RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000269385.8

CBX8-201, Transcript of chromobox 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CBX8, Length 3,791 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8-201ENST00000269385 C22orf15Q8WYQ4 148 aa14.9□□□□□ -0.02
CBX8-201ENST00000269385 DTD2Q96FN9 168 aa14.9□□□□□ -0.02
CBX8-201ENST00000269385 ASIC5Q9NY37 505 aa14.9□□□□□ -0.02
CBX8-201ENST00000269385 GDE1Q9NZC3 331 aa14.9□□□□□ -0.02
CBX8-201ENST00000269385 DENND4AQ7Z401 1863 aa14.9□□□□□ -0.02
CBX8-201ENST00000269385 CACNA1CQ13936 2221 aa14.9□□□□□ -0.02
CBX8-201ENST00000269385 UMAD1C9J7I0 102 aa14.9□□□□□ -0.02
CBX8-201ENST00000269385 UGDHO60701 494 aa14.9□□□□□ -0.02
CBX8-201ENST00000269385 ACP5P13686 325 aa14.9□□□□□ -0.02
CBX8-201ENST00000269385 VEGFBP49765 207 aa14.9□□□□□ -0.02
CBX8-201ENST00000269385 SULT1A1P50225 295 aa14.9□□□□□ -0.02
CBX8-201ENST00000269385 PRKAG1P54619 331 aa14.9□□□□□ -0.02
CBX8-201ENST00000269385 FOXK2Q01167 660 aa14.9□□□□□ -0.02
CBX8-201ENST00000269385 CLEC2AQ6UVW9 174 aa14.9□□□□□ -0.02
CBX8-201ENST00000269385 SBSNQ6UWP8 590 aa14.9□□□□□ -0.02
CBX8-201ENST00000269385 C15orf40Q8WUR7 153 aa14.9□□□□□ -0.02
CBX8-201ENST00000269385 ZBTB8AQ96BR9 441 aa14.9□□□□□ -0.02
CBX8-201ENST00000269385 NDUFAF3Q9BU61 184 aa14.9□□□□□ -0.02
CBX8-201ENST00000269385 WIF1Q9Y5W5 379 aa14.9□□□□□ -0.02
CBX8-201ENST00000269385 SOCS6O14544 535 aa14.89□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 AK1P00568 194 aa14.89□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 IGHV2-5P01817 119 aa14.89□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 HMGA2P52926 109 aa14.89□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 LIM2P55344 173 aa14.89□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 NRG3P56975 720 aa14.89□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP14.89□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 AARDQ4LEZ3 155 aa14.89□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 ARSIQ5FYB1 569 aa14.89□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 TMEM244Q5VVB8 128 aa14.89□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 SSX7Q7RTT5 188 aa14.89□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa14.89□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 PPP1R16AQ96I34 528 aa14.89□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 SGK2Q9HBY8 427 aa14.89□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 UNC80Q8N2C7 3258 aa14.89□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 TAPBPO15533 448 aa14.89□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 DLEU1O43261 78 aa14.89□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa14.89□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 PRSS35Q8N3Z0 413 aa14.89□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa14.89□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 OR8J2Q8NGG1 315 aa14.89□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 OR52L1Q8NGH7 329 aa14.89□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 OR6X1Q8NH79 312 aa14.89□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 C4orf36Q96KX1 117 aa14.89□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 SMIM14Q96QK8 99 aa14.89□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 POTEKPQ9BYX7 375 aa14.89□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 POFUT1Q9H488 388 aa14.89□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 SFXN1Q9H9B4 322 aa14.89□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 LANCL2Q9NS86 450 aa14.89□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 SAP18O00422 153 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 TGM5O43548 720 aa14.89□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 ATP1B3P54709 279 aa14.89□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 TAS2R43P59537 309 aa14.89□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 LSM6P62312 80 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 NOGQ13253 232 aa14.89□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 C1orf94Q6P1W5 598 aa14.89□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 GPR137CQ8N3F9 429 aa14.89□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 ZBTB2Q8N680 514 aa14.89□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 PIGXQ8TBF5 258 aa14.89□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 OR52A5Q9H2C5 316 aa14.89□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 ANTXRLA6NF34 631 aa14.88□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 CCDC85CA6NKD9 419 aa14.88□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 B4E171 279 aa14.88□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 EREGO14944 169 aa14.88□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 SCGNO76038 276 aa14.88□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 AMY2AP04746 511 aa14.88□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 OR13C7P0DN81 318 aa14.88□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 THPOP40225 353 aa14.88□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 KDM8Q8N371 416 aa14.88□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 TRAM1L1Q8N609 369 aa14.88□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 HPSE2Q8WWQ2 592 aa14.88□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 FAM117AQ9C073 453 aa14.88□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 NRSN2Q9GZP1 204 aa14.88□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 RAB33BQ9H082 229 aa14.88□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 GPATCH2Q9NW75 528 aa14.88□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 OARD1Q9Y530 152 aa14.88□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 NPSP0C0P6 89 aa14.88□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 ACTA2P62736 377 aa14.88□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 ACTG2P63267 376 aa14.88□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 ACTC1P68032 377 aa14.88□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 ACTA1P68133 377 aa14.88□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 GLB1L2Q8IW92 636 aa14.88□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 AUTS2Q8WXX7 1259 aa14.88□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 C5orf34Q96MH7 638 aa14.88□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 TMEM208Q9BTX3 173 aa14.88□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 TAS2R8Q9NYW2 309 aa14.88□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 H3BSH0 61 aa14.88□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 CAV2P51636 162 aa14.88□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 OR5I1Q13606 314 aa14.88□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CBX8-201ENST00000269385 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.8 ms