RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617119.4

UBE2V1-223, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 V1, human

TSL 4 BASIC

Gene UBE2V1, Length 2,432 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE2V1-223	ENST00000617119	REST	Q13127	1097 aa		10.39	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	TRIM5	Q9C035	493 aa		10.39	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		10.39	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	CHGB	P05060	677 aa		10.39	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	TNNT1	P13805	278 aa		10.39	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	IQCB1	Q15051	598 aa		10.39	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	DDX11	Q96FC9	970 aa		10.39	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		10.39	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		10.39	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	ZBTB22	O15209	634 aa		10.38	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	ZNF165	P49910	485 aa		10.38	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	DRC7	Q8IY82	874 aa		10.38	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	SUCLG2	Q96I99	432 aa		10.38	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	10.38	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	ERBB3	P21860	1342 aa		10.38	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	10.38	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	KCNJ4	P48050	445 aa		10.38	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		10.38	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		10.38	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	NBPF4	Q96M43	638 aa		10.38	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		10.38	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	PXDN	Q92626	1479 aa		10.38	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	VGLL3	A8MV65	326 aa		10.37	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	HOXB7	P09629	217 aa		10.37	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	ADRA2B	P18089	450 aa		10.37	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	10.37	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	10.37	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		10.37	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	10.37	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		10.37	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	MRC1	P22897	1456 aa		10.37	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	PDC	P20941	246 aa		10.37	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	BRF1	Q92994	677 aa		10.37	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		10.37	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	10.37	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	NFAT5	O94916	1531 aa		10.37	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	CCDC66	A2RUB6	948 aa		10.36	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	TAF5L	O75529	589 aa		10.36	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	10.36	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	PSMA5	P28066	241 aa		10.36	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	CDC25B	P30305	580 aa		10.36	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	TERF2	Q15554	542 aa		10.36	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	GTF3C6	Q969F1	213 aa		10.36	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	GPATCH3	Q96I76	525 aa		10.36	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	USP16	Q9Y5T5	823 aa		10.36	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	ALDH1L1	O75891	902 aa		10.36	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	SLC20A2	Q08357	652 aa		10.36	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		10.36	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		10.36	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	BICD2	Q8TD16	824 aa		10.36	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	FSD1	Q9BTV5	496 aa		10.36	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	SIL1	Q9H173	461 aa		10.36	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		10.36	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	SLIT1	O75093	1534 aa		10.36	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		10.35	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	CCZ1B	P86790	482 aa		10.35	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		10.35	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		10.35	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		10.35	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		10.35	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	KIF18A	Q8NI77	898 aa		10.35	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		10.35	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	C5	P01031	1676 aa		10.35	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	BTBD11	A6QL63	1104 aa		10.35	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	ANKRD1	Q15327	319 aa		10.35	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	CEP135	Q66GS9	1140 aa		10.35	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	SARM1	Q6SZW1	724 aa		10.35	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	KSR2	Q6VAB6	950 aa		10.35	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		10.35	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		10.35	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	10.35	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	UTY	O14607	1347 aa		10.35	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	ZNF609	O15014	1411 aa		10.34	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		10.34	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		10.34	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	ABTB2	Q8N961	1025 aa		10.34	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	ZNF592	Q92610	1267 aa		10.34	□□□□□ -0.75
UBE2V1-223	ENST00000617119	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75

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