RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497210.5

CTPS1-211, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 463 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-211ENST00000497210 THEM4Q5T1C6 240 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 NXNL2Q5VZ03 156 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM211Q6ICI0 200 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 ACSM5Q6NUN0 579 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 MTFR2Q6P444 385 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF100Q8IYN0 542 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 ENTHD1Q8IYW4 607 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 MARVELD2Q8N4S9 558 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 FAM26EQ8N5C1 309 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 TCEANCQ8N8B7 351 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 POMGNT2Q8NAT1 580 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 SLC37A3Q8NCC5 494 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 PROKR2Q8NFJ6 384 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 CHAC2Q8WUX2 184 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 RBP7Q96R05 134 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 OR2M2Q96R28 347 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 NMNAT3Q96T66 252 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 SFXN3Q9BWM7 321 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 ULBP2Q9BZM5 246 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 SYT4Q9H2B2 425 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 RASSF1Q9NS23 344 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 GPR160Q9UJ42 338 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 RNF6Q9Y252 685 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 MED12Q93074 2177 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 HSPB2A8KAH6 182 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 C22orf46C9J442 243 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF587BE7ETH6 402 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 E9PLN8 166 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 TGM6O95932 706 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 KLK2P20151 261 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 CA7P43166 264 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF84P51523 738 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 CDH11P55287 796 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 GLO1Q04760 184 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 CAMK2DQ13557 499 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 STK11Q15831 433 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 HSPB2Q16082 182 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 KLHL12Q53G59 568 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 SLC25A30Q5SVS4 291 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 PLBD1Q6P4A8 553 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 GCNT2Q8N0V5 402 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM123Q8N131 208 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 C9orf106Q8NAJ2 232 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 OR6K6Q8NGW6 343 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 IL4I1Q96RQ9 567 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 VKORC1Q9BQB6 163 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 LINC00470Q9BZP3 86 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 RACGAP1Q9H0H5 632 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 ENKD1Q9H0I2 346 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 SCN3BQ9NY72 215 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 UPB1Q9UBR1 384 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 TINAGQ9UJW2 476 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 MOKQ9UQ07 419 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 GPR52Q9Y2T5 361 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 LRRC42Q9Y546 428 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 FAM215AQ9Y5M1 114 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 FKBP7Q9Y680 259 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 EPG5Q9HCE0 2579 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-211ENST00000497210 SLC22A23A1A5C7 686 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 H7C1C5 153 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 M0R129 80 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 FAM20BO75063 409 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 TRMUO75648 421 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF432O94892 652 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 TNFAIP8O95379 198 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 SLC2A10O95528 541 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 CCDC159P0C7I6 412 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 SPI1P17947 270 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 HTR1FP30939 366 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 OPRM1P35372 400 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 SELENOPP49908 381 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 CXCR4P61073 352 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 ISL1P61371 349 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 LCN6P62502 163 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 CARD17Q5XLA6 110 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 DOLPP1Q86YN1 238 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 CPOQ8IVL8 374 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 TUSC5Q8IXB3 177 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 C20orf196Q8IYI0 205 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 UBE2J2Q8N2K1 259 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF786Q8N393 782 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-211ENST00000497210 SYT14Q8NB59 555 aa8.58□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.4 ms