RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 CDC6Q99741 560 aa7.43□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 WDR70Q9NW82 654 aa7.43□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 ETAA1Q9NY74 926 aa7.43□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 MOKQ9UQ07 419 aa7.43□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 TRAPPC4Q9Y296 219 aa7.43□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 CMAHPQ9Y471 501 aa7.43□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM72A0PK05 275 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 ANKUB1A6NFN9 424 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 A8MVM7 634 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 CASKO14936 926 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 SC5DO75845 299 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 ZFAND5O76080 213 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 F8A1P23610 371 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 HTR3AP46098 478 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 HCCSP53701 268 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 DLX5P56178 289 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 MC2RQ01718 297 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 SGCBQ16585 318 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 MESTQ5EB52 335 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 FAM69AQ5T7M9 428 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 C1QL3Q5VWW1 255 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 GPR139Q6DWJ6 353 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 POMZP3Q6PJE2 187 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 GHDCQ8N2G8 530 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 DEFB124Q8NES8 71 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 OR5J2Q8NH18 312 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 STK35Q8TDR2 534 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM234Q8WY98 164 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 ST8SIA1Q92185 356 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 TTC9Q92623 222 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 PPP1R14BQ96C90 147 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 PGLYRP3Q96LB9 341 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 ALG12Q9BV10 488 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC32Q9BV29 185 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 MYOTQ9UBF9 498 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 GRHPRQ9UBQ7 328 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 V9GYH0 126 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 ANKRD33BA6NCL7 494 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 TM4SF5O14894 197 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 OGG1O15527 345 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 SELENOFO60613 162 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 SERPINI2O75830 405 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 SDHBP21912 280 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 CFL1P23528 166 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 ACP1P24666 158 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 PYCR1P32322 319 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 MTNR1BP49286 362 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 TMED10P49755 219 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 E2F1Q01094 437 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 HSF2Q03933 536 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC157Q569K6 752 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 C1orf140Q5VVS0 124 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 ARL9Q6T311 187 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 LYPD8Q6UX82 237 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 OR6K6Q8NGW6 343 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 MIXL1Q9H2W2 232 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 TAS2R5Q9NYW4 299 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 COPS3Q9UNS2 423 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 ALPK2Q86TB3 2170 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 FUOMA2VDF0 154 aa7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 B4DXG7 233 aa7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 DVL2O14641 736 aa7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 CCL4P13236 92 aa7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 PRKCAP17252 672 aa7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 CAV3P56539 151 aa7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 DNASE1L3Q13609 305 aa7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF79Q15937 498 aa7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 TP53I3Q53FA7 332 aa7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 DDI2Q5TDH0 399 aa7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 FAM198BQ6UWH4 519 aa7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 RPTNQ6XPR3 784 aa7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 SLC22A16Q86VW1 577 aa7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 MS4A15Q8N5U1 240 aa7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 OR6S1Q8NH40 331 aa7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 ELP5Q8TE02 316 aa7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 PELI1Q96FA3 418 aa7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 SP140LQ9H930 580 aa7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 GALNT9Q9HCQ5 603 aa7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 ABCB9Q9NP78 766 aa7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 SMIM30A4D0T7 59 aa7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-208ENST00000502484 OR2T1O43869 369 aa7.41□□□□□ -1.22
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