RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494956.1

NELFE-213, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-213ENST00000494956 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 DTX2Q86UW9 622 aa9.27□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 SNX32Q86XE0 403 aa9.27□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 C10orf53Q8N6V4 93 aa9.27□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 POU5F2Q8N7G0 328 aa9.27□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 SLC47A1Q96FL8 570 aa9.27□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 CACNG6Q9BXT2 260 aa9.27□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 C12orf10Q9HB07 376 aa9.27□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 SAR1AQ9NR31 198 aa9.27□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 MED29Q9NX70 200 aa9.27□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 MOKQ9UQ07 419 aa9.27□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 AMDHD2Q9Y303 409 aa9.27□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 FN1P02751 2386 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 C11orf98E9PRG8 122 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 M0R3G1 203 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 MRASO14807 208 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 SSX4O60224 188 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 FZD7O75084 574 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 VAMP5O95183 116 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 HEXAP06865 529 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP9.26□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 NQO1P15559 274 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
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NELFE-213ENST00000494956 PRPS1P60891 318 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 ARF1P84077 181 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 TGFBR3Q03167 851 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 KRTAP1-1Q07627 177 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 RBBP4Q09028 425 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 C1DQ13901 141 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 VMACQ2NL98 169 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 CEACAM16Q2WEN9 425 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 METTL21CQ5VZV1 264 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 FAM91A1Q658Y4 838 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 C11orf71Q6IPW1 123 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 KLHL24Q6TFL4 600 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 LINC00114Q6XXX2 140 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 C17orf78Q8N4C9 275 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 LRRC17Q8N6Y2 441 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 TSPEARQ8WU66 669 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 LRRC58Q96CX6 371 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 SLC41A3Q96GZ6 507 aa9.26□□□□□ -0.93
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NELFE-213ENST00000494956 DHRS9Q9BPW9 319 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 SIKE1Q9BRV8 207 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 ALG2Q9H553 416 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 GPR35Q9HC97 309 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 SELENONQ9NZV5 590 aa9.26□□□□□ -0.93
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NELFE-213ENST00000494956 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 OR2T1O43869 369 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 SLC43A1O75387 559 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 LY6HO94772 140 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 CH25HO95992 272 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 WNT11O96014 354 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 FUT4P22083 530 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 AHCYP23526 432 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 CALCRP30988 508 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 PMS2P3Q13401 168 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 CAMK2DQ13557 499 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 MMEL1Q495T6 779 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 AGAP6Q5VW22 663 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 HMBOX1Q6NT76 420 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 NHLRC1Q6VVB1 395 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 CALHM3Q86XJ0 350 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 UEVLDQ8IX04 471 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 TMEM123Q8N131 208 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 MUC15Q8N387 334 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 SLC26A7Q8TE54 656 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 C10orf82Q8WW14 230 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 ZNF583Q96ND8 569 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 SLC38A2Q96QD8 506 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 LINC00470Q9BZP3 86 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 CRLF2Q9HC73 371 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 CBLN4Q9NTU7 201 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 PRDM4Q9UKN5 801 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 SLC7A7Q9UM01 511 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 MGAT4BQ9UQ53 548 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 ZANQ9Y493 2812 aa9.24□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 CSPG4Q6UVK1 2322 aa9.24□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 SLC35F4A4IF30 521 aa9.24□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 INAFM1C9JVW0 142 aa9.24□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 PLPP3O14495 311 aa9.24□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 CHP2O43745 196 aa9.24□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 TMCC2O75069 709 aa9.24□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 CECR9P0C854 216 aa9.24□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 ADORA3P0DMS8 318 aa9.24□□□□□ -0.93
NELFE-213ENST00000494956 OR1E2P47887 323 aa9.24□□□□□ -0.93
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