1 1349 aa24.83■■□□□ 1.56
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KAZALD1Q96I82 304 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 BCAR3O75815 825 aa24.81■■□□□ 1.56
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa24.79■■□□□ 1.56
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 DPF2Q92785 391 aa24.78■■□□□ 1.56
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HOXB-AS3-204ENST00000466037 KCNQ5Q9NR82 932 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MICALL2Q8IY33 904 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 USP17L3A6NCW0 530 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-204ENST00000466037 USP17L4A6NCW7 530 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TRIM27P14373 513 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-204ENST00000466037 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-204ENST00000466037 USP17L1Q7RTZ2 530 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FBXW7Q969H0 707 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-204ENST00000466037 VIL1P09327 827 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HTRA3P83110 453 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CNTROBQ8N137 903 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GNAI3P08754 354 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CLUAP1Q96AJ1 413 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MROH5Q6ZUA9 1318 aa24.74■■□□□ 1.55
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