RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557413.5

RPS6KL1-216, Transcript of ribosomal protein S6 kinase like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RPS6KL1, Length 2,425 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1-216ENST00000557413 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.51
RPS6KL1-216ENST00000557413 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa24.45■■□□□ 1.5
RPS6KL1-216ENST00000557413 KLHDC4Q8TBB5 520 aa24.44■■□□□ 1.5
RPS6KL1-216ENST00000557413 BCL2L12Q9HB09 334 aa24.44■■□□□ 1.5
RPS6KL1-216ENST00000557413 CBX8Q9HC52 389 aa24.44■■□□□ 1.5
RPS6KL1-216ENST00000557413 JCADQ9P266 1359 aa24.44■■□□□ 1.5
RPS6KL1-216ENST00000557413 PSME1Q06323 249 aa24.44■■□□□ 1.5
RPS6KL1-216ENST00000557413 TSGA10IPQ3SY00 556 aa24.44■■□□□ 1.5
RPS6KL1-216ENST00000557413 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP24.43■■□□□ 1.5
RPS6KL1-216ENST00000557413 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
RPS6KL1-216ENST00000557413 CLSTN2Q9H4D0 955 aa24.43■■□□□ 1.5
RPS6KL1-216ENST00000557413 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
RPS6KL1-216ENST00000557413 TAF5LO75529 589 aa24.42■■□□□ 1.5
RPS6KL1-216ENST00000557413 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
RPS6KL1-216ENST00000557413 IGKV5-2P06315 115 aa24.42■■□□□ 1.5
RPS6KL1-216ENST00000557413 CCDC186Q7Z3E2 898 aa24.41■■□□□ 1.5
RPS6KL1-216ENST00000557413 RIC3Q7Z5B4 369 aa24.41■■□□□ 1.5
RPS6KL1-216ENST00000557413 NR1I2O75469 434 aa24.41■■□□□ 1.5
RPS6KL1-216ENST00000557413 DRC7Q8IY82 874 aa24.41■■□□□ 1.5
RPS6KL1-216ENST00000557413 BICD2Q8TD16 824 aa24.41■■□□□ 1.5
RPS6KL1-216ENST00000557413 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
RPS6KL1-216ENST00000557413 PRDM4Q9UKN5 801 aa24.41■■□□□ 1.5
RPS6KL1-216ENST00000557413 KRT32Q14532 448 aa24.4■■□□□ 1.5
RPS6KL1-216ENST00000557413 TRIM5Q9C035 493 aa24.4■■□□□ 1.5
RPS6KL1-216ENST00000557413 PDIA6Q15084 440 aa24.4■■□□□ 1.5
RPS6KL1-216ENST00000557413 ESCO1Q5FWF5 840 aa24.4■■□□□ 1.5
RPS6KL1-216ENST00000557413 GTF3C6Q969F1 213 aa24.4■■□□□ 1.5
RPS6KL1-216ENST00000557413 JAK2O60674 1132 aa24.39■■□□□ 1.5
RPS6KL1-216ENST00000557413 USPL1Q5W0Q7 1092 aa24.39■■□□□ 1.5
RPS6KL1-216ENST00000557413 PGBD1Q96JS3 809 aa24.39■■□□□ 1.5
RPS6KL1-216ENST00000557413 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
RPS6KL1-216ENST00000557413 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
RPS6KL1-216ENST00000557413 MRC1P22897 1456 aa24.38■■□□□ 1.49
RPS6KL1-216ENST00000557413 ZNF75DP51815 510 aa24.38■■□□□ 1.49
RPS6KL1-216ENST00000557413 NEXNQ0ZGT2 675 aa24.38■■□□□ 1.49
RPS6KL1-216ENST00000557413 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa24.38■■□□□ 1.49
RPS6KL1-216ENST00000557413 PLA2G4DQ86XP0 818 aa24.38■■□□□ 1.49
RPS6KL1-216ENST00000557413 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
RPS6KL1-216ENST00000557413 NEK1Q96PY6 1258 aa24.38■■□□□ 1.49
RPS6KL1-216ENST00000557413 ZNF165P49910 485 aa24.37■■□□□ 1.49
RPS6KL1-216ENST00000557413 PRDM10Q9NQV6 1147 aa24.37■■□□□ 1.49
RPS6KL1-216ENST00000557413 NRBP1Q9UHY1 535 aa24.37■■□□□ 1.49
RPS6KL1-216ENST00000557413 NEURL1BA8MQ27 555 aa24.37■■□□□ 1.49
RPS6KL1-216ENST00000557413 LRMPQ12912 555 aa24.37■■□□□ 1.49
RPS6KL1-216ENST00000557413 BRF1Q92994 677 aa24.37■■□□□ 1.49
RPS6KL1-216ENST00000557413 COL15A1P39059 1388 aa24.37■■□□□ 1.49
RPS6KL1-216ENST00000557413 RESTQ13127 1097 aa24.36■■□□□ 1.49
RPS6KL1-216ENST00000557413 EPHA10Q5JZY3 1008 aa24.36■■□□□ 1.49
RPS6KL1-216ENST00000557413 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
RPS6KL1-216ENST00000557413 ANKRD24Q8TF21 1146 aa24.36■■□□□ 1.49
