RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000457748.1

GTF3C2-208, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 2, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-208ENST00000457748 ZNF835Q9Y2P0 537 aa11.14□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 A0A1W2PRG6 482 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 CD8B2A6NJW9 211 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 H3BN98 237 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 PLPP3O14495 311 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 CDC42EP2O14613 210 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 EI24O14681 340 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 SERPINI2O75830 405 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 NDUFB2O95178 105 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 ZNF43P17038 809 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 POU1F1P28069 291 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 AQP2P41181 271 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 DAPP51397 102 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 ALDH3A2P51648 485 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 RAD23AP54725 363 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 DAG1Q14118 895 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 ALG10Q5BKT4 473 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 EMC4Q5J8M3 183 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 OR2A2Q6IF42 318 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 FAHD1Q6P587 224 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 SMARCD3Q6STE5 483 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 RPTNQ6XPR3 784 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 C3P1Q6ZMU1 363 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 DOLPP1Q86YN1 238 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 EPHX4Q8IUS5 362 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 CCDC103Q8IW40 242 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 UEVLDQ8IX04 471 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 ANKK1Q8NFD2 765 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 TEX47Q8TBZ9 253 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 OXGR1Q96P68 337 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 TEX12Q9BXU0 123 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 SMURF2Q9HAU4 748 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 TBC1D23Q9NUY8 699 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 SEC14L4Q9UDX3 406 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 TINAGQ9UJW2 476 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 COL6A6A6NMZ7 2263 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 MCIDASD6RGH6 385 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 SOCS2O14508 198 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 GPR171O14626 319 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 KLF4O43474 513 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 CYTIPO60759 359 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 HPRP00739 348 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 IL2RAP01589 272 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 PEX2P28328 305 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 SLC6A6P31641 620 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 H3F3AP84243 136 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 RFX4Q33E94 735 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 LPCAT4Q643R3 524 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 TMEM211Q6ICI0 200 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 KLHL17Q6TDP4 642 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 CD300LDQ6UXZ3 194 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 ZNF620Q6ZNG0 422 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 GALNT5Q7Z7M9 940 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 GALNT4Q8N4A0 578 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 RNF128Q8TEB7 428 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 GPA33Q99795 319 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 OR52D1Q9H346 318 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 INIPQ9NRY2 104 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 GLRX2Q9NS18 164 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 CLCF1Q9UBD9 225 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 SIGLEC7Q9Y286 467 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 HIF3AQ9Y2N7 669 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 NOX1Q9Y5S8 564 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 CDH10Q9Y6N8 788 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 GTF3C1Q12789 2109 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 A0A1W2PNV4 684 aa11.11□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 MS4A18H0YCH9 400 aa11.11□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 FZD7O75084 574 aa11.11□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 AQP8O94778 261 aa11.11□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 SOX14O95416 240 aa11.11□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 TGM6O95932 706 aa11.11□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 OSMP13725 252 aa11.11□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 NOS3P29474 1203 aa11.11□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 UQCRC1P31930 480 aa11.11□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 CA7P43166 264 aa11.11□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 DAP3P51398 398 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 CTXN1P60606 82 aa11.11□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 PPP2R2BQ00005 443 aa11.11□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 ZP4Q12836 540 aa11.11□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 IGFBP7Q16270 282 aa11.11□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 MS4A18Q3C1V0 323 aa11.11□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 SLC36A3Q495N2 470 aa11.11□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 TMEM201Q5SNT2 666 aa11.11□□□□□ -0.63
GTF3C2-208ENST00000457748 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.5 ms