RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000211413.9

PRRT1-201, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT1, Length 1,909 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-201ENST00000211413 OPN1LWP04000 364 aa16.87■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 CNR1P21554 472 aa16.87■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 GSSP48637 474 aa16.87■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 CLK1P49759 484 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 TNFSF10P50591 281 aa16.87■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 IFITM3Q01628 133 aa16.87■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 QPRTQ15274 297 aa16.87■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 SLC30A6Q6NXT4 461 aa16.87■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF550Q7Z398 422 aa16.87■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 TMEM255BQ8WV15 326 aa16.87■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 PRRC1Q96M27 445 aa16.87■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 DCSTAMPQ9H295 470 aa16.87■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP16.87■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 ITPR1Q14643 2758 aa16.87■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 SH3D21A4FU49 640 aa16.86■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 LRRC3CA6NJW4 275 aa16.86■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa16.86■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 MPZL2O60487 215 aa16.86■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 WISP2O76076 250 aa16.86■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF766Q5HY98 468 aa16.86■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 SLC25A25Q6KCM7 469 aa16.86■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 IGFL2Q6UWQ7 119 aa16.86■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 PLCZ1Q86YW0 608 aa16.86■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 OR2M7Q8NG81 312 aa16.86■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 OR1J4Q8NGS1 313 aa16.86■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 SLC7A13Q8TCU3 470 aa16.86■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 FRMD6Q96NE9 622 aa16.86■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 PRSS27Q9BQR3 290 aa16.86■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 NEURL2Q9BR09 285 aa16.86■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 MMP27Q9H306 513 aa16.86■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 AMBNQ9NP70 447 aa16.86■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 IMPAD1Q9NX62 359 aa16.86■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 ACAD8Q9UKU7 415 aa16.86■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 A3GALT2U3KPV4 340 aa16.86■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 ZAR1LA6NP61 321 aa16.86■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 PIP5K1CO60331 668 aa16.86■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 H1F0P07305 194 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 STSP08842 583 aa16.86■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 IL11P20809 199 aa16.86■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 FOXO1Q12778 655 aa16.86■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 SNTA1Q13424 505 aa16.86■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 TOMM20Q15388 145 aa16.86■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 PODNL1Q6PEZ8 512 aa16.86■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 STX19Q8N4C7 294 aa16.86■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 OR4K17Q8NGC6 315 aa16.86■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 MCFD2Q8NI22 146 aa16.86■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF559Q9BR84 538 aa16.86■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 TMEM27Q9HBJ8 222 aa16.86■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa16.86■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 FAM166BA8MTA8 275 aa16.85■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 SNPHO15079 494 aa16.85■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 GASTP01350 101 aa16.85■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 GADD45AP24522 165 aa16.85■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 TGFBR1P36897 503 aa16.85■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 PPP5CP53041 499 aa16.85■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 CDC42P60953 191 aa16.85■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 ST3GAL4Q11206 333 aa16.85■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 CBFBQ13951 182 aa16.85■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 LINC00303Q3SY05 128 aa16.85■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 ALG10BQ5I7T1 473 aa16.85■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 TIGD3Q6B0B8 471 aa16.85■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 USP43Q70EL4 1123 aa16.85■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa16.85■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 FADS6Q8N9I5 356 aa16.85■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 AQP11Q8NBQ7 271 aa16.85■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa16.85■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 C3orf49Q96BT1 292 aa16.85■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 SDHAF3Q9NRP4 125 aa16.85■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 MED17Q9NVC6 651 aa16.85■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 TAS2R10Q9NYW0 307 aa16.85■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa16.85■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 A0A0B4J2E0 115 aa16.84■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 A0A1B0GX12 115 aa16.84■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 TRAPPC13A5PLN9 417 aa16.84■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 ANKUB1A6NFN9 424 aa16.84■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 METTL15A6NJ78 407 aa16.84■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 CELA3AP09093 270 aa16.84■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 ADORA3P0DMS8 318 aa16.84■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 POU2F1P14859 743 aa16.84■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 TACR3P29371 465 aa16.84■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 CD40LGP29965 261 aa16.84■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 MEOX1P50221 254 aa16.84■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 NUDT6P53370 316 aa16.84■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 CRISP1P54107 249 aa16.84■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 COPZ1P61923 177 aa16.84■□□□□ 0.29
PRRT1-201ENST00000211413 TMEM81Q6P7N7 255 aa16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.2 ms