RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243893.10

UBE2C-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene UBE2C, Length 476 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2C-201ENST00000243893 TTLL6Q8N841 843 aa25.27■■□□□ 1.64
UBE2C-201ENST00000243893 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
UBE2C-201ENST00000243893 TAF1P21675 1872 aa25.27■■□□□ 1.64
UBE2C-201ENST00000243893 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
UBE2C-201ENST00000243893 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
UBE2C-201ENST00000243893 KIF1BPQ96EK5 621 aa25.26■■□□□ 1.63
UBE2C-201ENST00000243893 PIM2Q9P1W9 311 aa25.26■■□□□ 1.63
UBE2C-201ENST00000243893 SP8Q8IXZ3 490 aa25.25■■□□□ 1.63
UBE2C-201ENST00000243893 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa25.25■■□□□ 1.63
UBE2C-201ENST00000243893 SASH1O94885 1247 aa25.24■■□□□ 1.63
UBE2C-201ENST00000243893 RHPN1Q8TCX5 695 aa25.24■■□□□ 1.63
UBE2C-201ENST00000243893 MINPP1Q9UNW1 487 aa25.24■■□□□ 1.63
UBE2C-201ENST00000243893 LRRC37AA6NMS7 1700 aa25.23■■□□□ 1.63
UBE2C-201ENST00000243893 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa25.23■■□□□ 1.63
UBE2C-201ENST00000243893 LRRCC1Q9C099 1032 aa25.23■■□□□ 1.63
UBE2C-201ENST00000243893 ANKRD2Q9GZV1 360 aa25.23■■□□□ 1.63
UBE2C-201ENST00000243893 CEP126Q9P2H0 1117 aa25.23■■□□□ 1.63
UBE2C-201ENST00000243893 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
UBE2C-201ENST00000243893 SPEF2Q9C093 1822 aa25.22■■□□□ 1.63
UBE2C-201ENST00000243893 CHRNDQ07001 517 aa25.22■■□□□ 1.63
UBE2C-201ENST00000243893 METTL24Q5JXM2 366 aa25.22■■□□□ 1.63
UBE2C-201ENST00000243893 VGLL2Q8N8G2 317 aa25.22■■□□□ 1.63
UBE2C-201ENST00000243893 NLGN2Q8NFZ4 835 aa25.22■■□□□ 1.63
UBE2C-201ENST00000243893 C7orf43Q8WVR3 580 aa25.22■■□□□ 1.63
UBE2C-201ENST00000243893 SYT17Q9BSW7 474 aa25.22■■□□□ 1.63
UBE2C-201ENST00000243893 GPR108Q9NPR9 543 aa25.22■■□□□ 1.63
UBE2C-201ENST00000243893 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
UBE2C-201ENST00000243893 SLX4Q8IY92 1834 aa25.21■■□□□ 1.63
UBE2C-201ENST00000243893 PDE8BO95263 885 aa25.2■■□□□ 1.62
UBE2C-201ENST00000243893 NUCB1Q02818 461 aa25.2■■□□□ 1.62
UBE2C-201ENST00000243893 TFCP2Q12800 502 aa25.2■■□□□ 1.62
UBE2C-201ENST00000243893 GRIPAP1Q4V328 841 aa25.2■■□□□ 1.62
UBE2C-201ENST00000243893 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
UBE2C-201ENST00000243893 PODXL2Q9NZ53 605 aa25.2■■□□□ 1.62
UBE2C-201ENST00000243893 XDHP47989 1333 aa25.19■■□□□ 1.62
UBE2C-201ENST00000243893 SOGA3Q5TF21 947 aa25.19■■□□□ 1.62
UBE2C-201ENST00000243893 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
UBE2C-201ENST00000243893 AKAP2Q9Y2D5 859 aa25.19■■□□□ 1.62
UBE2C-201ENST00000243893 APBB1O00213 710 aa25.18■■□□□ 1.62
UBE2C-201ENST00000243893 ANKRD45Q5TZF3 282 aa25.18■■□□□ 1.62
UBE2C-201ENST00000243893 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
UBE2C-201ENST00000243893 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
UBE2C-201ENST00000243893 A0A1B0GUL6 1792 aa25.16■■□□□ 1.62
UBE2C-201ENST00000243893 UBE4AQ14139 1066 aa25.16■■□□□ 1.62
UBE2C-201ENST00000243893 CHD1LQ86WJ1 897 aa25.16■■□□□ 1.62
UBE2C-201ENST00000243893 LEMD3Q9Y2U8 911 aa25.16■■□□□ 1.62
UBE2C-201ENST00000243893 CACNA1SQ13698 1873 aa25.15■■□□□ 1.62
UBE2C-201ENST00000243893 ZNF609O15014 1411 aa25.15■■□□□ 1.62
UBE2C-201ENST00000243893 SNED1Q8TER0 1413 aa25.15■■□□□ 1.62
UBE2C-201ENST00000243893 FGFR2P21802 821 aa25.15■■□□□ 1.62
