RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399207.5

SETD4-204, Transcript of SET domain containing 4, human

TSL 3 BASIC

Gene SETD4, Length 1,160 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SETD4-204	ENST00000399207		G3V3G9	751 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SETD4-204	ENST00000399207	ALDH1L1	O75891	902 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SETD4-204	ENST00000399207	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
SETD4-204	ENST00000399207	EPHX2	P34913	555 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SETD4-204	ENST00000399207	TNIP1	Q15025	636 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SETD4-204	ENST00000399207	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
SETD4-204	ENST00000399207	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SETD4-204	ENST00000399207	CHADL	Q6NUI6	762 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SETD4-204	ENST00000399207	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SETD4-204	ENST00000399207	GREM2	Q9H772	168 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SETD4-204	ENST00000399207	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SETD4-204	ENST00000399207	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
SETD4-204	ENST00000399207	GGA1	Q9UJY5	639 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SETD4-204	ENST00000399207	RTL9	Q8NET4	1388 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SETD4-204	ENST00000399207	COL4A5	P29400	1685 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SETD4-204	ENST00000399207	PITPNM1	O00562	1244 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SETD4-204	ENST00000399207	UFL1	O94874	794 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SETD4-204	ENST00000399207	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
SETD4-204	ENST00000399207	CXCL9	Q07325	125 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SETD4-204	ENST00000399207	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SETD4-204	ENST00000399207	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SETD4-204	ENST00000399207	LDHD	Q86WU2	507 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SETD4-204	ENST00000399207	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
SETD4-204	ENST00000399207	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
SETD4-204	ENST00000399207	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
SETD4-204	ENST00000399207	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
SETD4-204	ENST00000399207	POLL	Q9UGP5	575 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SETD4-204	ENST00000399207	PTPRC	P08575	1304 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SETD4-204	ENST00000399207	GRM8	O00222	908 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SETD4-204	ENST00000399207	RIMBP2	O15034	1052 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SETD4-204	ENST00000399207	ITGA6	P23229	1130 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SETD4-204	ENST00000399207	CASP7	P55210	303 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SETD4-204	ENST00000399207	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SETD4-204	ENST00000399207	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SETD4-204	ENST00000399207	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SETD4-204	ENST00000399207	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SETD4-204	ENST00000399207	XDH	P47989	1333 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SETD4-204	ENST00000399207	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SETD4-204	ENST00000399207	CSF1R	P07333	972 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SETD4-204	ENST00000399207	ATP2B4	P23634	1241 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SETD4-204	ENST00000399207	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SETD4-204	ENST00000399207	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SETD4-204	ENST00000399207	RAD17	O75943	681 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SETD4-204	ENST00000399207	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
SETD4-204	ENST00000399207	FAM161A	Q3B820	660 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SETD4-204	ENST00000399207	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
SETD4-204	ENST00000399207	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SETD4-204	ENST00000399207	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SETD4-204	ENST00000399207	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SETD4-204	ENST00000399207	COL4A1	P02462	1669 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SETD4-204	ENST00000399207	YDJC	A8MPS7	323 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SETD4-204	ENST00000399207	ECE2	O60344	883 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SETD4-204	ENST00000399207	POTEI	P0CG38	1075 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SETD4-204	ENST00000399207	POTEJ	P0CG39	1038 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SETD4-204	ENST00000399207	EPS15	P42566	896 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SETD4-204	ENST00000399207	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
SETD4-204	ENST00000399207	SCNN1D	P51172	638 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SETD4-204	ENST00000399207	DOK7	Q18PE1	504 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SETD4-204	ENST00000399207	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
SETD4-204	ENST00000399207	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SETD4-204	ENST00000399207	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SETD4-204	ENST00000399207	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SETD4-204	ENST00000399207	FOXO4	P98177	505 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SETD4-204	ENST00000399207	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SETD4-204	ENST00000399207	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SETD4-204	ENST00000399207	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SETD4-204	ENST00000399207	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
SETD4-204	ENST00000399207	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
SETD4-204	ENST00000399207	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SETD4-204	ENST00000399207	LTBP1	Q14766	1721 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SETD4-204	ENST00000399207	SPEF2	Q9C093	1822 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SETD4-204	ENST00000399207		H7C1D1	291 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SETD4-204	ENST00000399207	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
SETD4-204	ENST00000399207	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	13.8	□□□□□ -0.2
SETD4-204	ENST00000399207	CEP350	Q5VT06	3117 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SETD4-204	ENST00000399207	PSMD14	O00487	310 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SETD4-204	ENST00000399207	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
SETD4-204	ENST00000399207	KCNJ4	P48050	445 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SETD4-204	ENST00000399207	CNTROB	Q8N137	903 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SETD4-204	ENST00000399207	DPF2	Q92785	391 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SETD4-204	ENST00000399207	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
SETD4-204	ENST00000399207	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
SETD4-204	ENST00000399207	HTRA3	P83110	453 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SETD4-204	ENST00000399207	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
SETD4-204	ENST00000399207	PODN	Q7Z5L7	613 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SETD4-204	ENST00000399207	UTY	O14607	1347 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SETD4-204	ENST00000399207	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SETD4-204	ENST00000399207	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
SETD4-204	ENST00000399207	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
SETD4-204	ENST00000399207	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
SETD4-204	ENST00000399207	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
SETD4-204	ENST00000399207	CHRND	Q07001	517 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SETD4-204	ENST00000399207	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SETD4-204	ENST00000399207	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SETD4-204	ENST00000399207	MICALL2	Q8IY33	904 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SETD4-204	ENST00000399207	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SETD4-204	ENST00000399207	SUCLG2	Q96I99	432 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SETD4-204	ENST00000399207	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
SETD4-204	ENST00000399207	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SETD4-204	ENST00000399207	CREBZF	Q9NS37	354 aa		13.77	□□□□□ -0.21

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