RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	ZP4	Q12836	540 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	HIST3H3	Q16695	136 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	DUSP7	Q16829	419 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	SPRN	Q5BIV9	151 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF101	Q8IZC7	436 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	HIPK4	Q8NE63	616 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF607	Q96SK3	696 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF426	Q9BUY5	554 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	SLCO1B3	Q9NPD5	702 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC167	Q9P0B6	97 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	RAB21	Q9UL25	225 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338		J3QLI3	93 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	SERPINB7	O75635	380 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	PRSS23	O95084	383 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	OR6A2	O95222	327 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	IGHV1-46	P01743	117 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	IGHV3-13	P01766	116 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	ANPEP	P15144	967 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	MPV17	P39210	176 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	WNT5A	P41221	380 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC18A1	P54219	525 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	MAGOH	P61326	146 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	SELPLG	Q14242	412 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC36A2	Q495M3	483 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	MMEL1	Q495T6	779 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	LRRC18	Q8N456	261 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	TEX29	Q8N6K0	151 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	NOXO1	Q8NFA2	376 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	OR1J1	Q8NGS3	322 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	VANGL1	Q8TAA9	524 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	MCHR2	Q969V1	340 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	JMJD8	Q96S16	334 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	SEPHS2	Q99611	448 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	C1orf198	Q9H425	327 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	RNF121	Q9H920	327 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	MEPE	Q9NQ76	525 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	NANS	Q9NR45	359 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	GPR160	Q9UJ42	338 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF229	Q9UJW7	825 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC7A7	Q9UM01	511 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	TMPRSS2	O15393	492 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	MGRN1	O60291	552 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC2A10	O95528	541 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	IGHG1	P01857	330 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	CD247	P20963	164 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	RAD52	P43351	418 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	IDH3A	P50213	366 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF81	P51508	661 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	MMP15	P51511	669 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	CLRN1	P58418	232 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	MTPN	P58546	118 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	SELENOV	P59797	346 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	LCN2	P80188	198 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	HFE	Q30201	348 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	NRN1L	Q496H8	165 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	PRR31	Q5SQ13	230 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	SYT14	Q8NB59	555 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	NANP	Q8TBE9	248 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-233	ENST00000602338	ASB10	Q8WXI3	467 aa		10.12	□□□□□ -0.79

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62 ms