RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488087.1

ECHDC1-217, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 3

Gene ECHDC1, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-217ENST00000488087 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 GLRA2P23416 452 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 SLC6A8P48029 635 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 SERPINB9P50453 376 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 RAB13P51153 203 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 PLA2G16P53816 162 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 AIF1P55008 147 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 GPX6P59796 221 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 KRTAP10-12P60413 245 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 RAB4BP61018 213 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 HAND2P61296 217 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 RGS1Q08116 209 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 IL18R1Q13478 541 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 KCNJ11Q14654 390 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 Q5BKY6 102 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 ZNF506Q5JVG8 444 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 HES5Q5TA89 166 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 ATF7IP2Q5U623 682 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 PDPK2PQ6A1A2 396 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 REP15Q6BDI9 236 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 ZNF774Q6NX45 483 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 STEAP1BQ6NZ63 245 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 PMF1Q6P1K2 205 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 EPGNQ6UW88 154 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 GALNT10Q86SR1 603 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 VASH2Q86V25 355 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 SLC26A11Q86WA9 606 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 RAB43Q86YS6 212 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 NUDCD3Q8IVD9 361 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 CPNE9Q8IYJ1 553 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 KATNAL2Q8IYT4 538 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 BLIDQ8IZY5 108 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 SLC39A11Q8N1S5 342 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 ZNF565Q8N9K5 539 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 ZNRF1Q8ND25 227 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 FBXO36Q8NEA4 188 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 OR56B2PQ8NGI1 322 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 OR8K3Q8NH51 312 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 OR52N1Q8NH53 320 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 SLC7A6Q92536 515 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 DNAJC19Q96DA6 116 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 YIPF6Q96EC8 236 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 SGTBQ96EQ0 304 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 CAPNS2Q96L46 248 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 CNPY3Q9BT09 278 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 ZNF416Q9BWM5 594 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 RAB34Q9BZG1 259 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 SIRPDQ9H106 197 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 SPNS1Q9H2V7 528 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 TMEM231Q9H6L2 316 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 CAB39LQ9H9S4 337 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 SLC25A19Q9HC21 320 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 FBXL12Q9NXK8 326 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 COA4Q9NYJ1 87 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 TMEM216Q9P0N5 145 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 LHX3Q9UBR4 397 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 SLC6A5Q9Y345 797 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 PEX16Q9Y5Y5 336 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 UBR1Q8IWV7 1749 aa3.05□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa3.04□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 A0A0U1RRA0 63 aa3.04□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 A0A1B0GTQ1 180 aa3.04□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 SRRM5B3KS81 715 aa3.04□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 E9PAM4 449 aa3.04□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 NPIPA5E9PKD4 350 aa3.04□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 M0R3G1 203 aa3.04□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 E2F3O00716 465 aa3.04□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 PIAS1O75925 651 aa3.04□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 SEMA4FO95754 770 aa3.04□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 C1QAP02745 245 aa3.04□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 CDK1P06493 297 aa3.04□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 SMIM6P0DI80 62 aa3.04□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 UMPSP11172 480 aa3.04□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 FOSL2P15408 326 aa3.04□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 PCMT1P22061 227 aa3.04□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 CRHBPP24387 322 aa3.04□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 PTPN6P29350 595 aa3.04□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 PPP2R1BP30154 601 aa3.04□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 QARSP47897 775 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 MEOX2P50222 304 aa3.04□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 CXCR4P61073 352 aa3.04□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 PSME3P61289 254 aa3.04□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 TSPAN5P62079 268 aa3.04□□□□□ -1.92
ECHDC1-217ENST00000488087 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 145 ms