UBE2C-201ENST00000243893 GPSM2P81274 684 aa25.15■■□□□ 1.62
UBE2C-201ENST00000243893 TNNI3KQ59H18 835 aa25.15■■□□□ 1.62
UBE2C-201ENST00000243893 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
UBE2C-201ENST00000243893 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa25.15■■□□□ 1.62
UBE2C-201ENST00000243893 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa25.15■■□□□ 1.62
UBE2C-201ENST00000243893 LTBP1Q14766 1721 aa25.15■■□□□ 1.62
UBE2C-201ENST00000243893 ATP2B4P23634 1241 aa25.14■■□□□ 1.62
UBE2C-201ENST00000243893 ATP2B3Q16720 1220 aa25.14■■□□□ 1.62
UBE2C-201ENST00000243893 CCDC93Q567U6 631 aa25.14■■□□□ 1.62
UBE2C-201ENST00000243893 MPNDQ8N594 471 aa25.14■■□□□ 1.62
UBE2C-201ENST00000243893 LPIN2Q92539 896 aa25.14■■□□□ 1.62
UBE2C-201ENST00000243893 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa25.14■■□□□ 1.62
UBE2C-201ENST00000243893 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
UBE2C-201ENST00000243893 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
UBE2C-201ENST00000243893 C21orf2O43822 256 aa25.13■■□□□ 1.61
UBE2C-201ENST00000243893 TAF5LO75529 589 aa25.13■■□□□ 1.61
UBE2C-201ENST00000243893 RTKN2Q8IZC4 609 aa25.13■■□□□ 1.61
UBE2C-201ENST00000243893 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
UBE2C-201ENST00000243893 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
UBE2C-201ENST00000243893 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
UBE2C-201ENST00000243893 GGA1Q9UJY5 639 aa25.12■■□□□ 1.61
UBE2C-201ENST00000243893 BCS1LQ9Y276 419 aa25.12■■□□□ 1.61
UBE2C-201ENST00000243893 ZNF804BA4D1E1 1349 aa25.12■■□□□ 1.61
UBE2C-201ENST00000243893 A0A1B0GUL7 405 aa25.11■■□□□ 1.61
UBE2C-201ENST00000243893 SLC5A1P13866 664 aa25.11■■□□□ 1.61
UBE2C-201ENST00000243893 KCNJ4P48050 445 aa25.11■■□□□ 1.61
UBE2C-201ENST00000243893 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
UBE2C-201ENST00000243893 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
UBE2C-201ENST00000243893 SLC51AQ86UW1 340 aa25.11■■□□□ 1.61
UBE2C-201ENST00000243893 AACSQ86V21 672 aa25.11■■□□□ 1.61
UBE2C-201ENST00000243893 LNPKQ9C0E8 428 aa25.11■■□□□ 1.61
UBE2C-201ENST00000243893 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa25.11■■□□□ 1.61
UBE2C-201ENST00000243893 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
UBE2C-201ENST00000243893 OLFM4Q6UX06 510 aa25.1■■□□□ 1.61
UBE2C-201ENST00000243893 TBC1D16Q8TBP0 767 aa25.1■■□□□ 1.61
UBE2C-201ENST00000243893 DUOX1Q9NRD9 1551 aa25.1■■□□□ 1.61
UBE2C-201ENST00000243893 UFL1O94874 794 aa25.09■■□□□ 1.61
UBE2C-201ENST00000243893 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
UBE2C-201ENST00000243893 SUPT20HQ8NEM7 779 aa25.09■■□□□ 1.61
UBE2C-201ENST00000243893 PSMD1Q99460 953 aa25.09■■□□□ 1.61
UBE2C-201ENST00000243893 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
UBE2C-201ENST00000243893 TIMM10P62072 90 aa25.08■■□□□ 1.61
UBE2C-201ENST00000243893 POLLQ9UGP5 575 aa25.08■■□□□ 1.61
UBE2C-201ENST00000243893 MED23Q9ULK4 1368 aa25.07■■□□□ 1.6
UBE2C-201ENST00000243893 ARAP2Q8WZ64 1704 aa25.07■■□□□ 1.6
UBE2C-201ENST00000243893 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
UBE2C-201ENST00000243893 SALL3Q9BXA9 1300 aa25.07■■□□□ 1.6
UBE2C-201ENST00000243893 IRS2Q9Y4H2 1338 aa25.07■■□□□ 1.6
UBE2C-201ENST00000243893 C6orf229H3BNL8 230 aa25.06■■□□□ 1.6
UBE2C-201ENST00000243893 SNAP23O00161 211 aa25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms