RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	9.29	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	NTN4	Q9HB63	628 aa		9.29	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	RASD1	Q9Y272	281 aa		9.29	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	WNT9B	O14905	357 aa		9.28	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	RIPK2	O43353	540 aa		9.28	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	SEC14L2	O76054	403 aa		9.28	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	9.28	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	CD79A	P11912	226 aa		9.28	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	IL7R	P16871	459 aa		9.28	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF43	P17038	809 aa		9.28	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	LSP1	P33241	339 aa		9.28	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	EVX1	P49640	407 aa		9.28	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	SEC24C	P53992	1094 aa		9.28	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	CLDN17	P56750	224 aa		9.28	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	COPZ1	P61923	177 aa		9.28	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	9.28	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	C1D	Q13901	141 aa	Known RBP	9.28	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	9.28	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		9.28	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		9.28	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		9.28	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	LINGO2	Q7L985	606 aa		9.28	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	CMIP	Q8IY22	773 aa		9.28	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		9.28	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	KIF18A	Q8NI77	898 aa		9.28	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	9.28	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		9.28	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	ZG16B	Q96DA0	208 aa		9.28	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB39B	Q96DA2	213 aa		9.28	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		9.28	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	NELFA	Q9H3P2	528 aa		9.28	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		9.28	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511		A8MVM7	634 aa		9.27	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	9.27	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	CDC14B	O60729	498 aa		9.27	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM13	O60858	407 aa		9.27	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF432	O94892	652 aa		9.27	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	PRSS23	O95084	383 aa		9.27	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	AHSA1	O95433	338 aa		9.27	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	CHRNG	P07510	517 aa		9.27	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	GUSB	P08236	651 aa		9.27	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	HKR1	P10072	659 aa		9.27	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	G6PD	P11413	515 aa		9.27	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	9.27	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	UQCRC2	P22695	453 aa		9.27	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	NR4A1	P22736	598 aa		9.27	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	CRHR1	P34998	444 aa		9.27	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	LMO4	P61968	165 aa		9.27	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	9.27	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	ZP4	Q12836	540 aa		9.27	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	BNIP2	Q12982	314 aa		9.27	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	GSTA3	Q16772	222 aa		9.27	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		9.27	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		9.27	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	AVPI1	Q5T686	147 aa		9.27	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRD46	Q86W74	232 aa		9.27	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		9.27	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		9.27	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	KDM8	Q8N371	416 aa		9.27	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		9.27	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		9.27	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		9.27	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	YIPF5	Q969M3	257 aa		9.27	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		9.27	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	RACGAP1	Q9H0H5	632 aa		9.27	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	9.27	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	ESM1	Q9NQ30	184 aa		9.27	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	9.27	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	9.27	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	FZR1	Q9UM11	496 aa		9.27	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		9.27	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	SMIM23	A6NLE4	172 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511		J3QLI3	93 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	FRS3	O43559	492 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	PLPP2	O43688	288 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	HLA-H	P01893	362 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	FGF4	P08620	206 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	ECHS1	P30084	290 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	RAD52	P43351	418 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	SELENOV	P59797	346 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	PIGF	Q07326	219 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	FUT5	Q11128	374 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	EPS8	Q12929	822 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	GSG1	Q2KHT4	349 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPL2	Q5T653	305 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	ATG16L1	Q676U5	607 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	DUX5	Q96PT3	197 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		9.26	□□□□□ -0.93

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