RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416146.1

AC017078.1-201, humanhuman

BASIC

Gene AC017078.1, Length 368 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC017078.1-201ENST00000416146 CNGA1P29973 690 aa7.33□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 ZNF132P52740 706 aa7.33□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP7.33□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 NUCB1Q02818 461 aa7.33□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 SQSTM1Q13501 440 aa7.33□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 LVRNQ6Q4G3 990 aa7.33□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 SNX32Q86XE0 403 aa7.33□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 IFNL2Q8IZJ0 200 aa7.33□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 FBXO41Q8TF61 875 aa7.33□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 CENPTQ96BT3 561 aa7.33□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 NELL2Q99435 816 aa7.33□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 DNAJC7Q99615 494 aa7.33□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 FEZ1Q99689 392 aa7.33□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 CYLDQ9NQC7 956 aa7.33□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 TMEM51Q9NW97 253 aa7.33□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 IPPQ9Y573 584 aa7.33□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 AKAP10O43572 662 aa7.32□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 SNX2O60749 519 aa7.32□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 RHOBTB3O94955 611 aa7.32□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 CTSHP09668 335 aa7.32□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 PSMA3P25788 255 aa7.32□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 ETFBP38117 255 aa7.32□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 NEK3P51956 506 aa7.32□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa7.32□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 MORC1Q86VD1 984 aa7.32□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 PLPP6Q8IY26 295 aa7.32□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 FAM174AQ8TBP5 190 aa7.32□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 CERKQ8TCT0 537 aa7.32□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 CENPOQ9BU64 300 aa7.32□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 TRIM55Q9BYV6 548 aa7.32□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 PRKD2Q9BZL6 878 aa7.32□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 TMEM260Q9NX78 707 aa7.32□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 WASHC2AQ641Q2 1341 aa7.31□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 CCDC85CA6NKD9 419 aa7.31□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 C19orf81C9J6K1 198 aa7.31□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 RASGRP1O95267 797 aa7.31□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 OATP04181 439 aa7.31□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 TNFAIP3P21580 790 aa7.31□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 SERPINB3P29508 390 aa7.31□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 GJA5P36382 358 aa7.31□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 RAB33AQ14088 237 aa7.31□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 LRP10Q7Z4F1 713 aa7.31□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 OR8H2Q8N162 312 aa7.31□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 APPL2Q8NEU8 664 aa7.31□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 GPRASP2Q96D09 838 aa7.31□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 HERPUD2Q9BSE4 406 aa7.31□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 PGAP2Q9UHJ9 254 aa7.31□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa7.3□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa7.3□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 PMLP29590 882 aa7.3□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 ADD2P35612 726 aa7.3□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 HTR3AP46098 478 aa7.3□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 CD151P48509 253 aa7.3□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 EHHADHQ08426 723 aa7.3□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 MLC1Q15049 377 aa7.3□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 ESCO1Q5FWF5 840 aa7.3□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa7.3□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 CAPN12Q6ZSI9 719 aa7.3□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 WAPLQ7Z5K2 1190 aa7.3□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 NUTM1Q86Y26 1132 aa7.3□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 STK11IPQ8N1F8 1099 aa7.3□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 PXYLP1Q8TE99 480 aa7.3□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 BORCS6Q96GS4 357 aa7.3□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 IWS1Q96ST2 819 aa7.3□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 SH3GLB2Q9NR46 395 aa7.3□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 LEMD3Q9Y2U8 911 aa7.3□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 TTLL5Q6EMB2 1281 aa7.29□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 MZT2AQ6P582 158 aa7.29□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 MAATS1Q7Z4T9 603 aa7.29□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 C11orf74Q86VG3 221 aa7.29□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 DGKHQ86XP1 1220 aa7.29□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 BRSK2Q8IWQ3 736 aa7.29□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa7.29□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 NKAIN3Q8N8D7 197 aa7.29□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 ITFG2Q969R8 447 aa7.29□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 TBC1D31Q96DN5 1066 aa7.29□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 SCLT1Q96NL6 688 aa7.29□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 USP25Q9UHP3 1055 aa7.29□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 RABL2BQ9UNT1 228 aa7.29□□□□□ -1.24
AC017078.1-201ENST00000416146 ERICH4A6NGS2 130 aa7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms