RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	9.42	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	CA10	Q9NS85	328 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	C1orf109	Q9NX04	203 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	9.42	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	SERINC4	A6NH21	518 aa		9.41	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF716	A6NP11	495 aa		9.41	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM77	I1YAP6	450 aa		9.41	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC28A1	O00337	649 aa		9.41	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	CSTA	P01040	98 aa		9.41	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	9.41	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	CCNA2	P20248	432 aa		9.41	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	HPCAL1	P37235	193 aa		9.41	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	PPOX	P50336	477 aa		9.41	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	CDH15	P55291	814 aa		9.41	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	9.41	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC25A3	Q00325	362 aa		9.41	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	LGALS3BP	Q08380	585 aa		9.41	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR68	Q15743	365 aa		9.41	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		9.41	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	R3HCC1L	Q7Z5L2	792 aa	Known RBP	9.41	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC103	Q8IW40	242 aa		9.41	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		9.41	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	DCAKD	Q8WVC6	231 aa		9.41	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		9.41	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	9.41	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	9.41	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	CCT7	Q99832	543 aa		9.41	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		9.41	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		9.41	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		9.41	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	9.41	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		9.41	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		9.41	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		9.4	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	EXOC1L	A0A1B0GW35	172 aa		9.4	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		9.4	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511		B4DSR2	109 aa		9.4	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM157A	C9JC47	383 aa		9.4	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511		H3BQF6	201 aa		9.4	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRD28	O15084	1053 aa		9.4	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	TBX19	O60806	448 aa		9.4	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	PMS2P2	O95744	297 aa		9.4	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	TACSTD2	P09758	323 aa		9.4	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	MYL2	P10916	166 aa		9.4	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	SDC1	P18827	310 aa		9.4	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	PI3	P19957	117 aa		9.4	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	MPG	P29372	298 aa		9.4	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	RYK	P34925	604 aa		9.4	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	9.4	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	9.4	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	9.4	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	9.4	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	RPL38	P63173	70 aa	Known RBP	9.4	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		9.4	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		9.4	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		9.4	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	C8orf74	Q6P047	294 aa		9.4	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	9.4	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	LCA5	Q86VQ0	697 aa		9.4	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		9.4	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	9.4	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF524	Q96C55	264 aa		9.4	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC126	Q96EE4	140 aa		9.4	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		9.4	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	9.4	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	9.4	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	LAT2	Q9GZY6	243 aa		9.4	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		9.4	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		9.4	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	ACER3	Q9NUN7	267 aa		9.4	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	CHRNA9	Q9UGM1	479 aa		9.4	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		9.4	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		9.4	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	9.39	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		9.39	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM89	A2RUT3	159 aa		9.39	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		9.39	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	CFLAR	O15519	480 aa		9.39	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	DNPH1	O43598	174 aa		9.39	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	PDE5A	O76074	875 aa		9.39	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	CHEK2	O96017	543 aa		9.39	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	UROS	P10746	265 aa		9.39	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	NEFH	P12036	1026 aa		9.39	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	GIF	P27352	417 aa		9.39	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	SOAT1	P35610	550 aa		9.39	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	9.39	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	ASMT	P46597	345 aa		9.39	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC16A1	P53985	500 aa		9.39	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	NAA20	P61599	178 aa		9.39	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	IL1RL1	Q01638	556 aa		9.39	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	SKP2	Q13309	424 aa		9.39	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIP10	Q15642	601 aa		9.39	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	EFNB3	Q15768	340 aa		9.39	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	ADIPOQ	Q15848	244 aa		9.39	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	ZSWIM7	Q19AV6	140 aa		9.39	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	GALNTL6	Q49A17	601 aa		9.39	□□□□□ -0.91
SKAP2-209	ENST00000497511	CLEC6A	Q6EIG7	209 aa		9.39	□□□□□ -0.91

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