RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000408919.7

SH3BP5-203, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP5, Length 1,880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-203ENST00000408919 CHD1LQ86WJ1 897 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP5-203ENST00000408919 FBXO3Q9UK99 471 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP5-203ENST00000408919 SLX4Q8IY92 1834 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP5-203ENST00000408919 H0YIN7 160 aa22.05■■□□□ 1.12
SH3BP5-203ENST00000408919 TFCP2Q12800 502 aa22.05■■□□□ 1.12
SH3BP5-203ENST00000408919 MASTLQ96GX5 879 aa22.05■■□□□ 1.12
SH3BP5-203ENST00000408919 CRAMP1Q96RY5 1269 aa22.05■■□□□ 1.12
SH3BP5-203ENST00000408919 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.05■■□□□ 1.12
SH3BP5-203ENST00000408919 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SH3BP5-203ENST00000408919 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SH3BP5-203ENST00000408919 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SH3BP5-203ENST00000408919 PDE4AP27815 886 aa22.03■■□□□ 1.12
SH3BP5-203ENST00000408919 VGLL2Q8N8G2 317 aa22.03■■□□□ 1.12
SH3BP5-203ENST00000408919 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP22.03■■□□□ 1.124e-8■□□□□ 9.7
SH3BP5-203ENST00000408919 A0A0G2JLW4 131 aa22.03■■□□□ 1.12
SH3BP5-203ENST00000408919 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SH3BP5-203ENST00000408919 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SH3BP5-203ENST00000408919 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SH3BP5-203ENST00000408919 LRRC37AA6NMS7 1700 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP5-203ENST00000408919 DPEP1P16444 411 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP5-203ENST00000408919 KCNA3P22001 575 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP5-203ENST00000408919 METTL24Q5JXM2 366 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP5-203ENST00000408919 KLHL34Q8N239 644 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP5-203ENST00000408919 MINPP1Q9UNW1 487 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP5-203ENST00000408919 CHRNDQ07001 517 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP5-203ENST00000408919 STYK1Q6J9G0 422 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP5-203ENST00000408919 TAF5LO75529 589 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP5-203ENST00000408919 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SH3BP5-203ENST00000408919 CEP126Q9P2H0 1117 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP5-203ENST00000408919 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP5-203ENST00000408919 SNAP23O00161 211 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP5-203ENST00000408919 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
SH3BP5-203ENST00000408919 BBOX1O75936 387 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP5-203ENST00000408919 ALDH1B1P30837 517 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP5-203ENST00000408919 TNNI3KQ59H18 835 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP5-203ENST00000408919 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
SH3BP5-203ENST00000408919 CD2APQ9Y5K6 639 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP5-203ENST00000408919 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP5-203ENST00000408919 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SH3BP5-203ENST00000408919 PDE8BO95263 885 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP5-203ENST00000408919 TGFB2P61812 414 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP5-203ENST00000408919 OLFM4Q6UX06 510 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP5-203ENST00000408919 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
SH3BP5-203ENST00000408919 ZNF609O15014 1411 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP5-203ENST00000408919 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
SH3BP5-203ENST00000408919 AACSQ86V21 672 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP5-203ENST00000408919 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
SH3BP5-203ENST00000408919 LTBP1Q14766 1721 aa21.97■■□□□ 1.11
SH3BP5-203ENST00000408919 RGS3P49796 1198 aa21.97■■□□□ 1.11
SH3BP5-203ENST00000408919 TIMM10P62072 90 aa21.97■■□□□ 1.11
SH3BP5-203ENST00000408919 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
SH3BP5-203ENST00000408919 SALL3Q9BXA9 1300 aa21.97■■□□□ 1.11
SH3BP5-203ENST00000408919 CNKSR1Q969H4 720 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP5-203ENST00000408919 ARAP2Q8WZ64 1704 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP5-203ENST00000408919 A0A1B0GUL7 405 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP5-203ENST00000408919 NLGN2Q8NFZ4 835 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP5-203ENST00000408919 GPR108Q9NPR9 543 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP5-203ENST00000408919 WWC3Q9ULE0 1092 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP5-203ENST00000408919 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP5-203ENST00000408919 FGFR2P21802 821 aa21.95■■□□□ 1.1
SH3BP5-203ENST00000408919 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
SH3BP5-203ENST00000408919 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa21.94■■□□□ 1.1
SH3BP5-203ENST00000408919 SP8Q8IXZ3 490 aa21.94■■□□□ 1.1
SH3BP5-203ENST00000408919 GPSM2P81274 684 aa21.94■■□□□ 1.1
SH3BP5-203ENST00000408919 ATP2B3Q16720 1220 aa21.94■■□□□ 1.1
SH3BP5-203ENST00000408919 TSHZ3Q63HK5 1081 aa21.94■■□□□ 1.1
SH3BP5-203ENST00000408919 TMC4Q7Z404 712 aa21.94■■□□□ 1.1
SH3BP5-203ENST00000408919 DBNDD2Q9BQY9 259 aa21.94■■□□□ 1.1
SH3BP5-203ENST00000408919 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
SH3BP5-203ENST00000408919 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
SH3BP5-203ENST00000408919 ADORA1P30542 326 aa21.93■■□□□ 1.1
SH3BP5-203ENST00000408919 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
SH3BP5-203ENST00000408919 TTLL6Q8N841 843 aa21.93■■□□□ 1.1
SH3BP5-203ENST00000408919 C7orf43Q8WVR3 580 aa21.93■■□□□ 1.1
SH3BP5-203ENST00000408919 NEUROD6Q96NK8 337 aa21.93■■□□□ 1.1
SH3BP5-203ENST00000408919 AKAP2Q9Y2D5 859 aa21.93■■□□□ 1.1
SH3BP5-203ENST00000408919 UTRNP46939 3433 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP5-203ENST00000408919 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
SH3BP5-203ENST00000408919 ANKRD2Q9GZV1 360 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP5-203ENST00000408919 DUOX1Q9NRD9 1551 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP5-203ENST00000408919 PIM2Q9P1W9 311 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP5-203ENST00000408919 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP5-203ENST00000408919 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
SH3BP5-203ENST00000408919 XDHP47989 1333 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP5-203ENST00000408919 MX1P20591 662 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP5-203ENST00000408919 PDE1AP54750 535 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP5-203ENST00000408919 XAGE2Q96GT9 111 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP5-203ENST00000408919 KLRK1P26718 216 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP5-203ENST00000408919 LPIN2Q92539 896 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP5-203ENST00000408919 SNED1Q8TER0 1413 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP5-203ENST00000408919 C21orf2O43822 256 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP5-203ENST00000408919 UBE4AQ14139 1066 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP5-203ENST00000408919 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
SH3BP5-203ENST00000408919 PODXL2Q9NZ53 605 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP5-203ENST00000408919 ZNF804BA4D1E1 1349 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP5-203ENST00000408919 STAP2Q9UGK3 403 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP5-203ENST00000408919 POLLQ9UGP5 575 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP5-203ENST00000408919 SLC5A1P13866 664 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP5-203ENST00000408919 SYT17Q9BSW7 474 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP5-203ENST00000408919 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 148.1 ms