RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416651.5

NIF3L1-206, Transcript of NGG1 interacting factor 3 like 1, human

TSL 2 BASIC

Gene NIF3L1, Length 967 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NIF3L1-206	ENST00000416651	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	CMAHP	Q9Y471	501 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	CCDC188	H7C350	402 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	GPR171	O14626	319 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	TIMM23	O14925	209 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	PIP5K1B	O14986	540 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	DNAJA2	O60884	412 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	RSL1D1	O76021	490 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	KLHL2	O95198	593 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	PMS2P2	O95744	297 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	GSN	P06396	782 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	ALOX5	P09917	674 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	BCKDHA	P12694	445 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	NR4A1	P22736	598 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	NTS	P30990	170 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	HSD17B3	P37058	310 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	MAGEA8	P43361	318 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	FOXA1	P55317	472 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	TGFBR3	Q03167	851 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	SKP2	Q13309	424 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	GRTP1	Q5TC63	336 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	AAED1	Q7RTV5	226 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	SPC24	Q8NBT2	197 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	BOD1	Q96IK1	185 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	BTBD2	Q9BX70	525 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	CHIA	Q9BZP6	476 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	LAT2	Q9GZY6	243 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	BEX1	Q9HBH7	125 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	CRLF2	Q9HC73	371 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	OXSM	Q9NWU1	459 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	TAS2R7	Q9NYW3	318 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	UBAP1	Q9NZ09	502 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	SNX24	Q9Y343	169 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651		A0A096LPK6	155 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMEM72	A0PK05	275 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651		H3BS24	57 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	PGRMC1	O00264	195 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF264	O43296	627 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	AKAP10	O43572	662 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	AKR7A3	O95154	331 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	NGF	P01138	241 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	ANPEP	P15144	967 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	CBR1	P16152	277 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	CRABP2	P29373	138 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	RYK	P34925	604 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	ATP12A	P54707	1039 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	PROK1	P58294	105 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	ERVS71-1	P61550	626 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF154	Q13106	437 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	MAPK14	Q16539	360 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	UNC50	Q53HI1	259 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	SAXO2	Q658L1	398 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	TEX29	Q8N6K0	151 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	GLB1L3	Q8NCI6	653 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	LINC01006	Q8NI28	216 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF75A	Q96N20	296 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	VPS11	Q9H270	941 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	MIEF1	Q9NQG6	463 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	ACER3	Q9NUN7	267 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	SNX6	Q9UNH7	406 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		7.29	□□□□□ -1.24

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