RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544361.1

QKI-213, Transcript of QKI, KH domain containing RNA binding, human

TSL 5

Gene QKI, Length 613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
QKI-213	ENST00000544361	GMFG	O60234	142 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	SCN2B	O60939	215 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	CLN5	O75503	358 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	ZMPSTE24	O75844	475 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	TDP2	O95551	362 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	IFNA10	P01566	189 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	FABP1	P07148	127 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	PROS1	P07225	676 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	THRB	P10828	461 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	CLU	P10909	449 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	RALA	P11233	206 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	B4GALT1	P15291	398 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	ZNF30	P17039	623 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	IL1RN	P18510	177 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	FUT1	P19526	365 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	MYL9	P24844	172 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	CYP2F1	P24903	491 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	SRD5A2	P31213	254 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	HMGCL	P35914	325 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	GRIA1	P42261	906 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	AKR1D1	P51857	326 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	ARFIP1	P53367	373 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	XG	P55808	180 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	RAG2	P55895	527 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	CLDN17	P56750	224 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	RAB5B	P61020	215 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	AP1S1	P61966	158 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	CDKL1	Q00532	357 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	DEFA6	Q01524	100 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	INCA1	Q0VD86	236 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	NME3	Q13232	169 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	ASAH1	Q13510	395 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	GPR50	Q13585	617 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	PEX6	Q13608	980 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	COTL1	Q14019	142 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	DPYSL3	Q14195	570 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	SSX2	Q16385	188 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	PPP1R3A	Q16821	1122 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	PARP15	Q460N3	678 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	FBXO48	Q5FWF7	155 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	LCN8	Q6JVE9	175 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	UQCC3	Q6UW78	93 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	UTS2B	Q765I0	119 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	ARMCX2	Q7L311	632 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	STRADA	Q7RTN6	431 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	AMZ2	Q86W34	360 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	AGR3	Q8TD06	166 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	TBCK	Q8TEA7	893 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	FAM151A	Q8WW52	585 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	SLC7A6	Q92536	515 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	SLC35C1	Q96A29	364 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	C7orf34	Q96L11	122 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	ACCS	Q96QU6	501 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	LXN	Q9BS40	222 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	NTMT1	Q9BV86	223 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	UCK2	Q9BZX2	261 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	IL22	Q9GZX6	179 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	SIRPD	Q9H106	197 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	OR51M1	Q9H341	326 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	XKR8	Q9H6D3	395 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	NTN4	Q9HB63	628 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	MRPS30	Q9NP92	439 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	C19orf12	Q9NSK7	152 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	CMTM6	Q9NX76	183 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	SLC17A7	Q9P2U7	560 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	ZNF639	Q9UID6	485 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	RARRES3	Q9UL19	164 aa		3.21	□□□□□ -1.9

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