RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529163.5

RPL8-208, Transcript of ribosomal protein L8, human

TSL 2

Gene RPL8, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL8-208	ENST00000529163	BOD1	Q96IK1	185 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	TMEM38A	Q9H6F2	299 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	NPHS2	Q9NP85	383 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163		A0A1B0GWA3	101 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	TRIM64B	A6NI03	449 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	THY1	P04216	161 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	FOSL1	P15407	271 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	IDUA	P35475	653 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	SLC35A1	P78382	337 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	CEACAM7	Q14002	265 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	OR7A5	Q15622	319 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	ZNF311	Q5JNZ3	666 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	SHE	Q5VZ18	495 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	CADM2	Q8N3J6	435 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	OR4D11	Q8NGI4	311 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	HSD17B8	Q92506	261 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	APH1A	Q96BI3	265 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	PERP	Q96FX8	193 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	MUS81	Q96NY9	551 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	EMC3	Q9P0I2	261 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	IFT52	Q9Y366	437 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163		A0A1W2PR80	420 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163		A8MVM7	634 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	GPR171	O14626	319 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	EIF1B	O60739	113 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	SMPD2	O60906	423 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	MFN2	O95140	757 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	PNMT	P11086	282 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	CD247	P20963	164 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	MTPN	P58546	118 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	CDK6	Q00534	326 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	LTB	Q06643	244 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	FAP	Q12884	760 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	SCARB2	Q14108	478 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	GNA13	Q14344	377 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	PPA1	Q15181	289 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	REEP3	Q6NUK4	255 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	CASP12	Q6UXS9	341 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	DTX2	Q86UW9	622 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	STK35	Q8TDR2	534 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	PIGT	Q969N2	578 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163		Q96MF0	132 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	CGREF1	Q99674	301 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	YY1AP1	Q9H869	796 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	10.11	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163		A0A0B4J2E0	115 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163		A0A1B0GX12	115 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	TRAF3IP2	O43734	574 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	NDUFS7	O75251	213 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	ZNF432	O94892	652 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	HPR	P00739	348 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	OPN1SW	P03999	348 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	GPI	P06744	558 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	GGT1	P19440	569 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	PTN	P21246	168 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	AQP1	P29972	269 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	SELENOP	P49908	381 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	STK11	Q15831	433 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	NRF1	Q16656	503 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	ZSWIM7	Q19AV6	140 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	TAAR8	Q969N4	342 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	C18orf12	Q96KH6	178 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	ARHGDIG	Q99819	225 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RPL8-208	ENST00000529163	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.7 ms