RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467464.1

PTPRF-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, human

TSL 3

Gene PTPRF, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRF-211	ENST00000467464	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464		M0R1B8	84 aa		10.46	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	TPST1	O60507	370 aa		10.46	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	TPST2	O60704	377 aa		10.46	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	PNMT	P11086	282 aa		10.46	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	GPX2	P18283	190 aa		10.46	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	STX1B	P61266	288 aa		10.46	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		10.46	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		10.46	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	AGAP6	Q5VW22	663 aa		10.46	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	SLC22A25	Q6T423	547 aa		10.46	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		10.46	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		10.46	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	AAED1	Q7RTV5	226 aa		10.46	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		10.46	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		10.46	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	STON2	Q8WXE9	905 aa		10.46	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	PRR14	Q9BWN1	585 aa		10.46	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		10.46	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		10.46	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	TMEM38A	Q9H6F2	299 aa		10.46	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	C12orf10	Q9HB07	376 aa		10.46	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		10.46	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		10.46	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		10.46	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	CCDC167	Q9P0B6	97 aa		10.46	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		10.46	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		10.46	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	RASD1	Q9Y272	281 aa		10.46	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	USF3	Q68DE3	2245 aa		10.45	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464		A0A1B0GWA3	101 aa		10.45	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	TMEM247	A6NEH6	219 aa		10.45	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	UPK3A	O75631	287 aa		10.45	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	VAMP5	O95183	116 aa		10.45	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	AHSA1	O95433	338 aa		10.45	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		10.45	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		10.45	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF544	Q6NX49	715 aa		10.45	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		10.45	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	GPAT4	Q86UL3	456 aa		10.45	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	PTOV1	Q86YD1	416 aa		10.45	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	KDM8	Q8N371	416 aa		10.45	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	MUC15	Q8N387	334 aa		10.45	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		10.45	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		10.45	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	TAAR8	Q969N4	342 aa		10.45	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		10.45	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	ALG2	Q9H553	416 aa		10.45	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	ARMC7	Q9H6L4	198 aa		10.45	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		10.45	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		10.45	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	ARID1A	O14497	2285 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464		H7C417	338 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	LGI1	O95970	557 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	FABP6	P51161	128 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	PRPS1	P60891	318 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	CDK6	Q00534	326 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	TGFBR3	Q03167	851 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	SQLE	Q14534	574 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	NRF1	Q16656	503 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	MST1L	Q2TV78	715 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	AGK	Q53H12	422 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	TMEM225	Q6GV28	225 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	REEP3	Q6NUK4	255 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	NIPAL3	Q6P499	406 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	RETREG3	Q86VR2	466 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	RCE1	Q9Y256	329 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464		A0A0B4J2E0	115 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464		A0A1B0GX12	115 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	C5orf58	C9J3I9	102 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464		M0R082	166 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	TRAF3IP2	O43734	574 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	SSX4	O60224	188 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	CRLF1	O75462	422 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	HPR	P00739	348 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPRF-211	ENST00000467464	IGLV1-44	P01699	117 aa		10.43	□□□□□ -0.74

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