RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 P2RX1P51575 399 aa10.35□□□□□ -0.75
CAPNS1-209ENST00000590049 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
CAPNS1-209ENST00000590049 SPIBQ01892 262 aa10.35□□□□□ -0.75
CAPNS1-209ENST00000590049 CD226Q15762 336 aa10.35□□□□□ -0.75
CAPNS1-209ENST00000590049 CYB5R2Q6BCY4 276 aa10.35□□□□□ -0.75
CAPNS1-209ENST00000590049 OR2T5Q6IEZ7 315 aa10.35□□□□□ -0.75
CAPNS1-209ENST00000590049 SHISA2Q6UWI4 295 aa10.35□□□□□ -0.75
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CAPNS1-209ENST00000590049 CADM2Q8N3J6 435 aa10.35□□□□□ -0.75
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CAPNS1-209ENST00000590049 SLCO4A1Q96BD0 722 aa10.35□□□□□ -0.75
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CAPNS1-209ENST00000590049 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
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CAPNS1-209ENST00000590049 NDRG3Q9UGV2 375 aa10.35□□□□□ -0.75
CAPNS1-209ENST00000590049 TENM3Q9P273 2699 aa10.35□□□□□ -0.75
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CAPNS1-209ENST00000590049 EXPH5Q8NEV8 1989 aa10.34□□□□□ -0.75
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CAPNS1-209ENST00000590049 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa10.34□□□□□ -0.75
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CAPNS1-209ENST00000590049 PEX1O43933 1283 aa10.34□□□□□ -0.75
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CAPNS1-209ENST00000590049 CCL3P10147 92 aa10.34□□□□□ -0.75
CAPNS1-209ENST00000590049 ANPEPP15144 967 aa10.34□□□□□ -0.75
CAPNS1-209ENST00000590049 CNR1P21554 472 aa10.34□□□□□ -0.75
CAPNS1-209ENST00000590049 ACVR1BP36896 505 aa10.34□□□□□ -0.75
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CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
CAPNS1-209ENST00000590049 SESN3P58005 492 aa10.34□□□□□ -0.75
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF117Q03924 483 aa10.34□□□□□ -0.75
CAPNS1-209ENST00000590049 ST3GAL3Q11203 375 aa10.34□□□□□ -0.75
CAPNS1-209ENST00000590049 EPS8Q12929 822 aa10.34□□□□□ -0.75
CAPNS1-209ENST00000590049 GANABQ14697 944 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
CAPNS1-209ENST00000590049 NDUFAF6Q330K2 333 aa10.34□□□□□ -0.75
CAPNS1-209ENST00000590049 ENTPD8Q5MY95 495 aa10.34□□□□□ -0.75
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
CAPNS1-209ENST00000590049 FNDC7Q5VTL7 733 aa10.34□□□□□ -0.75
CAPNS1-209ENST00000590049 VASNQ6EMK4 673 aa10.34□□□□□ -0.75
CAPNS1-209ENST00000590049 POMZP3Q6PJE2 187 aa10.34□□□□□ -0.75
CAPNS1-209ENST00000590049 APOOLQ6UXV4 268 aa10.34□□□□□ -0.75
CAPNS1-209ENST00000590049 PQLC1Q8N2U9 271 aa10.34□□□□□ -0.75
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CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF597Q96LX8 424 aa10.34□□□□□ -0.75
CAPNS1-209ENST00000590049 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa10.34□□□□□ -0.75
CAPNS1-209ENST00000590049 ANGPTL4Q9BY76 406 aa10.34□□□□□ -0.75
CAPNS1-209ENST00000590049 RASSF4Q9H2L5 321 aa10.34□□□□□ -0.75
CAPNS1-209ENST00000590049 NDUFAF4Q9P032 175 aa10.34□□□□□ -0.75
CAPNS1-209ENST00000590049 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
CAPNS1-209ENST00000590049 PRDM4Q9UKN5 801 aa10.34□□□□□ -0.75
CAPNS1-209ENST00000590049 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
CAPNS1-209ENST00000590049 TMCC3Q9ULS5 477 aa10.34□□□□□ -0.75
CAPNS1-209ENST00000590049 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
CAPNS1-209ENST00000590049 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
CAPNS1-209ENST00000590049 ROS1P08922 2347 aa10.33□□□□□ -0.76
CAPNS1-209ENST00000590049 C2orf72A6NCS6 295 aa10.33□□□□□ -0.76
CAPNS1-209ENST00000590049 TMEM229AB2RXF0 380 aa10.33□□□□□ -0.76
CAPNS1-209ENST00000590049 H3BNX3 289 aa10.33□□□□□ -0.76
CAPNS1-209ENST00000590049 LINC01387J3KSC0 135 aa10.33□□□□□ -0.76
CAPNS1-209ENST00000590049 TNFRSF11BO00300 401 aa10.33□□□□□ -0.76
CAPNS1-209ENST00000590049 GNB5O14775 395 aa10.33□□□□□ -0.76
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CAPNS1-209ENST00000590049 GADD45GO95257 159 aa10.33□□□□□ -0.76
CAPNS1-209ENST00000590049 EPPINO95925 133 aa10.33□□□□□ -0.76
CAPNS1-209ENST00000590049 H1F0P07305 194 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
CAPNS1-209ENST00000590049 RRM2P31350 389 aa10.33□□□□□ -0.76
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CAPNS1-209ENST00000590049 SKP2Q13309 424 aa10.33□□□□□ -0.76
CAPNS1-209ENST00000590049 GK3PQ14409 553 aa10.33□□□□□ -0.76
CAPNS1-209ENST00000590049 OR1Q1Q15612 314 aa10.33□□□□□ -0.76
CAPNS1-209ENST00000590049 ATP6AP1Q15904 470 aa10.33□□□□□ -0.76
CAPNS1-209ENST00000590049 FGD3Q5JSP0 725 aa10.33□□□□□ -0.76
CAPNS1-209ENST00000590049 WLSQ5T9L3 541 aa10.33□□□□□ -0.76
CAPNS1-209ENST00000590049 BICRALQ6AI39 1079 aa10.33□□□□□ -0.76
CAPNS1-209ENST00000590049 WBP2NLQ6ICG8 309 aa10.33□□□□□ -0.76
CAPNS1-209ENST00000590049 OR5M10Q6IEU7 315 aa10.33□□□□□ -0.76
CAPNS1-209ENST00000590049 SEM1Q6ZVN7 128 aa10.33□□□□□ -0.76
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