RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428394.6

HCLS1-202, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCLS1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-202ENST00000428394 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.76
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HCLS1-202ENST00000428394 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.76
HCLS1-202ENST00000428394 KBTBD3Q8NAB2 608 aa19.83■□□□□ 0.76
HCLS1-202ENST00000428394 BICD2Q8TD16 824 aa19.83■□□□□ 0.76
HCLS1-202ENST00000428394 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP19.83■□□□□ 0.76
HCLS1-202ENST00000428394 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa19.83■□□□□ 0.76
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HCLS1-202ENST00000428394 XAGE3Q8WTP9 111 aa19.82■□□□□ 0.76
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HCLS1-202ENST00000428394 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa19.78■□□□□ 0.76
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HCLS1-202ENST00000428394 FAM160A1Q05DH4 1040 aa19.77■□□□□ 0.76
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HCLS1-202ENST00000428394 CCDC186Q7Z3E2 898 aa19.77■□□□□ 0.76
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HCLS1-202ENST00000428394 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa19.76■□□□□ 0.75
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HCLS1-202ENST00000428394 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
HCLS1-202ENST00000428394 CLIP2Q9UDT6 1046 aa19.75■□□□□ 0.75
HCLS1-202ENST00000428394 TJP1Q07157 1748 aa19.75■□□□□ 0.75
HCLS1-202ENST00000428394 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
HCLS1-202ENST00000428394 ZBTB7CA1YPR0 619 aa19.74■□□□□ 0.75
HCLS1-202ENST00000428394 KINO60870 393 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
HCLS1-202ENST00000428394 KCNJ6P48051 423 aa19.74■□□□□ 0.75
HCLS1-202ENST00000428394 SCRN1Q12765 414 aa19.74■□□□□ 0.75
HCLS1-202ENST00000428394 KRT28Q7Z3Y7 464 aa19.74■□□□□ 0.75
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