RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 CPNE5Q9HCH3 593 aa7.4□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 ACOXLQ9NUZ1 547 aa7.4□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 MED11Q9P086 117 aa7.4□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa7.4□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 GNG8Q9UK08 70 aa7.4□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 WIF1Q9Y5W5 379 aa7.4□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa7.4□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 FREM3P0C091 2139 aa7.4□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 FABP12A6NFH5 140 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 B4E171 279 aa7.39□□□□□ -1.23
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PDE4D-208ENST00000502484 XKRYO14609 159 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 ARHGEF9O43307 516 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF208O43345 1280 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 AHCYP23526 432 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 SHC1P29353 583 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 TSPAN7P41732 249 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 GDI2P50395 445 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 MAP2K6P52564 334 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 DEFA1P59665 94 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 DEFA3P59666 94 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 MFSD13AQ14CX5 517 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 ACKR1Q16570 336 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 BTBD16Q32M84 506 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 ACSM3Q53FZ2 586 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 SLC25A53Q5H9E4 307 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 ZMAT1Q5H9K5 638 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 HBMQ6B0K9 141 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 MZT2AQ6P582 158 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 XKRXQ6PP77 449 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 ARSKQ6UWY0 536 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 FAM131AQ6UXB0 335 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 PAMR1Q6UXH9 720 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 CEACAM19Q7Z692 300 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 NR2C2APQ86WQ0 139 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 CDC20BQ86Y33 519 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 OR10G3Q8NGC4 313 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF417Q8TAU3 575 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 ACOT12Q8WYK0 555 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 MNTQ99583 582 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF700Q9H0M5 742 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 TXNIPQ9H3M7 391 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 MARCH7Q9H992 704 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 SDHAF3Q9NRP4 125 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 SLC39A1Q9NY26 324 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 COMMD3Q9UBI1 195 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 FKBP7Q9Y680 259 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 A0A1W2PRG6 482 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 PRR32B1ATL7 298 aa7.39□□□□□ -1.23
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PDE4D-208ENST00000502484 MYL9P24844 172 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 ZP4Q12836 540 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 FOXF1Q12946 379 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 EXT1Q16394 746 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 FAM27D1Q5T7N8 215 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 SLC6A19Q695T7 634 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 PM20D2Q8IYS1 436 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 SCAIQ8N9R8 606 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 OR2Y1Q8NGV0 311 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 MFSD8Q8NHS3 518 aa7.39□□□□□ -1.23
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PDE4D-208ENST00000502484 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
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PDE4D-208ENST00000502484 SOSTQ9BQB4 213 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 METTL7AQ9H8H3 244 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 C14orf119Q9NWQ9 140 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 DLL3Q9NYJ7 618 aa7.39□□□□□ -1.23
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PDE4D-208ENST00000502484 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 PRSS37A4D1T9 235 aa7.38□□□□□ -1.23
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PDE4D-208ENST00000502484 FZD7O75084 574 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 GATBO75879 557 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 PLGP00747 810 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 FTH1P19P0C7X4 201 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 EDNRAP25101 427 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 CASP3P42574 277 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 BAK1Q16611 211 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 PLPPR5Q32ZL2 321 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-208ENST00000502484 TRILQ7L0X0 811 aa7.38□□□□□ -1.23
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