RPS6KL1-216ENST00000557413 DNAJC25Q9H1X3 360 aa24.36■■□□□ 1.49
RPS6KL1-216ENST00000557413 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.36■■□□□ 1.49
RPS6KL1-216ENST00000557413 H3BQV1 296 aa24.36■■□□□ 1.49
RPS6KL1-216ENST00000557413 GCP02774 474 aa24.36■■□□□ 1.49
RPS6KL1-216ENST00000557413 GCKRQ14397 625 aa24.36■■□□□ 1.49
RPS6KL1-216ENST00000557413 IFFO2Q5TF58 517 aa24.36■■□□□ 1.49
RPS6KL1-216ENST00000557413 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
RPS6KL1-216ENST00000557413 ATP5JP18859 108 aa24.35■■□□□ 1.49
RPS6KL1-216ENST00000557413 Q6ZUG5 572 aa24.35■■□□□ 1.49
RPS6KL1-216ENST00000557413 ARHGEF25Q86VW2 580 aa24.35■■□□□ 1.49
RPS6KL1-216ENST00000557413 MYL6BP14649 208 aa24.35■■□□□ 1.49
RPS6KL1-216ENST00000557413 PDCL2Q8N4E4 241 aa24.35■■□□□ 1.49
RPS6KL1-216ENST00000557413 DDX11Q96FC9 970 aa24.35■■□□□ 1.49
RPS6KL1-216ENST00000557413 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
RPS6KL1-216ENST00000557413 CTIFO43310 598 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
RPS6KL1-216ENST00000557413 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa24.34■■□□□ 1.49
RPS6KL1-216ENST00000557413 MYD88Q99836 296 aa24.33■■□□□ 1.49
RPS6KL1-216ENST00000557413 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
RPS6KL1-216ENST00000557413 CFAP45Q9UL16 551 aa24.33■■□□□ 1.49
RPS6KL1-216ENST00000557413 CBX1P83916 185 aa24.33■■□□□ 1.48
RPS6KL1-216ENST00000557413 ANKRD7Q92527 254 aa24.33■■□□□ 1.48
RPS6KL1-216ENST00000557413 COPRSQ9NQ92 184 aa24.33■■□□□ 1.48
RPS6KL1-216ENST00000557413 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa24.33■■□□□ 1.48
RPS6KL1-216ENST00000557413 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.48
RPS6KL1-216ENST00000557413 TNNI3KQ59H18 835 aa24.32■■□□□ 1.48
RPS6KL1-216ENST00000557413 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa24.32■■□□□ 1.48
RPS6KL1-216ENST00000557413 XAGE3Q8WTP9 111 aa24.32■■□□□ 1.48
RPS6KL1-216ENST00000557413 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
RPS6KL1-216ENST00000557413 CLIP2Q9UDT6 1046 aa24.32■■□□□ 1.48
RPS6KL1-216ENST00000557413 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa24.32■■□□□ 1.48
RPS6KL1-216ENST00000557413 CAVIN2O95810 425 aa24.32■■□□□ 1.48
RPS6KL1-216ENST00000557413 SLC39A6Q13433 755 aa24.32■■□□□ 1.48
RPS6KL1-216ENST00000557413 ZNF609O15014 1411 aa24.31■■□□□ 1.48
RPS6KL1-216ENST00000557413 CYP21A2P08686 494 aa24.31■■□□□ 1.48
RPS6KL1-216ENST00000557413 TFCP2Q12800 502 aa24.31■■□□□ 1.48
RPS6KL1-216ENST00000557413 ATP2B3Q16720 1220 aa24.31■■□□□ 1.48
RPS6KL1-216ENST00000557413 ZNF790Q6PG37 636 aa24.31■■□□□ 1.48
RPS6KL1-216ENST00000557413 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
RPS6KL1-216ENST00000557413 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
RPS6KL1-216ENST00000557413 CHGBP05060 677 aa24.31■■□□□ 1.48
RPS6KL1-216ENST00000557413 COPS6Q7L5N1 327 aa24.31■■□□□ 1.48
RPS6KL1-216ENST00000557413 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
RPS6KL1-216ENST00000557413 SCRN1Q12765 414 aa24.3■■□□□ 1.48
RPS6KL1-216ENST00000557413 C5P01031 1676 aa24.3■■□□□ 1.48
RPS6KL1-216ENST00000557413 FGD1P98174 961 aa24.3■■□□□ 1.48
RPS6KL1-216ENST00000557413 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
RPS6KL1-216ENST00000557413 RFX7Q2KHR2 1363 aa24.29■■□□□ 1.48
RPS6KL1-216ENST00000557413 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
RPS6KL1-216ENST00000557413 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa24.29■■□□□ 1.48
RPS6KL1-216ENST00000557413 LRRC2Q9BYS8 371 aa24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms