RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585815.5

PRKAR1A-208, Transcript of protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene PRKAR1A, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR1A-208ENST00000585815 INIPQ9NRY2 104 aa7.36□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 FAIMQ9NVQ4 179 aa7.36□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 MED29Q9NX70 200 aa7.36□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 TAS2R5Q9NYW4 299 aa7.36□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 RHCGQ9UBD6 479 aa7.36□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa7.36□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 HIF3AQ9Y2N7 669 aa7.36□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 A0A087WUU8 490 aa7.35□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa7.35□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 J3KTA2 159 aa7.35□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 M0R1B8 84 aa7.35□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 HS3ST1O14792 307 aa7.35□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 ATP5HO75947 161 aa7.35□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 ATE1O95260 518 aa7.35□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 HLA-DOBP13765 273 aa7.35□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 LOXP28300 417 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 ZNF83P51522 516 aa7.35□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 ZNF84P51523 738 aa7.35□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 ART1P52961 327 aa7.35□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 IST1P53990 364 aa7.35□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 ARF1P84077 181 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 SPIBQ01892 262 aa7.35□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 BSPH1Q075Z2 132 aa7.35□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 CAMK2DQ13557 499 aa7.35□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 CEACAM16Q2WEN9 425 aa7.35□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 TBRG1Q3YBR2 411 aa7.35□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 ALG10Q5BKT4 473 aa7.35□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 CARD17Q5XLA6 110 aa7.35□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 FAM205BPQ63HN1 556 aa7.35□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 RINLQ6ZS11 566 aa7.35□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 C22orf34Q6ZV56 151 aa7.35□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 OAFQ86UD1 273 aa7.35□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 LINC00471Q8N535 108 aa7.35□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 LRRC17Q8N6Y2 441 aa7.35□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 ZNF611Q8N823 705 aa7.35□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 WDR31Q8NA23 367 aa7.35□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 IL17RDQ8NFM7 739 aa7.35□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 TMEM171Q8WVE6 324 aa7.35□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 TMEM54Q969K7 222 aa7.35□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 FBXW5Q969U6 566 aa7.35□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 TXNDC15Q96J42 360 aa7.35□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 C7orf34Q96L11 122 aa7.35□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 ALPK1Q96QP1 1244 aa7.35□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 CCL19Q99731 98 aa7.35□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 EMC6Q9BV81 110 aa7.35□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 CXorf56Q9H5V9 222 aa7.35□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 C20orf141Q9NUB4 165 aa7.35□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 GLTPQ9NZD2 209 aa7.35□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 NDUFAF4Q9P032 175 aa7.35□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 POU2F3Q9UKI9 436 aa7.35□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 FBXL3Q9UKT7 428 aa7.35□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 TMCC3Q9ULS5 477 aa7.35□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 AURKCQ9UQB9 309 aa7.35□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 V9GYQ6 96 aa7.35□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 CCDC168Q8NDH2 2452 aa7.35□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 CSMD2Q7Z408 3487 aa7.34□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 DPRXA6NFQ7 191 aa7.34□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 A6NIZ1 184 aa7.34□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 VSTM5A8MXK1 200 aa7.34□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 hCG_2039718K7EN88 272 aa7.34□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 ABCD4O14678 606 aa7.34□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 FFAR1O14842 300 aa7.34□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 GYG2O15488 501 aa7.34□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 ARHGEF9O43307 516 aa7.34□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 PIP5K1CO60331 668 aa7.34□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 SMPD2O60906 423 aa7.34□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 KRT36O76013 467 aa7.34□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 PRSS23O95084 383 aa7.34□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 UBL3O95164 117 aa7.34□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 GADD45GO95257 159 aa7.34□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 FARS2O95363 451 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 TSPAN19P0C672 248 aa7.34□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 CD53P19397 219 aa7.34□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 CD40P25942 277 aa7.34□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 ARR3P36575 388 aa7.34□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 AQP2P41181 271 aa7.34□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 CAPZA2P47755 286 aa7.34□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 CDH11P55287 796 aa7.34□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 CTXN1P60606 82 aa7.34□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 RAP1BP61224 184 aa7.34□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 RPL27P61353 136 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 RAP1AP62834 184 aa7.34□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 VLDLRP98155 873 aa7.34□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 CHRNB3Q05901 458 aa7.34□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 MELKQ14680 651 aa7.34□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 DEFB113Q30KQ7 82 aa7.34□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 ZBED5Q49AG3 693 aa7.34□□□□□ -1.23
PRKAR1A-208ENST00000585815 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.5 ms