RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552958.5

AC004801.5-201, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene AC004801.5, Length 550 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC004801.5-201ENST00000552958 ISCA1Q9BUE6 129 aa12.06□□□□□ -0.48
AC004801.5-201ENST00000552958 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
AC004801.5-201ENST00000552958 CNTNAP1P78357 1384 aa12.05□□□□□ -0.48
AC004801.5-201ENST00000552958 SHTN1A0MZ66 631 aa12.05□□□□□ -0.48
AC004801.5-201ENST00000552958 TMEM88BA6NKF7 163 aa12.05□□□□□ -0.48
AC004801.5-201ENST00000552958 TRAF5O00463 557 aa12.05□□□□□ -0.48
AC004801.5-201ENST00000552958 BBOX1O75936 387 aa12.05□□□□□ -0.48
AC004801.5-201ENST00000552958 RAD17O75943 681 aa12.05□□□□□ -0.48
AC004801.5-201ENST00000552958 ZNF853P0CG23 659 aa12.05□□□□□ -0.48
AC004801.5-201ENST00000552958 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
AC004801.5-201ENST00000552958 VEGFBP49765 207 aa12.05□□□□□ -0.48
AC004801.5-201ENST00000552958 GRAPQ13588 217 aa12.05□□□□□ -0.48
AC004801.5-201ENST00000552958 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
AC004801.5-201ENST00000552958 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
AC004801.5-201ENST00000552958 TNS4Q8IZW8 715 aa12.05□□□□□ -0.48
AC004801.5-201ENST00000552958 MPNDQ8N594 471 aa12.05□□□□□ -0.48
AC004801.5-201ENST00000552958 C8orf58Q8NAV2 365 aa12.05□□□□□ -0.48
AC004801.5-201ENST00000552958 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
AC004801.5-201ENST00000552958 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
AC004801.5-201ENST00000552958 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
AC004801.5-201ENST00000552958 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
AC004801.5-201ENST00000552958 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
AC004801.5-201ENST00000552958 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
AC004801.5-201ENST00000552958 ZNRF3Q9ULT6 936 aa12.04□□□□□ -0.48
AC004801.5-201ENST00000552958 YDJCA8MPS7 323 aa12.03□□□□□ -0.48
AC004801.5-201ENST00000552958 RIMBP2O15034 1052 aa12.03□□□□□ -0.48
AC004801.5-201ENST00000552958 FOXN1O15353 648 aa12.03□□□□□ -0.48
AC004801.5-201ENST00000552958 HOXB7P09629 217 aa12.03□□□□□ -0.48
AC004801.5-201ENST00000552958 GRIPAP1Q4V328 841 aa12.03□□□□□ -0.48
AC004801.5-201ENST00000552958 RIC3Q7Z5B4 369 aa12.03□□□□□ -0.48
AC004801.5-201ENST00000552958 TSPYL6Q8N831 410 aa12.03□□□□□ -0.48
AC004801.5-201ENST00000552958 MYD88Q99836 296 aa12.03□□□□□ -0.48
AC004801.5-201ENST00000552958 HYPKQ9NX55 129 aa12.03□□□□□ -0.48
AC004801.5-201ENST00000552958 GPRC5DQ9NZD1 345 aa12.03□□□□□ -0.48
AC004801.5-201ENST00000552958 DUOX1Q9NRD9 1551 aa12.03□□□□□ -0.48
AC004801.5-201ENST00000552958 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 GPSM2P81274 684 aa12.02□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 KIAA2012Q0VF49 1180 aa12.02□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 GRM1Q13255 1194 aa12.02□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 DLK2Q6UY11 383 aa12.02□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 SUPT20HQ8NEM7 779 aa12.02□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 SEC31BQ9NQW1 1179 aa12.02□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 KCNQ5Q9NR82 932 aa12.02□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 IFT57Q9NWB7 429 aa12.02□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 GNAI1P63096 354 aa12.01□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 DOK7Q18PE1 504 aa12.01□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 DEFB115Q30KQ5 88 aa12.01□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 CST9Q5W186 159 aa12.01□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 CIAPIN1Q6FI81 312 aa12.01□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 DBNDD1Q9H9R9 158 aa12.01□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 POLLQ9UGP5 575 aa12.01□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 C6orf229H3BNL8 230 aa12□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 CCER2I3L3R5 266 aa12□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 GOLGA2Q08379 1002 aa12□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 TRPM4Q8TD43 1214 aa12□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 BCL2L13Q9BXK5 485 aa12□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 RASSF10A6NK89 507 aa11.99□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 VPS33BQ9H267 617 aa11.99□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 LRRC37AA6NMS7 1700 aa11.99□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 PSMD14O00487 310 aa11.98□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 EGFRP00533 1210 aa11.98□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 RPS8P62241 208 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 WASHC4Q2M389 1173 aa11.98□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 CYP4F22Q6NT55 531 aa11.98□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 G2E3Q7L622 706 aa11.98□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 SAMD7Q7Z3H4 446 aa11.98□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 FAM9BQ8IZU0 186 aa11.98□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 ZNF408Q9H9D4 720 aa11.98□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa11.98□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 LBX1P52954 281 aa11.97□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 TNIP1Q15025 636 aa11.97□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 MICALL2Q8IY33 904 aa11.97□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 MIER1Q8N108 512 aa11.97□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 TBC1D16Q8TBP0 767 aa11.97□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 WBP1LQ9NX94 342 aa11.97□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 RTL9Q8NET4 1388 aa11.96□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 ECE2O60344 883 aa11.96□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 AOC2O75106 756 aa11.96□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 CELF2O95319 508 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
AC004801.5-201ENST00000552958 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.3 ms