RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027009.10

Casp12-201, Transcript of Caspase-12, mouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Casp12, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fbxo11	Q7TPD1	930 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dzip1	Q8BMD2	852 aa		4.93	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Hgh1	Q8C3I8	393 aa		4.93	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dnajc22	Q8CHS2	339 aa		4.93	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Hs2st1	Q8R3H7	356 aa		4.93	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mypop	Q8R4U1	393 aa		4.93	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Grpel1	Q99LP6	217 aa		4.93	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Thumpd2	Q9CZB3	528 aa		4.93	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Krtap5-3	Q9D226	196 aa		4.93	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Phf14	Q9D4H9	881 aa		4.93	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ttll5	Q8CHB8	1328 aa		4.93	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm4871	D3Z0W7	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Vamp4	O70480	141 aa		4.93	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tie1	Q06806	1134 aa		4.93	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm29609	Q3UU56	907 aa		4.93	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Eef2kmt	Q3UZW7	335 aa		4.93	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Atp1a2	Q6PIE5	1020 aa		4.93	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gtf3c2	Q8BL74	907 aa		4.93	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Lmod1	Q8BVA4	595 aa		4.93	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Bicdl2	Q8CHW5	507 aa		4.93	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gtse1	Q8R080	741 aa		4.93	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Nup133	Q8R0G9	1155 aa		4.93	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rpl17	Q9CPR4	184 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Chic2	Q9D9G3	165 aa		4.93	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009		Q9DAQ4	598 aa		4.93	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fbxw5	Q9QXW2	573 aa		4.93	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Magea2	Q9R2A2	320 aa		4.93	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Col17a1	Q07563	1470 aa		4.93	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Kif28p	D3YXS5	1028 aa		4.93	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tcp10c	E9Q046	482 aa		4.93	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tdrd5	Q5VCS6	1040 aa		4.93	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sik1	Q60670	779 aa		4.93	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ppp4r3a	Q6P2K6	820 aa		4.93	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Zbtb39	Q6PDK0	712 aa		4.93	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gabbr2	Q80T41	940 aa		4.93	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Smc2	Q8CG48	1191 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Eva1b	Q8K2Y3	164 aa		4.93	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cdhr1	Q8VHP6	859 aa		4.93	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rbm43	Q99J64	343 aa		4.93	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Psmd6	Q99JI4	389 aa		4.93	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pdxdc1	Q99K01	787 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ccdc47	Q9D024	483 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Lrriq1	Q0P5X1	1673 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Kif1c	O35071	1100 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Plaa	P27612	794 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mc3r	P33033	323 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Stat3	P42227	770 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Irf3	P70671	419 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Nkain3	Q3URJ8	181 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gucy2f	Q5SDA5	1108 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tmc4	Q7TQ65	694 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gorab	Q8BRM2	368 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Crebrf	Q8CDG5	640 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Myrip	Q8K3I4	856 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mylk2	Q8VCR8	613 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gtf2h3	Q8VD76	309 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Edem1	Q925U4	652 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ngrn	Q99KS2	293 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Get4	Q9D1H7	327 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Uvssa	Q9D479	717 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Espn	Q9ET47	871 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Nos2	P29477	1144 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sept2	P42208	361 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Usp5	P56399	858 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rbm20	Q3UQS8	1199 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Spire2	Q8K1S6	718 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tmcc3	Q8R310	477 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Kdm4b	Q91VY5	1086 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ndufb9	Q9CQJ8	179 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Wdr45b	Q9CR39	344 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mrgbp	Q9DAT2	204 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Unc13a	Q4KUS2	1712 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fam171a2	A2A699	822 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Klhl41	A2AUC9	606 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Parp1	P11103	1013 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Inf2	Q0GNC1	1273 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Perm1	Q149B8	807 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Slc16a10	Q3U9N9	512 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Krtap4-1	Q3UUY3	169 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sugp1	Q8CH02	643 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Shtn1	Q8K2Q9	631 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Scrn2	Q8VCA8	425 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sytl1	Q99N80	567 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ift22	Q9DAI2	185 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Igtp	Q9DCE9	423 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Erbb4	Q61527	1308 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Eif4g3	Q80XI3	1579 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Csta	P56567	97 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Renbp	P82343	430 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mre11	Q61216	706 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Agtpbp1	Q641K1	1218 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ldhal6b	Q8BVP2	382 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fam221b	Q8C627	487 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fam193a	Q8CGI1	1231 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rtfdc1	Q99K95	307 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pih1d1	Q9CQJ2	290 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Zcchc11	B2RX14	1644 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Purb	O35295	324 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tnnt1	O88346	262 aa		4.9	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Usp25	P57080	1055 aa		4.9	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 107.6 ms