RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482310.5

HDAC1-208, Transcript of histone deacetylase 1, human

TSL 5

Gene HDAC1, Length 779 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC1-208	ENST00000482310	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	RBP7	Q96R05	134 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	ALG12	Q9BV10	488 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	TEX12	Q9BXU0	123 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	VCX	Q9H320	206 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	ZAR1L	A6NP61	321 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	ARPC3	O15145	178 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	SURF4	O15260	269 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	IDH3B	O43837	385 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	SLC16A7	O60669	478 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	CLU	P10909	449 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	CTLA4	P16410	223 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	MPG	P29372	298 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	PYCR1	P32322	319 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	UGT2B10	P36537	528 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	CAPZA2	P47755	286 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	ZNF84	P51523	738 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	TUBA1B	P68363	451 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	TUBA4A	P68366	448 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	TFF3	Q07654	80 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	TUBA1A	Q71U36	451 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	OR52N5	Q8NH56	324 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	S100PBP	Q96BU1	408 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	LRRC46	Q96FV0	321 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	LRR1	Q96L50	414 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	NUAK2	Q9H093	628 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	NPDC1	Q9NQX5	325 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	SH3D21	A4FU49	640 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	WIPF3	A6NGB9	483 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	DCTN6	O00399	190 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	DHH	O43323	396 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	PRKY	O43930	277 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	CLDN1	O95832	211 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	HMGN1	P05114	100 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	COX5A	P20674	150 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	AQP4	P55087	323 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	SGCA	Q16586	387 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	KLHL12	Q53G59	568 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	THEM4	Q5T1C6	240 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	LRRC18	Q8N456	261 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	LINC01560	Q8TB33	94 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	FOXB1	Q99853	325 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	ACTR6	Q9GZN1	396 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	CMC2	Q9NRP2	79 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	CENPBD1	B2RD01	187 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	C16orf97	H3BN30	126 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	DLGAP1	O14490	977 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	MPZL1	O95297	269 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	CLIC3	O95833	236 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	HLA-DQA2	P01906	255 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	NR2C1	P13056	603 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	HOXC12	P31275	282 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	P2RY6	Q15077	328 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	HIST3H3	Q16695	136 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	MEP1B	Q16820	701 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC1-208	ENST00000482310	C12orf73	Q69YU5	71 aa		11.61	□□□□□ -0.55

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