RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa24.72■■□□□ 1.55
KCNQ1-202ENST00000335475 NEK1Q96PY6 1258 aa24.72■■□□□ 1.55
KCNQ1-202ENST00000335475 HELLSQ9NRZ9 838 aa24.72■■□□□ 1.55
KCNQ1-202ENST00000335475 BCL9O00512 1426 aa24.72■■□□□ 1.55
KCNQ1-202ENST00000335475 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
KCNQ1-202ENST00000335475 SLFNL1Q499Z3 407 aa24.71■■□□□ 1.55
KCNQ1-202ENST00000335475 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP24.71■■□□□ 1.55
KCNQ1-202ENST00000335475 MYH3P11055 1940 aa24.71■■□□□ 1.55
KCNQ1-202ENST00000335475 FIBPO43427 364 aa24.71■■□□□ 1.55
KCNQ1-202ENST00000335475 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
KCNQ1-202ENST00000335475 FBXO3Q9UK99 471 aa24.71■■□□□ 1.55
KCNQ1-202ENST00000335475 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
KCNQ1-202ENST00000335475 KIF6Q6ZMV9 814 aa24.7■■□□□ 1.55
KCNQ1-202ENST00000335475 STOX1Q6ZVD7 989 aa24.7■■□□□ 1.55
KCNQ1-202ENST00000335475 TSPY26PQ9H489 355 aa24.7■■□□□ 1.55
KCNQ1-202ENST00000335475 RIC1Q4ADV7 1423 aa24.7■■□□□ 1.54
KCNQ1-202ENST00000335475 PHF14O94880 888 aa24.7■■□□□ 1.54
KCNQ1-202ENST00000335475 CDC37L1Q7L3B6 337 aa24.7■■□□□ 1.54
KCNQ1-202ENST00000335475 DSCC1Q9BVC3 393 aa24.7■■□□□ 1.54
KCNQ1-202ENST00000335475 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa24.7■■□□□ 1.54
KCNQ1-202ENST00000335475 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
KCNQ1-202ENST00000335475 CCDC183Q5T5S1 534 aa24.69■■□□□ 1.54
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
KCNQ1-202ENST00000335475 CSF1RP07333 972 aa24.69■■□□□ 1.54
KCNQ1-202ENST00000335475 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
KCNQ1-202ENST00000335475 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC4A9Q96Q91 983 aa24.69■■□□□ 1.54
KCNQ1-202ENST00000335475 CCDC57Q2TAC2 916 aa24.68■■□□□ 1.54
KCNQ1-202ENST00000335475 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
KCNQ1-202ENST00000335475 GTF3C6Q969F1 213 aa24.68■■□□□ 1.54
KCNQ1-202ENST00000335475 MAST3O60307 1309 aa24.68■■□□□ 1.54
KCNQ1-202ENST00000335475 NUP98P52948 1817 aa24.67■■□□□ 1.54
KCNQ1-202ENST00000335475 MYH7P12883 1935 aa24.67■■□□□ 1.54
KCNQ1-202ENST00000335475 STARD3NLO95772 234 aa24.67■■□□□ 1.54
KCNQ1-202ENST00000335475 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM89AQ96GI7 184 aa24.67■■□□□ 1.54
KCNQ1-202ENST00000335475 CEP126Q9P2H0 1117 aa24.67■■□□□ 1.54
KCNQ1-202ENST00000335475 PDCP20941 246 aa24.67■■□□□ 1.54
KCNQ1-202ENST00000335475 CDHR2Q9BYE9 1310 aa24.67■■□□□ 1.54
KCNQ1-202ENST00000335475 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa24.67■■□□□ 1.54
KCNQ1-202ENST00000335475 DOT1LQ8TEK3 1739 aa24.67■■□□□ 1.54
KCNQ1-202ENST00000335475 NWD2Q9ULI1 1742 aa24.66■■□□□ 1.54
KCNQ1-202ENST00000335475 Q6ZUG5 572 aa24.66■■□□□ 1.54
KCNQ1-202ENST00000335475 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
KCNQ1-202ENST00000335475 ADORA1P30542 326 aa24.66■■□□□ 1.54
KCNQ1-202ENST00000335475 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa24.66■■□□□ 1.54
KCNQ1-202ENST00000335475 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
KCNQ1-202ENST00000335475 STK3Q13188 491 aa24.65■■□□□ 1.54
KCNQ1-202ENST00000335475 HLFQ16534 295 aa24.65■■□□□ 1.54
KCNQ1-202ENST00000335475 RNF214Q8ND24 703 aa24.65■■□□□ 1.54
KCNQ1-202ENST00000335475 AKAP11Q9UKA4 1901 aa24.64■■□□□ 1.53
