RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621489.1

AC245407.1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene AC245407.1, Length 2,538 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC245407.1-201ENST00000621489 CFAP99D6REC4 459 aa6.34□□□□□ -1.39
AC245407.1-201ENST00000621489 FGRP09769 529 aa6.34□□□□□ -1.39
AC245407.1-201ENST00000621489 TCP11L2Q8N4U5 519 aa6.34□□□□□ -1.39
AC245407.1-201ENST00000621489 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
AC245407.1-201ENST00000621489 VTI1BQ9UEU0 232 aa6.34□□□□□ -1.39
AC245407.1-201ENST00000621489 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 FBXO45P0C2W1 286 aa6.33□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 MTMR2Q13614 643 aa6.33□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 TYW1BQ6NUM6 668 aa6.33□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 MORC1Q86VD1 984 aa6.33□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 OGFOD1Q8N543 542 aa6.33□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 PRIMPOLQ96LW4 560 aa6.33□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 RNF19AQ9NV58 838 aa6.33□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 LDHBP07195 334 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 MTMR3Q13615 1198 aa6.33□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa6.33□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 KRBA2Q6ZNG9 492 aa6.33□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 WDR63Q8IWG1 891 aa6.33□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 PREX1Q8TCU6 1659 aa6.33□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 SEPT3Q9UH03 358 aa6.32□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 NOS1P29475 1434 aa6.32□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 ABCC3O15438 1527 aa6.32□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 USP46P62068 366 aa6.32□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 CLDN10P78369 228 aa6.32□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 MVPQ14764 893 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 MAMSTRQ6ZN01 415 aa6.32□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 C8orf48Q96LL4 319 aa6.32□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 FRMD6Q96NE9 622 aa6.32□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 MTA3Q9BTC8 594 aa6.32□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 ADGRB1O14514 1584 aa6.32□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 PSMD2Q13200 908 aa6.31□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 SERINC3Q13530 473 aa6.31□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 CNPY4Q8N129 248 aa6.31□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 STRCQ7RTU9 1775 aa6.31□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa6.31□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 DKK1O94907 266 aa6.31□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 MCM4P33991 863 aa6.31□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 EVA1CP58658 441 aa6.31□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 RACK1P63244 317 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 VPS37DQ86XT2 251 aa6.31□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 ZNF654Q8IZM8 581 aa6.31□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 TMX1Q9H3N1 280 aa6.31□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa6.31□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 COMMD10Q9Y6G5 202 aa6.31□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 LMTK2Q8IWU2 1503 aa6.3□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 FSD2A1L4K1 749 aa6.3□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 MTHFSP49914 203 aa6.3□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 KCNH2Q12809 1159 aa6.3□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 DSC3Q14574 896 aa6.3□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 ODR4Q5SWX8 454 aa6.3□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 MKL1Q969V6 931 aa6.3□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 SCYL1Q96KG9 808 aa6.3□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 CFAP53Q96M91 514 aa6.3□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 C22orf23Q9BZE7 217 aa6.3□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa6.3□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 TRPC6Q9Y210 931 aa6.3□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa6.3□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 TULP4Q9NRJ4 1543 aa6.3□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 ZBBXA8MT70 800 aa6.3□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 UBE4AQ14139 1066 aa6.3□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 ZNF394Q53GI3 561 aa6.3□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa6.3□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 CHMP5Q9NZZ3 219 aa6.3□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 TRAK1Q9UPV9 953 aa6.3□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa6.3□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 GUCA2AQ02747 115 aa6.29□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 NBPF6Q5VWK0 638 aa6.29□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 NBPF4Q96M43 638 aa6.29□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 EYA1Q99502 592 aa6.29□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 SENP7Q9BQF6 1050 aa6.29□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 PANK2Q9BZ23 570 aa6.29□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 PRKD2Q9BZL6 878 aa6.29□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa6.29□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 NSD2O96028 1365 aa6.29□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 MCCP23508 829 aa6.29□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 PLPP7Q8NBV4 271 aa6.29□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 NPATQ14207 1427 aa6.28□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa6.28□□□□□ -1.4
AC245407.1-201ENST00000621489 CCDC189A1A4V9 331 aa6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms