RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641145.1

NFIC-211, Transcript of nuclear factor I C, humanhuman

BASIC

Gene NFIC, Length 8,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIC-211ENST00000641145 SLC8A3P57103 927 aa18.38■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa18.38■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 TRAF1Q13077 416 aa18.38■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 KCNK9Q9NPC2 374 aa18.38■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 PDS5BQ9NTI5 1447 aa18.38■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 PSMD6Q15008 389 aa18.38■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 ESPNB1AK53 854 aa18.38■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 ATP11AP98196 1134 aa18.38■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 CEP85LQ5SZL2 805 aa18.38■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 TSPY2A6NKD2 308 aa18.37■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 PPP1R7Q15435 360 aa18.37■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 SULT6B1Q6IMI4 303 aa18.37■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 CHD1LQ86WJ1 897 aa18.37■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa18.37■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 RNF34Q969K3 372 aa18.37■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 SOGA1O94964 1423 aa18.37■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 GOLGA1Q92805 767 aa18.37■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa18.37■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 INPP1P49441 399 aa18.36■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 NACA2Q9H009 215 aa18.36■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 VCXQ9H320 206 aa18.36■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 MVPQ14764 893 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 CCDC25Q86WR0 208 aa18.36■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 FSIP1Q8NA03 581 aa18.36■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 CLUL1Q15846 466 aa18.36■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 CPLX4Q7Z7G2 160 aa18.36■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 FERMT3Q86UX7 667 aa18.36■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa18.36■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 STAT6P42226 847 aa18.36■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 SH2D4BQ5SQS7 431 aa18.36■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa18.36■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa18.36■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa18.36■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 SMIM23A6NLE4 172 aa18.35■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 SAMD15Q9P1V8 674 aa18.35■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 HVCN1Q96D96 273 aa18.35■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 ZSCAN30Q86W11 494 aa18.35■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 MYO15BQ96JP2 1530 aa18.35■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 DIXDC1Q155Q3 683 aa18.34■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 USH1CQ9Y6N9 552 aa18.34■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa18.34■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa18.34■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 RAB11FIP3O75154 756 aa18.34■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 STK10O94804 968 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa18.34■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 CTAGE1Q96RT6 745 aa18.34■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 ITIH3Q06033 890 aa18.34■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 PPP2R5CQ13362 524 aa18.34■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa18.34■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 LPXNO60711 386 aa18.34■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa18.34■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 CTAGE6Q86UF2 777 aa18.34■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 N4BP3O15049 544 aa18.34■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 FAM69CQ0P6D2 419 aa18.34■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 TMEM67Q5HYA8 995 aa18.34■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP18.34■□□□□ 0.534e-8■■□□□ 12.2
NFIC-211ENST00000641145 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP18.33■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 NEDD9Q14511 834 aa18.33■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 KIF1BPQ96EK5 621 aa18.33■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 CEP128Q6ZU80 1094 aa18.33■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 USP25Q9UHP3 1055 aa18.33■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 DAPK3O43293 454 aa18.33■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 GNG11P61952 73 aa18.33■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 ARFGAP3Q9NP61 516 aa18.33■□□□□ 0.53
NFIC-211ENST00000641145 BIN1O00499 593 aa18.33■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 BICDL2A1A5D9 508 aa18.33■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 ATP5DP30049 168 aa18.33■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 RSPH14Q9UHP6 348 aa18.33■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 LDHCP07864 332 aa18.33■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 TXNDC2Q86VQ3 553 aa18.33■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 ST5P78524 1137 aa18.32■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 MUM1L1Q5H9M0 696 aa18.32■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 CTAGE9A4FU28 777 aa18.32■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 TCP11L2Q8N4U5 519 aa18.32■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 BANK1Q8NDB2 785 aa18.32■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 BOLA2Q9H3K6 86 aa18.32■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 ARID5AQ03989 594 aa18.32■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 MICALL1Q8N3F8 863 aa18.32■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 C6orf50Q9HD87 102 aa18.32■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 FYB2Q5VWT5 728 aa18.31■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 ISM2Q6H9L7 571 aa18.31■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
NFIC-211ENST00000641145 GSTO1P78417 241 aa18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.6 ms