KCNQ1-202ENST00000335475 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
KCNQ1-202ENST00000335475 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.53
KCNQ1-202ENST00000335475 HS1BP3Q53T59 392 aa24.64■■□□□ 1.53
KCNQ1-202ENST00000335475 XAGE2Q96GT9 111 aa24.64■■□□□ 1.53
KCNQ1-202ENST00000335475 NLRP10Q86W26 655 aa24.63■■□□□ 1.53
KCNQ1-202ENST00000335475 AKAP2Q9Y2D5 859 aa24.63■■□□□ 1.53
KCNQ1-202ENST00000335475 LRP5O75197 1615 aa24.63■■□□□ 1.53
KCNQ1-202ENST00000335475 M0R2C6 588 aa24.63■■□□□ 1.53
KCNQ1-202ENST00000335475 JAK2O60674 1132 aa24.63■■□□□ 1.53
KCNQ1-202ENST00000335475 ZSCAN30Q86W11 494 aa24.63■■□□□ 1.53
KCNQ1-202ENST00000335475 SYNE4Q8N205 404 aa24.63■■□□□ 1.53
KCNQ1-202ENST00000335475 A0A0G2JLW4 131 aa24.62■■□□□ 1.53
KCNQ1-202ENST00000335475 TTC6Q86TZ1 520 aa24.62■■□□□ 1.53
KCNQ1-202ENST00000335475 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
KCNQ1-202ENST00000335475 AGXT2Q9BYV1 514 aa24.62■■□□□ 1.53
KCNQ1-202ENST00000335475 ABCC12Q96J65 1359 aa24.62■■□□□ 1.53
KCNQ1-202ENST00000335475 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
KCNQ1-202ENST00000335475 FERMT3Q86UX7 667 aa24.61■■□□□ 1.53
KCNQ1-202ENST00000335475 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa24.61■■□□□ 1.53
KCNQ1-202ENST00000335475 MYH15Q9Y2K3 1946 aa24.61■■□□□ 1.53
KCNQ1-202ENST00000335475 ELP1O95163 1332 aa24.61■■□□□ 1.53
KCNQ1-202ENST00000335475 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
KCNQ1-202ENST00000335475 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
KCNQ1-202ENST00000335475 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
KCNQ1-202ENST00000335475 OSBP2Q969R2 916 aa24.61■■□□□ 1.53
KCNQ1-202ENST00000335475 LRRC2Q9BYS8 371 aa24.61■■□□□ 1.53
KCNQ1-202ENST00000335475 KRT85P78386 507 aa24.6■■□□□ 1.53
KCNQ1-202ENST00000335475 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
KCNQ1-202ENST00000335475 SCARF1Q14162 830 aa24.6■■□□□ 1.53
KCNQ1-202ENST00000335475 BRF1Q92994 677 aa24.6■■□□□ 1.53
KCNQ1-202ENST00000335475 SLIT2O94813 1529 aa24.6■■□□□ 1.53
KCNQ1-202ENST00000335475 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
KCNQ1-202ENST00000335475 GPTP24298 496 aa24.6■■□□□ 1.53
KCNQ1-202ENST00000335475 SCRN1Q12765 414 aa24.6■■□□□ 1.53
KCNQ1-202ENST00000335475 CCDC158Q5M9N0 1113 aa24.6■■□□□ 1.53
KCNQ1-202ENST00000335475 TTC39AQ5SRH9 613 aa24.6■■□□□ 1.53
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM173BQ6P4H8 233 aa24.6■■□□□ 1.53
KCNQ1-202ENST00000335475 KLHL34Q8N239 644 aa24.6■■□□□ 1.53
KCNQ1-202ENST00000335475 FUCA2Q9BTY2 467 aa24.6■■□□□ 1.53
KCNQ1-202ENST00000335475 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa24.6■■□□□ 1.53
KCNQ1-202ENST00000335475 KAT6BQ8WYB5 2073 aa24.59■■□□□ 1.53
KCNQ1-202ENST00000335475 FOXP2O15409 715 aa24.59■■□□□ 1.53
KCNQ1-202ENST00000335475 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa24.59■■□□□ 1.53
KCNQ1-202ENST00000335475 TTLL11Q8NHH1 800 aa24.59■■□□□ 1.53
KCNQ1-202ENST00000335475 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa24.59■■□□□ 1.53
KCNQ1-202ENST00000335475 NRAPQ86VF7 1730 aa24.59■■□□□ 1.53
KCNQ1-202ENST00000335475 PFKFB2O60825 505 aa24.59■■□□□ 1.53
KCNQ1-202ENST00000335475 E7EWF7 191 aa24.58■■□□□ 1.53
KCNQ1-202ENST00000335475 CTSWP56202 376 aa24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 154.2 ms