RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 SNX6Q9UNH7 406 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 FIS1Q9Y3D6 152 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 SCN8AQ9UQD0 1980 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 PLXNA3P51805 1871 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 NLRC5Q86WI3 1866 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 ANKRD12Q6UB98 2062 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 EFCAB10A6NFE3 127 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 CASTOR2A6NHX0 329 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 YJEFN3A6XGL0 299 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 C9JVG2 144 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 SGK494L7N484 410 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 SLC30A4O14863 429 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 STX7O15400 261 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 PLA2G10O15496 165 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 PCDH7O60245 1069 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 MPZL2O60487 215 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 SCN2BO60939 215 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 FADS2O95864 444 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 SP1P08047 785 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 IGHV4-31P0DP07 118 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 SLC2A3P11169 496 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 PRPS2P11908 318 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 IRF2P14316 349 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 GLULP15104 373 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 TSPAN8P19075 237 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 LMO2P25791 158 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 ALDH4A1P30038 563 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 HMGCLP35914 325 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 TGFBR1P36897 503 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 CDKN1AP38936 164 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 HTR2BP41595 481 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 CRYBB2P43320 205 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 TAF6P49848 677 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 ARHGDIAP52565 204 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 MAZP56270 477 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 CLDN8P56748 225 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 MTPNP58546 118 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 OSTNP61366 133 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 DLK1P80370 383 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 SCN1BQ07699 218 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 GPR17Q13304 367 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 P2RY6Q15077 328 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 ANGPT1Q15389 498 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 TAF13Q15543 124 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 SSX1Q16384 188 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 MICAQ29983 383 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 KIAA1644Q3SXP7 199 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 GGTA1PQ4G0N0 100 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 HSD17B12Q53GQ0 312 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 SLC25A30Q5SVS4 291 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 MEDAGQ5VYS4 303 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 NEK5Q6P3R8 708 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 HSDL2Q6YN16 418 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 RTN4RL2Q86UN3 420 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 METTL23Q86XA0 190 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 TMEM86AQ8N2M4 240 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 CADM2Q8N3J6 435 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 ATPAF2Q8N5M1 289 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 FNDC5Q8NAU1 212 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 IPMKQ8NFU5 416 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 OR4C15Q8NGM1 316 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 OR52N5Q8NH56 324 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 OR10A6Q8NH74 314 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 FBXO30Q8TB52 745 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 BRSK1Q8TDC3 778 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 HGDQ93099 445 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 WBP1Q96G27 269 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 SPATA17Q96L03 361 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 CEP19Q96LK0 163 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 HYLS1Q96M11 299 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 SPATA33Q96N06 139 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 NTMT1Q9BV86 223 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 KATNB1Q9BVA0 655 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 BARHL1Q9BZE3 327 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 ULBP1Q9BZM6 244 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 SLC39A8Q9C0K1 460 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 CCDC90BQ9GZT6 254 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 FN3KQ9H479 309 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 RNF121Q9H920 327 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 TRPV4Q9HBA0 871 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 SLC25A19Q9HC21 320 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 ZNF226Q9NYT6 803 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 TAS2R13Q9NYV9 303 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 CD274Q9NZQ7 290 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 SEC14L4Q9UDX3 406 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 STOML2Q9UJZ1 356 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 IKZF3Q9UKT9 509 aa4.43□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 OTOFQ9HC10 1997 aa4.43□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.6 ms