RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 KCNJ15Q99712 375 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 SPRY4Q9C004 299 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 PROK2Q9HC23 129 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 B3GAT1Q9P2W7 334 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 MALT1Q9UDY8 824 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 NCKAP5O14513 1909 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 A0A087WV48 116 aa7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 A0A087WZY1 265 aa7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 ACOD1A6NK06 481 aa7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM212A6NML5 194 aa7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM127O75204 238 aa7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 MT-CO3P00414 261 aa7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 PAHP00439 452 aa7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 CCL3P10147 92 aa7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 TCN2P20062 427 aa7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 P2RY4P51582 365 aa7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 ADAM8P78325 824 aa7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 FOXK1P85037 733 aa7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 C19orf57Q0VDD7 668 aa7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 CHAF1BQ13112 559 aa7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 MADCAM1Q13477 382 aa7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 SLC17A1Q14916 467 aa7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 MEP1BQ16820 701 aa7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 CDCP2Q5VXM1 449 aa7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 TMPRSS12Q86WS5 348 aa7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM156Q8N614 296 aa7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 SAMD12Q8N8I0 201 aa7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF454Q8N9F8 522 aa7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 SLC26A10Q8NG04 563 aa7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 CT55Q8WUE5 264 aa7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 FOXN4Q96NZ1 517 aa7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 MED29Q9NX70 200 aa7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 KLHL13Q9P2N7 655 aa7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 PMS2P1A4D2B8 440 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 PDCD5O14737 125 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 SNPHO15079 494 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 PLA2G10O15496 165 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF254O75437 659 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF432O94892 652 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 SPARCP09486 303 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 ICAM2P13598 275 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 TALDO1P37837 337 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 CD97P48960 835 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 CCR9P51686 369 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 RPS18P62269 152 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 SSPNQ14714 243 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 PCK2Q16822 640 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 TEX30Q5JUR7 227 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 SLC22A10Q63ZE4 541 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 LRRN1Q6UXK5 716 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 PRSS35Q8N3Z0 413 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 IL17RDQ8NFM7 739 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 OR4M1Q8NGD0 313 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 OR5M1Q8NGP8 315 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 RNF128Q8TEB7 428 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 TXNDC15Q96J42 360 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 C4orf45Q96LM5 186 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 GFI1Q99684 422 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 SLC22A4Q9H015 551 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 COMMD4Q9H0A8 199 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 ELOVL3Q9HB03 270 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 HPF1Q9NWY4 346 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 PISDQ9UG56 409 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 SPATA2Q9UM82 520 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 ACACAQ13085 2346 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 A0A1B0GTH9 108 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 A0A1W2PNR3 127 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 HPP00738 406 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 RAF1P04049 648 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 HRGP04196 525 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 JMJD7P0C870 316 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 MAGEB1P43366 347 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 BIDP55957 195 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 FMODQ06828 376 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 FOXC1Q12948 553 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 OTPQ5XKR4 325 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 TRIQKQ629K1 86 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-208ENST00000502484 SPATC1Q76KD6 591 aa7.33□□□□□ -1.24
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