RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243108.4

HOXC6-201, Transcript of homeobox C6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC6, Length 1,733 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6-201ENST00000243108 SUPT20HQ8NEM7 779 aa21.83■■□□□ 1.09
HOXC6-201ENST00000243108 CDHR2Q9BYE9 1310 aa21.83■■□□□ 1.08
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HOXC6-201ENST00000243108 RPS8P62241 208 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
HOXC6-201ENST00000243108 GPSM2P81274 684 aa21.83■■□□□ 1.08
HOXC6-201ENST00000243108 KIAA2012Q0VF49 1180 aa21.83■■□□□ 1.08
HOXC6-201ENST00000243108 EPHX2P34913 555 aa21.82■■□□□ 1.08
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HOXC6-201ENST00000243108 POLLQ9UGP5 575 aa21.81■■□□□ 1.08
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HOXC6-201ENST00000243108 KCNQ5Q9NR82 932 aa21.75■■□□□ 1.07
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HOXC6-201ENST00000243108 CLEC11AQ9Y240 323 aa21.75■■□□□ 1.07
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HOXC6-201ENST00000243108 PLA2G12BQ9BX93 195 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXC6-201ENST00000243108 ITPRIPQ8IWB1 547 aa21.72■■□□□ 1.07
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HOXC6-201ENST00000243108 UFL1O94874 794 aa21.7■■□□□ 1.06
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HOXC6-201ENST00000243108 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
HOXC6-201ENST00000243108 ITGA6P23229 1130 aa21.66■■□□□ 1.06
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HOXC6-201ENST00000243108 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
HOXC6-201ENST00000243108 EPHA10Q5JZY3 1008 aa21.66■■□□□ 1.06
HOXC6-201ENST00000243108 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
HOXC6-201ENST00000243108 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
HOXC6-201ENST00000243108 A0A1B0GUL6 1792 aa21.65■■□□□ 1.06
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