RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516584.1

RNU6-1004P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1004, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1004P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1004P-201ENST00000516584 AQP2P41181 271 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TNFSF9P41273 254 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KIR2DS4P43632 304 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RORCP51449 518 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC25A1P53007 311 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PSMD5Q16401 504 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C11orf71Q6IPW1 123 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF343Q6P1L6 599 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CNIH2Q6PI25 160 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CACNG8Q8WXS5 425 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PSMB7Q99436 277 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HIST1H4GQ99525 98 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRIM51Q9BSJ1 452 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CHID1Q9BWS9 393 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SIAEQ9HAT2 523 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 AKNAQ7Z591 1439 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MSH6P52701 1360 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 A0A087WYN8 130 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NDUFAF8A1L188 74 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PRSS44E7EML9 344 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PLPP1O14494 284 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC19A2O60779 497 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP3.78□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ETHE1O95571 254 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCL2P13500 99 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RPL34P49207 117 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ATP6V0D1P61421 351 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GGTLC2Q14390 218 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ANGPT1Q15389 498 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SYCP1Q15431 976 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HSP90B2PQ58FF3 399 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 VAX1Q5SQQ9 334 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ERICH5Q6P6B1 374 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TFAP2EQ6VUC0 442 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PRSS41Q7RTY9 318 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 COMTD1Q86VU5 262 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GATSQ8NAP1 163 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR9G1Q8NH87 305 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM131CQ96AQ9 280 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TSG101Q99816 390 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C20orf85Q9H1P6 137 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SPACA1Q9HBV2 294 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CALYQ9NYX4 217 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DCDC2Q9UHG0 476 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CENPXA8MT69 81 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-1004P-201ENST00000516584 A8MUA0 341 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PDZK1P1A8MUH7 402 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ERVV-1B6SEH8 477 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C12orf77C9JDV5 145 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ENTPD5O75356 428 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LSM8O95777 96 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC26A3P40879 764 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RFC3P40938 356 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GLP1RP43220 463 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP3.77□□□□□ -1.81
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CSNK1G2P78368 415 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SP4Q02446 784 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF92Q03936 586 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ATP6AP1Q15904 470 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RPEL1Q2QD12 228 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C1orf146Q5VVC0 180 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PDPK2PQ6A1A2 396 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF620Q6ZNG0 422 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NDUFAF7Q7L592 441 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM220AQ7Z4H9 259 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SNX20Q7Z614 316 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CDC20BQ86Y33 519 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMEM252Q8N6L7 170 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MNS1Q8NEH6 495 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR10G3Q8NGC4 313 aa3.77□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms