RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452612.5

TTC28-AS1-217, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene TTC28-AS1, Length 746 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-217ENST00000452612 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-217ENST00000452612 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-217ENST00000452612 PGAP2Q9UHJ9 254 aa16.75■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-217ENST00000452612 PDE8AO60658 829 aa16.74■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-217ENST00000452612 DDX58O95786 925 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-217ENST00000452612 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CCDC152Q4G0S7 254 aa16.74■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa16.74■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-217ENST00000452612 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa16.74■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-217ENST00000452612 RTL9Q8NET4 1388 aa16.74■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-217ENST00000452612 AOC2O75106 756 aa16.73■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-217ENST00000452612 UFL1O94874 794 aa16.73■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-217ENST00000452612 EGFRP00533 1210 aa16.73■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-217ENST00000452612 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-217ENST00000452612 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-217ENST00000452612 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-217ENST00000452612 DLK2Q6UY11 383 aa16.73■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CDC37L1Q7L3B6 337 aa16.73■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SAPCD2Q86UD0 394 aa16.73■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-217ENST00000452612 USP48Q86UV5 1035 aa16.73■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-217ENST00000452612 DPF2Q92785 391 aa16.73■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-217ENST00000452612 G3V3G9 751 aa16.72■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-217ENST00000452612 DCAF8Q5TAQ9 597 aa16.72■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-217ENST00000452612 BEGAINQ9BUH8 593 aa16.72■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-217ENST00000452612 PSME4Q14997 1843 aa16.72■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-217ENST00000452612 PI4KAP2A4QPH2 592 aa16.71■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-217ENST00000452612 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa16.71■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-217ENST00000452612 PODXL2Q9NZ53 605 aa16.71■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-217ENST00000452612 GGA1Q9UJY5 639 aa16.71■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-217ENST00000452612 IGKV5-2P06315 115 aa16.7■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-217ENST00000452612 RPS12P25398 132 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-217ENST00000452612 KSR2Q6VAB6 950 aa16.7■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa16.7■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-217ENST00000452612 STK31Q9BXU1 1019 aa16.7■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CHMP4AQ9BY43 222 aa16.7■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-217ENST00000452612 TSKSQ9UJT2 592 aa16.7■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-217ENST00000452612 G2E3Q7L622 706 aa16.69■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-217ENST00000452612 WWC1Q8IX03 1113 aa16.69■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa16.69■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CACNA1FO60840 1977 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ADM5C9JUS6 153 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-217ENST00000452612 VIL1P09327 827 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-217ENST00000452612 MAP2K2P36507 400 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CTSWP56202 376 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-217ENST00000452612 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-217ENST00000452612 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-217ENST00000452612 KRT26Q7Z3Y9 468 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-217ENST00000452612 XDHP47989 1333 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-217ENST00000452612 NEXNQ0ZGT2 675 aa16.67■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CCDC27Q2M243 656 aa16.67■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-217ENST00000452612 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-217ENST00000452612 HHIPL1Q96JK4 782 aa16.67■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SLC4A2P04920 1241 aa16.66■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-217ENST00000452612 HUNKP57058 714 aa16.66■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-217ENST00000452612 TTLL11Q8NHH1 800 aa16.66■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-217ENST00000452612 GREM2Q9H772 168 aa16.66■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-217ENST00000452612 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-217ENST00000452612 NEURL1BA8MQ27 555 aa16.65■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ATP2B4P23634 1241 aa16.65■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-217ENST00000452612 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa16.65■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ZIC5Q96T25 663 aa16.65■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-217ENST00000452612 MRS2Q9HD23 443 aa16.65■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-217ENST00000452612 GGA3Q9NZ52 723 aa16.65■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-217ENST00000452612 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ABHD8Q96I13 439 aa16.64■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-217ENST00000452612 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-217ENST00000452612 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SULF1Q8IWU6 871 aa16.63■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-217ENST00000452612 C2orf69Q8N8R5 385 aa16.63■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-217ENST00000452612 AGBL3Q8NEM8 1001 aa16.63■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-217ENST00000452612 MINPP1Q9UNW1 487 aa16.63■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-217ENST00000452612 IL16Q14005 1332 aa16.63■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-217ENST00000452612 AKAP11Q9UKA4 1901 aa16.62■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-217ENST00000452612 FLIIQ13045 1269 aa16.62■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SCARF1Q14162 830 aa16.62■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-217ENST00000452612 RGMBQ6NW40 437 aa16.62■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-217ENST00000452612 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-217ENST00000452612 FANCIQ9NVI1 1328 aa16.62■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-217ENST00000452612 USP17L3A6NCW0 530 aa16.61■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-217ENST00000452612 USP17L4A6NCW7 530 aa16.61■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-217ENST00000452612 H7C1W4 665 aa16.61■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-217ENST00000452612 NOGQ13253 232 aa16.61■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-217ENST00000452612 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-217ENST00000452612 USP17L1Q7RTZ2 530 aa16.61■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-217ENST00000452612 PODNQ7Z5L7 613 aa16.61■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-217ENST00000452612 FBXW7Q969H0 707 aa16.61■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ZNF609O15014 1411 aa16.61■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CA12O43570 354 aa16.6■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-217ENST00000452612 USP17L8P0C7I0 530 aa16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms