RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 SARAFQ96BY9 339 aa15.62■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 OR5M11Q96RB7 305 aa15.62■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 MENTQ9BUN1 341 aa15.62■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 CMC2Q9NRP2 79 aa15.62■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa15.62■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 FBXO7Q9Y3I1 522 aa15.62■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 ARGFXA6NJG6 315 aa15.62■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 I6L893 689 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 DOK2O60496 412 aa15.62■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 PRAMEF4O60810 478 aa15.62■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 SBK3P0C264 359 aa15.62■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 MSR1P21757 451 aa15.62■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP15.62■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 SDHAP31040 664 aa15.62■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 ISL1P61371 349 aa15.62■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 DMWDQ09019 674 aa15.62■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 RUNX2Q13950 521 aa15.62■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 ZNF620Q6ZNG0 422 aa15.62■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 TSLPQ969D9 159 aa15.62■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 RAB22AQ9UL26 194 aa15.62■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 ACHEP22303 614 aa15.62■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 VHLLQ6RSH7 139 aa15.62■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 Q6ZS52 159 aa15.62■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 S100A7AQ86SG5 101 aa15.62■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 MRGPRX4Q96LA9 322 aa15.62■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 FAM166BA8MTA8 275 aa15.62■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 SULT1B1O43704 296 aa15.62■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 PAPLNO95428 1278 aa15.62■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 SBK2P0C263 348 aa15.62■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 TPT1P13693 172 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 SLC10A1Q14973 349 aa15.62■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 BCL2A1Q16548 175 aa15.62■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 HLA-BQ31612 363 aa15.62■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 ZMAT1Q5H9K5 638 aa15.62■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 NANOGP1Q8N7R0 232 aa15.62■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 LGALS14Q8TCE9 139 aa15.62■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 MRGPRX3Q96LB0 322 aa15.62■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 TRIM64BA6NI03 449 aa15.61■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 SGCEO43556 437 aa15.61■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 PIAS2O75928 621 aa15.61■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 SELEP16581 610 aa15.61■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 NAGAP17050 411 aa15.61■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 RPS23P62266 143 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 SYT14P1Q58G82 188 aa15.61■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 Q6ZTK2 550 aa15.61■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 DOK3Q7L591 496 aa15.61■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 WDSUB1Q8N9V3 476 aa15.61■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 LIPHQ8WWY8 451 aa15.61■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 MOB1AQ9H8S9 216 aa15.61■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 LRFN1Q9P244 771 aa15.61■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa15.61■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa15.61■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 A0A1W2PPE2 198 aa15.61■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 A0A1W2PR64 198 aa15.61■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 A0A1W2PRV1 198 aa15.61■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 C4orf47A7E2U8 309 aa15.61■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 BLOC1S1P78537 153 aa15.61■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 GALEQ14376 348 aa15.61■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 WDR5BQ86VZ2 330 aa15.61■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 OR4N2Q8NGD1 307 aa15.61■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 OR14A2Q96R54 314 aa15.61■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 SELENOIQ9C0D9 397 aa15.61■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 COQ3Q9NZJ6 369 aa15.61■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 CCDC187A0A096LP49 1063 aa15.61■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 A6NIN4 97 aa15.61■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 NCR1O76036 304 aa15.61■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 APOC3P02656 99 aa15.61■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 TUBG1P23258 451 aa15.61■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 THEM4Q5T1C6 240 aa15.61■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 GAB3Q8WWW8 586 aa15.61■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 A0A0A6YYD5 115 aa15.61■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 PRRG2O14669 202 aa15.61■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 TATDN3Q17R31 274 aa15.61■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 COL24A1Q17RW2 1714 aa15.61■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 ZNF683Q8IZ20 524 aa15.61■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 OR56B2PQ8NGI1 322 aa15.61■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 FGGYQ96C11 551 aa15.61■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 SRPXP78539 464 aa15.6■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa15.6■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 TAAR9Q96RI9 348 aa15.6■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 TNFSF15O95150 251 aa15.6■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 ALG14Q96F25 216 aa15.6■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 KIF25Q9UIL4 384 aa15.6■□□□□ 0.09
NISCH-213ENST00000489895 UBR3Q6ZT12 1888 aa15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.7 ms