RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375391.5

TMCO3-201, Transcript of transmembrane and coiled-coil domains 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMCO3, Length 2,132 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3-201ENST00000375391 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
TMCO3-201ENST00000375391 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
TMCO3-201ENST00000375391 SALL3Q9BXA9 1300 aa24.99■■□□□ 1.59
TMCO3-201ENST00000375391 TNNI3KQ59H18 835 aa24.99■■□□□ 1.59
TMCO3-201ENST00000375391 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa24.99■■□□□ 1.59
TMCO3-201ENST00000375391 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
TMCO3-201ENST00000375391 VGLL2Q8N8G2 317 aa24.98■■□□□ 1.59
TMCO3-201ENST00000375391 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
TMCO3-201ENST00000375391 SRGNP10124 158 aa24.98■■□□□ 1.59
TMCO3-201ENST00000375391 MTFR1LQ9H019 292 aa24.98■■□□□ 1.59
TMCO3-201ENST00000375391 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
TMCO3-201ENST00000375391 CHRNDQ07001 517 aa24.97■■□□□ 1.59
TMCO3-201ENST00000375391 NEUROD6Q96NK8 337 aa24.97■■□□□ 1.59
TMCO3-201ENST00000375391 DBNDD2Q9BQY9 259 aa24.97■■□□□ 1.59
TMCO3-201ENST00000375391 CEP126Q9P2H0 1117 aa24.97■■□□□ 1.59
TMCO3-201ENST00000375391 ADORA1P30542 326 aa24.97■■□□□ 1.59
TMCO3-201ENST00000375391 PDE1AP54750 535 aa24.97■■□□□ 1.59
TMCO3-201ENST00000375391 MINPP1Q9UNW1 487 aa24.97■■□□□ 1.59
TMCO3-201ENST00000375391 MX1P20591 662 aa24.96■■□□□ 1.59
TMCO3-201ENST00000375391 A0A1B0GUL7 405 aa24.95■■□□□ 1.59
TMCO3-201ENST00000375391 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.59
TMCO3-201ENST00000375391 GRAPQ13588 217 aa24.95■■□□□ 1.59
TMCO3-201ENST00000375391 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.59
TMCO3-201ENST00000375391 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.59
TMCO3-201ENST00000375391 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
TMCO3-201ENST00000375391 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
TMCO3-201ENST00000375391 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa24.95■■□□□ 1.58
TMCO3-201ENST00000375391 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
TMCO3-201ENST00000375391 C2CD5Q86YS7 1000 aa24.94■■□□□ 1.58
TMCO3-201ENST00000375391 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP24.94■■□□□ 1.588e-8■□□□□ 10.2
TMCO3-201ENST00000375391 LRP5O75197 1615 aa24.94■■□□□ 1.58
TMCO3-201ENST00000375391 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
TMCO3-201ENST00000375391 PDE8BO95263 885 aa24.94■■□□□ 1.58
TMCO3-201ENST00000375391 PTGER2P43116 358 aa24.94■■□□□ 1.58
TMCO3-201ENST00000375391 SGIP1Q9BQI5 828 aa24.94■■□□□ 1.58
TMCO3-201ENST00000375391 A0A0G2JLW4 131 aa24.92■■□□□ 1.58
TMCO3-201ENST00000375391 PDE6BP35913 854 aa24.92■■□□□ 1.58
TMCO3-201ENST00000375391 KLHL34Q8N239 644 aa24.92■■□□□ 1.58
TMCO3-201ENST00000375391 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
TMCO3-201ENST00000375391 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
TMCO3-201ENST00000375391 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
TMCO3-201ENST00000375391 KLRK1P26718 216 aa24.91■■□□□ 1.58
TMCO3-201ENST00000375391 PI4K2BQ8TCG2 481 aa24.91■■□□□ 1.58
TMCO3-201ENST00000375391 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
TMCO3-201ENST00000375391 FBXO3Q9UK99 471 aa24.91■■□□□ 1.58
TMCO3-201ENST00000375391 ATP2B3Q16720 1220 aa24.9■■□□□ 1.58
TMCO3-201ENST00000375391 ZNF609O15014 1411 aa24.9■■□□□ 1.58
TMCO3-201ENST00000375391 MROH5Q6ZUA9 1318 aa24.9■■□□□ 1.58
TMCO3-201ENST00000375391 XAGE2Q96GT9 111 aa24.89■■□□□ 1.58
TMCO3-201ENST00000375391 C10orf71Q711Q0 1435 aa24.88■■□□□ 1.57
TMCO3-201ENST00000375391 H0YIN7 160 aa24.88■■□□□ 1.57
TMCO3-201ENST00000375391 NPR1P16066 1061 aa24.88■■□□□ 1.57
TMCO3-201ENST00000375391 POLD1P28340 1107 aa24.88■■□□□ 1.57
TMCO3-201ENST00000375391 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
TMCO3-201ENST00000375391 MASTLQ96GX5 879 aa24.88■■□□□ 1.57
TMCO3-201ENST00000375391 FGFR2P21802 821 aa24.88■■□□□ 1.57
TMCO3-201ENST00000375391 TTC22Q5TAA0 569 aa24.88■■□□□ 1.57
TMCO3-201ENST00000375391 BOLA2Q9H3K6 86 aa24.88■■□□□ 1.57
TMCO3-201ENST00000375391 STAP2Q9UGK3 403 aa24.88■■□□□ 1.57
TMCO3-201ENST00000375391 DPEP1P16444 411 aa24.87■■□□□ 1.57
TMCO3-201ENST00000375391 CRAMP1Q96RY5 1269 aa24.87■■□□□ 1.57
TMCO3-201ENST00000375391 KCNA3P22001 575 aa24.86■■□□□ 1.57
TMCO3-201ENST00000375391 TXNRD3Q86VQ6 643 aa24.86■■□□□ 1.57
TMCO3-201ENST00000375391 OSBPL3Q9H4L5 887 aa24.86■■□□□ 1.57
TMCO3-201ENST00000375391 GPSM2P81274 684 aa24.86■■□□□ 1.57
TMCO3-201ENST00000375391 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
TMCO3-201ENST00000375391 ANP32EQ9BTT0 268 aa24.86■■□□□ 1.57
TMCO3-201ENST00000375391 GPR108Q9NPR9 543 aa24.86■■□□□ 1.57
TMCO3-201ENST00000375391 ECHDC1Q9NTX5 307 aa24.86■■□□□ 1.57
TMCO3-201ENST00000375391 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
TMCO3-201ENST00000375391 SCARF1Q14162 830 aa24.85■■□□□ 1.57
TMCO3-201ENST00000375391 PI16Q6UXB8 463 aa24.85■■□□□ 1.57
TMCO3-201ENST00000375391 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa24.85■■□□□ 1.57
TMCO3-201ENST00000375391 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
TMCO3-201ENST00000375391 SDSP20132 328 aa24.84■■□□□ 1.57
TMCO3-201ENST00000375391 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
TMCO3-201ENST00000375391 AKAP2Q9Y2D5 859 aa24.84■■□□□ 1.57
TMCO3-201ENST00000375391 CACNA1SQ13698 1873 aa24.84■■□□□ 1.57
TMCO3-201ENST00000375391 BBOX1O75936 387 aa24.83■■□□□ 1.57
TMCO3-201ENST00000375391 PHKA1P46020 1223 aa24.83■■□□□ 1.57
TMCO3-201ENST00000375391 BCAMP50895 628 aa24.83■■□□□ 1.57
TMCO3-201ENST00000375391 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
TMCO3-201ENST00000375391 GYG1P46976 350 aa24.83■■□□□ 1.57
TMCO3-201ENST00000375391 LPIN2Q92539 896 aa24.83■■□□□ 1.57
TMCO3-201ENST00000375391 SNRKQ9NRH2 765 aa24.83■■□□□ 1.57
TMCO3-201ENST00000375391 SLX4Q8IY92 1834 aa24.83■■□□□ 1.57
TMCO3-201ENST00000375391 C8orf34Q49A92 452 aa24.82■■□□□ 1.56
TMCO3-201ENST00000375391 RILPL2Q969X0 211 aa24.82■■□□□ 1.56
TMCO3-201ENST00000375391 CHGBP05060 677 aa24.81■■□□□ 1.56
TMCO3-201ENST00000375391 BMP2KLQ5H9B9 411 aa24.81■■□□□ 1.56
TMCO3-201ENST00000375391 GORABQ5T7V8 394 aa24.81■■□□□ 1.56
TMCO3-201ENST00000375391 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa24.8■■□□□ 1.56
TMCO3-201ENST00000375391 ALDH1B1P30837 517 aa24.8■■□□□ 1.56
TMCO3-201ENST00000375391 CCDC102BQ68D86 513 aa24.8■■□□□ 1.56
TMCO3-201ENST00000375391 NLGN2Q8NFZ4 835 aa24.8■■□□□ 1.56
TMCO3-201ENST00000375391 POLLQ9UGP5 575 aa24.8■■□□□ 1.56
TMCO3-201ENST00000375391 A0A1B0GUL6 1792 aa24.8■■□□□ 1.56
TMCO3-201ENST00000375391 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
TMCO3-201ENST00000375391 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa24.8■■□□□ 1.56
TMCO3-201ENST00000375391 TTC41PQ6P2S7 1318 aa24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 162.3 ms