RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586667.1

DNMT1-208, Transcript of DNA methyltransferase 1, human

TSL 2

Gene DNMT1, Length 714 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DNMT1-208	ENST00000586667	OR2T1	O43869	369 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	WDR1	O75083	606 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	AKR7A3	O95154	331 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	ADA	P00813	363 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	GAST	P01350	101 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	PRKACG	P22612	351 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	ACVR2A	P27037	513 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	PEX2	P28328	305 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	CARD18	P57730	90 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	OR2B6	P58173	313 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	SLC35A1	P78382	337 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	GUSBP1	Q15486	140 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	IGFBP7	Q16270	282 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	SGCB	Q16585	318 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	RPTN	Q6XPR3	784 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	KIF18B	Q86Y91	864 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	SVOPL	Q8N434	492 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	TMEM99	Q8N816	258 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	GIPC3	Q8TF64	312 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	ABHD3	Q8WU67	409 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	CHST11	Q9NPF2	352 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	FANCF	Q9NPI8	374 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	STOML1	Q9UBI4	398 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		11.24	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	MED12L	Q86YW9	2145 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	LRRK2	Q5S007	2527 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	CD8B2	A6NJW9	211 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	SLC22A20	A6NK97	555 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	EFCAB9	A8MZ26	197 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	AHRR	A9YTQ3	701 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667		H0YHG0	523 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	PLPP3	O14495	311 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	SOCS2	O14508	198 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	TRAF3IP2	O43734	574 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	CYTIP	O60759	359 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	TOX	O94900	526 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	ATP6V1G2	O95670	118 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	STS	P08842	583 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF23	P17027	643 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	PTGER4	P35408	488 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	CA7	P43166	264 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	DAP	P51397	102 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	SLC16A1	P53985	500 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	TSPAN31	Q12999	210 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	THSD4	Q6ZMP0	1018 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	CCDC103	Q8IW40	242 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	LINC00471	Q8N535	108 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	OR5J2	Q8NH18	312 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	NRG4	Q8WWG1	115 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	CIB1	Q99828	191 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	PLA2G12A	Q9BZM1	189 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	TP63	Q9H3D4	680 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	RNF122	Q9H9V4	155 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	NANS	Q9NR45	359 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	TENM4	Q6N022	2769 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		11.22	□□□□□ -0.61

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 203.6 ms