RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000269228.9

NPC1-201, Transcript of NPC intracellular cholesterol transporter 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NPC1, Length 5,157 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1-201ENST00000269228 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
NPC1-201ENST00000269228 EYA3Q99504 573 aa15.91■□□□□ 0.14
NPC1-201ENST00000269228 ABCC3O15438 1527 aa15.91■□□□□ 0.14
NPC1-201ENST00000269228 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa15.91■□□□□ 0.14
NPC1-201ENST00000269228 LDHBP07195 334 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
NPC1-201ENST00000269228 SUCLG2Q96I99 432 aa15.91■□□□□ 0.14
NPC1-201ENST00000269228 DEF6Q9H4E7 631 aa15.91■□□□□ 0.14
NPC1-201ENST00000269228 VEZTQ9HBM0 779 aa15.91■□□□□ 0.14
NPC1-201ENST00000269228 MCM9Q9NXL9 1143 aa15.91■□□□□ 0.14
NPC1-201ENST00000269228 PRR36Q9H6K5 1346 aa15.91■□□□□ 0.14
NPC1-201ENST00000269228 CBFA2T2O43439 604 aa15.91■□□□□ 0.14
NPC1-201ENST00000269228 GCKRQ14397 625 aa15.91■□□□□ 0.14
NPC1-201ENST00000269228 KLHL10Q6JEL2 608 aa15.91■□□□□ 0.14
NPC1-201ENST00000269228 APBA3O96018 575 aa15.9■□□□□ 0.14
NPC1-201ENST00000269228 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa15.9■□□□□ 0.14
NPC1-201ENST00000269228 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
NPC1-201ENST00000269228 KIF1BO60333 1816 aa15.9■□□□□ 0.14
NPC1-201ENST00000269228 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
NPC1-201ENST00000269228 Q6ZUG5 572 aa15.9■□□□□ 0.14
NPC1-201ENST00000269228 ARHGEF25Q86VW2 580 aa15.9■□□□□ 0.14
NPC1-201ENST00000269228 SMTNL1A8MU46 457 aa15.9■□□□□ 0.14
NPC1-201ENST00000269228 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 TMTC2Q8N394 836 aa15.89■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 DBNDD2Q9BQY9 259 aa15.89■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 UFL1O94874 794 aa15.89■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 FSIP1Q8NA03 581 aa15.89■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 ANAPC15P60006 121 aa15.89■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 PANK2Q9BZ23 570 aa15.89■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 PRC1O43663 620 aa15.89■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 TNNI3KQ59H18 835 aa15.89■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 CHST3Q7LGC8 479 aa15.89■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa15.89■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 GNAT2P19087 354 aa15.88■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 RTN1Q16799 776 aa15.88■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 EHMT1Q9H9B1 1298 aa15.88■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 CHMLP26374 656 aa15.88■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa15.88■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 UBA5Q9GZZ9 404 aa15.88■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 CFAP100Q494V2 611 aa15.87■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa15.87■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 CKAP2LQ8IYA6 745 aa15.87■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 CNNM3Q8NE01 707 aa15.87■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 TAF5LO75529 589 aa15.87■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 PLCG2P16885 1265 aa15.87■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 EIF5P55010 431 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 CCDC183Q5T5S1 534 aa15.87■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 PLA2R1Q13018 1463 aa15.87■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 USP6P35125 1406 aa15.87■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 CCP110O43303 1012 aa15.87■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 CCDC178Q5BJE1 867 aa15.87■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 BAG4O95429 457 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 DENND2AQ9ULE3 1009 aa15.87■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 XAGE2Q96GT9 111 aa15.86■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 CLEC11AQ9Y240 323 aa15.86■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 SCLT1Q96NL6 688 aa15.86■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 ALG1Q9BT22 464 aa15.86■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 MBD4O95243 580 aa15.86■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 C8orf34Q49A92 452 aa15.86■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 CREB3L3Q68CJ9 461 aa15.86■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa15.86■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 ANO10Q9NW15 660 aa15.86■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 SHROOM2Q13796 1616 aa15.86■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 CCDC171Q6TFL3 1326 aa15.86■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 ATP7BP35670 1465 aa15.86■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 AATKQ6ZMQ8 1374 aa15.86■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 TCIRG1Q13488 830 aa15.85■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 KDM5CP41229 1560 aa15.84■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 UBA7P41226 1012 aa15.84■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 CARD10Q9BWT7 1032 aa15.84■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 NEURL1BA8MQ27 555 aa15.84■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 TTLL7Q6ZT98 887 aa15.84■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 GGA1Q9UJY5 639 aa15.84■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 RBM25P49756 843 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa15.84■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 TET3O43151 1660 aa15.84■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 IDEP14735 1019 aa15.83■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 GNAQP50148 359 aa15.83■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 RUFY1Q96T51 708 aa15.83■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP15.83■□□□□ 0.13
NPC1-201ENST00000269228 BIN1O00499 593 aa15.83■□□□□ 0.12
NPC1-201ENST00000269228 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa15.83■□□□□ 0.12
NPC1-201ENST00000269228 CALML4Q96GE6 196 aa15.83■□□□□ 0.12
NPC1-201ENST00000269228 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
NPC1-201ENST00000269228 PPP4R3AQ6IN85 833 aa15.83■□□□□ 0.12
NPC1-201ENST00000269228 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
NPC1-201ENST00000269228 RAD50Q92878 1312 aa15.83■□□□□ 0.12
NPC1-201ENST00000269228 APOBRQ0VD83 1088 aa15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms